阿米巴組織設計，必須以阿米巴經營理念為指導，拋開傳統的行政組織架構，重構以自主經營為導向的新組織架構。每個阿米巴單元，為目標負責，為利潤負責，這樣就可以釋放組織活力。在新形勢下，傳統行政組織需要更新升級，阿米巴是組織升級的方向。阿米巴組織經過“責任田”（以后統稱阿米巴）劃分，巴長享有充分的權利，同時承擔相應的責任，巴長就搖身一變，從被動的受管理者，轉身為主動的經營者。做個比喻：傳統行政組織架構，好比是火車，火車跑的快，全憑車頭帶，車頭的動力決定火車的方向和速度。阿米巴組織形態，好比是高鐵，每一節車廂都有動力，帶動整個車身向前高速行駛。車頭的最重要作用，不再是動力，而是方向。準確的阿米巴組織劃分，促使企業從管理走向經營，人人成為經營者！