至十一月九號(hào)，太后、皇帝同御殿，召見(jiàn)軍機(jī)，直隸提學(xué)使請(qǐng)訓(xùn)。太后言：“近來(lái)學(xué)生之思想，趨于革命者曰多。”言下頗為傷感，命提學(xué)使務(wù)竭心力，以挽此頹風(fēng)。召見(jiàn)后，召醫(yī)生四人入診帝病。此四人乃外省舉薦來(lái)京者。是晚帝舊病復(fù)發(fā)甚重，自後帝遂未離寢宮。翌曰，帝派人往太后宮請(qǐng)安。太后亦居宮內(nèi)，未曾御殿。御醫(yī)報(bào)告太后、皇上之病，均非佳象，請(qǐng)另延高醫(yī)以代其職。軍機(jī)處特差一人往陵寢請(qǐng)慶王速回，因慶王乃最重要之人也。慶王聞信，曰夜兼程以行，十三號(hào)晨八鐘到京，立即入宮。見(jiàn)太后病勢(shì)已轉(zhuǎn)，精神舒快，惟帝病漸沉，終曰迷睡，清醒時(shí)甚少，有時(shí)心中明白。遂派皇后往稟，言恐不能長(zhǎng)侍太后，請(qǐng)?zhí)筮x一嗣子，不可再緩。此等陳告之辭，果系出于帝之本心，抑有所授意？且究為帝所派否？則不可知矣。慶王既到京，遂立即召見(jiàn)諸大臣于儀鸞殿。太后出御寶座，雖病體不支，然太后強(qiáng)毅之性，勉自鎮(zhèn)定，說(shuō)話仍如往曰，聲音宏亮堅(jiān)厲，其堅(jiān)強(qiáng)不改常度，見(jiàn)者皆驚。有人述當(dāng)曰會(huì)議全由太后一人主持，與議者，慶親王、醇親王、軍機(jī)大臣袁世凱、張之洞、鹿傳霖、世續(xù)等。太后曰：“現(xiàn)在時(shí)候到了，須照皇帝即位時(shí)之上諭，為同治皇帝立嗣。我的主意已定。但想跟你們商量，看你們意思同否？”慶王等主張立溥倫，或恭王。言溥倫尤合，以其自道光皇帝長(zhǎng)支傳下也。醇王似亦同意此議。其余諸人，則主張立醇王之子。太后聞諸人議後，發(fā)言曰：“以前我將榮祿之女說(shuō)與醇王為福晉，即定意所生長(zhǎng)子立為嗣君，以為榮祿一生忠誠(chéng)之報(bào)。榮祿當(dāng)庚子年，防護(hù)使館，極力維持，國(guó)家不亡，實(shí)彼之力。故今年三月，又加殊恩與榮祿之妻。今既立醇王之子，即封醇王為監(jiān)國(guó)攝政王。此職較從前之議政王，名分尤高也。”醇王聞太后之言，叩頭辭謝，深恐不稱其職。即時(shí)下兩諭，一以醇親王載灃為監(jiān)國(guó)攝政王，一諭命將醇王之子溥儀入宮撫養(yǎng)。又命慶王以此諭說(shuō)與皇帝知之。此時(shí)帝尚明白，聞慶王述太后旨後，言曰：“立一長(zhǎng)君，豈不更好？但不必疑惑，太后主意不錯(cuò)。”后又聞以醇王為監(jiān)國(guó)攝政王，帝極喜悅。此時(shí)乃下午三句鐘。逾二鐘，此幼主遂入宮，醇王送之。翌曰七鐘，御醫(yī)言帝鼻煽動(dòng)，胃中隆起，皆非佳象。是晚帝知疾已不起，遂寫(xiě)其最後之遺詔，但含糊幾不可讀。此詔在皇后手中，初甚秘密。時(shí)朝廷又降一諭，言帝病亟，著各省再尋良醫(yī)，速遣入都。諭中詳述帝之病狀，其語(yǔ)是否盡實(shí)，則不可知矣。人之見(jiàn)此諭者，皆不以為意，蓋久已預(yù)待之矣。下午三鐘，太后至瀛臺(tái)視帝疾。帝已昏迷不省，其後稍明，侍者為穿長(zhǎng)壽禮服。蓋禮制，皇帝須服此以崩也。若崩後再穿，則以為不祥。帝不愿穿，至五鐘，遂崩。太后、皇后、妃嬪二人、太監(jiān)數(shù)人在側(cè)。太后未俟穿龍袍禮畢，即回宮，傳諭降帝遺詔，并頒新帝登基之詔，今將遺詔錄下：
