- 氫鍵:分子識別與自組裝
- 黎占亭 張丹維編著
- 900字
- 2020-04-29 18:04:42
1.8 氫鍵的研究方法
有關(guān)氫鍵的結(jié)構(gòu)、能量以及動力學(xué)研究始終是實驗和理論研究的重要內(nèi)容[6,10,11,23]。核磁共振(NMR)和紅外(IR)技術(shù)是研究分析氫鍵的常規(guī)實驗技術(shù)。質(zhì)子在形成氫鍵后其位移會向低場移動,而形成氫鍵的分子的振動模式也會發(fā)生變化,從而驗證氫鍵的形成。在液相和固相中,氫鍵的形成會受溶劑及周圍其它分子的影響或干擾。在氣相中,這些影響得以避免,所得實驗結(jié)果可以和量子化學(xué)計算相互比較。近年來,激光技術(shù)發(fā)展迅速,使得化學(xué)家能夠利用超聲束形成研究體積和質(zhì)量選擇性的分子簇合物,為研究小分子形成的氫鍵提供了新的方法[24]。這一技術(shù)也可與高分辨紅外和紫外光譜結(jié)合,為更深入地揭示氫鍵的結(jié)構(gòu)特征和動力學(xué)提供了可能[24,25]。有關(guān)水簇(water cluster)和質(zhì)子化水簇的研究即是這些新技術(shù)應(yīng)用的突出的例子[26,27]。對H3O+-(H2O)n質(zhì)子水簇的紅外光譜研究清晰地揭示出,小體積的簇可以通過氫鍵形成二維網(wǎng)絡(luò),而大的簇(n≥21)則形成納米尺度的氫鍵籠[26]。
理論計算也廣泛應(yīng)用于氫鍵研究[28]。由于計算中使用的基組(basic set)對計算的鍵長、鍵角、電子性質(zhì)、作用能和振動光譜等都有重要影響,不同的方法和基組結(jié)合在一起進(jìn)行計算,有助于找到更可靠的方法,從而獲得更為可靠的幾何參數(shù)和能量值[29]。
晶體結(jié)構(gòu)分析技術(shù)提供了更直接的研究氫鍵的手段。低溫技術(shù)的廣泛應(yīng)用,程序化的數(shù)據(jù)分析處理軟件,以及衍射儀器的不斷改進(jìn),使得X射線衍射分析的應(yīng)用快速普及,已經(jīng)成為幾乎所有實驗室都能利用的研究氫鍵和開展結(jié)構(gòu)鑒定的常規(guī)手段。中子衍射分析的應(yīng)用也越來越廣泛。
對于弱氫鍵,衍射分析更為重要,因為光譜方法在很多情況下檢測不到弱氫鍵的存在。大量同類晶體數(shù)據(jù)的統(tǒng)計處理也是研究氫鍵的重要手段,不但能提供強(qiáng)弱氫鍵的d和θ等參數(shù)的分布規(guī)律,也能分析晶體中的超分子模式及網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)等[30-32]。目前國際上有很多晶體數(shù)據(jù)庫,如“the Cambridge Structural Database (CSD)”,“the Protein Data Bank (PDB)”,“the Nucleic Acids Data Bank (NDB)”及“the Inorganic Crystal Structure Database (ICSD)”等。對于超分子化學(xué)研究,CSD數(shù)據(jù)庫可能最重要,它收集了最多的單個分子和配合物的晶體結(jié)構(gòu)。另一個開放數(shù)據(jù)庫“Crystallography Open Database (COD)”也很有用,提供了很多有機(jī)、無機(jī)及配合物分子的晶體結(jié)構(gòu)。