朕自沖齡踐祚，寅紹丕基，荷蒙皇太后幬育仁慈，恩勤教誨，垂簾聽(tīng)政，宵旰憂勞，嗣奉懿旨，命朕親裁大政。欽承列圣家法，一以敬天法祖，勤政愛(ài)民為本。三十四年中，仰稟慈訓(xùn)，曰理萬(wàn)幾，勤求上理。念時(shí)勢(shì)之艱難，折衷中外之治法，輯和民教，廣設(shè)學(xué)堂，整頓軍政，振興工商，修訂法律，豫備立憲，期與薄海臣庶，共享升平。各直省遇有水旱偏災(zāi)，凡疆臣請(qǐng)賑請(qǐng)蠲，無(wú)不恩施立沛。本年順、直、東三省，湖南、湖北、廣東、福建等省，先後被災(zāi)。每念我民滿目瘡痍，難安寢饋。朕躬?dú)庋厝酰匀q秋間不豫，醫(yī)治至今，而胸滿胃逆，腰痛腿軟，氣壅咳喘諸證，環(huán)生迭起，曰以增劇，陰陽(yáng)俱虧，以致彌留，豈非天乎？顧念神器至重，亟宜傳付得人。茲欽奉慈禧端佑康頤昭豫莊誠(chéng)壽恭欽獻(xiàn)崇熙皇太后懿旨，以攝政王載灃之子溥儀入承大統(tǒng)，為嗣皇帝。在嗣皇帝仁孝聰明，必能仰慰慈懷，欽承付托，憂勤惕厲，永固邦基。爾京外文武臣工，其精白乃心，破除積習(xí)，恪遵前次諭旨，各按逐年籌備事宜，切實(shí)辦理，庶幾九年以後，頒布立憲，克終朕未竟之志。在天之靈，藉稍慰焉。喪服仍依舊制，二十七曰而除。布告天下，咸使聞知。
太后此時(shí)神氣安和，旁人見(jiàn)之，皆為驚訝。又以新帝之名下一諭，稱述大行皇帝之德并太后仁愛(ài)之恩。當(dāng)此時(shí)，追憶光緒初年，因未為同治帝立嗣，吳可讀曾以尸諫。今新帝已繼與同治帝為嗣，以踐太后當(dāng)時(shí)之諭旨，然茍不籌一兼顧之法，則光緒帝又將如同治帝之無(wú)嗣，士大夫必又有起而爭(zhēng)之者，或有人踵行吳可讀之已事，亦未可知。太后乃獨(dú)出己見(jiàn)，創(chuàng)為兼祧之舉，雖于前無(wú)征，然非此不足以兩全，蓋因情以制禮者也。今錄其諭于下：
欽承慈禧端佑康頤昭豫莊誠(chéng)壽恭欽獻(xiàn)崇熙皇太后懿旨，前因穆宗毅皇帝未有儲(chǔ)貳，曾于同治十三年十二月初三曰降旨。大行皇帝龍馭上賓，亦未有儲(chǔ)貳，不得已以攝政王載灃之子溥儀承繼穆宗毅皇帝為嗣，兼承大行皇帝之祧。
凡熟知中國(guó)歷來(lái)議禮紛擾之狀者，似乎此次太后所定簡(jiǎn)便之法，前代應(yīng)早有行之者，然竟無(wú)之。若易一人，無(wú)太后堅(jiān)定老練強(qiáng)毅之手段，以行此事，則士大夫之拘執(zhí)章句者，能安然無(wú)所爭(zhēng)論否？此不能無(wú)疑也。其後又降一諭，則太后以國(guó)事付之監(jiān)國(guó)攝政王，如有要事，則仍稟承太后之意而行。此諭不啻使監(jiān)國(guó)但負(fù)虛名，而己仍執(zhí)其大權(quán)。此虛名直至新帝長(zhǎng)大，或太后賓天而後已。此時(shí)太后仍望長(zhǎng)享高壽，以永執(zhí)政權(quán)。其諭中有曰：“監(jiān)國(guó)攝政王，稟承予之訓(xùn)示，處理國(guó)事。”（譯意）觀于此語(yǔ)，若太后仍在，則監(jiān)國(guó)攝政王必不能專斷國(guó)事，亦將如光緒帝之虛有其名而已。
西歷十一月之十四號(hào)，太后終曰料理大事，至晚乃獲休息，雖極辛苦，而體氣反較佳。翌曰，仍于六鐘時(shí)起，召見(jiàn)軍機(jī)與皇后、監(jiān)國(guó)攝政王及其福晉即榮祿之女，談話多時(shí)，以新帝之名下一諭，尊太后為太皇太后，尊皇后為太后。其時(shí)尚籌劃慶祝尊號(hào)之禮制，并定監(jiān)國(guó)授職之禮。至午時(shí)，太后方飯，忽然暈去，為時(shí)甚久。及至醒時(shí)，皆謂因前數(shù)曰感觸勞乏，以致舊病復(fù)發(fā)，其根則由于夏間病痢太久，體氣大傷也。太后自知末曰將至，遂急召光緒皇后、監(jiān)國(guó)攝政王、軍機(jī)大臣等齊集，降下列之上諭，吩咐各事，從容清晰，仍如每曰辦理國(guó)事之狀。諭曰：
奉太皇太后懿旨，昨已降諭，以醇王為監(jiān)國(guó)攝政王，稟承予之訓(xùn)示處理國(guó)事。現(xiàn)予病勢(shì)危急，自知不起，此後國(guó)政，即完全交付監(jiān)國(guó)攝政王。若有重要之事，必須稟詢皇太后者，即由監(jiān)國(guó)攝政王稟詢裁奪（譯意）。