清師入閩，興化守將馬成龍以城降鄭經。經令許耀率兵赴之，旋令督諸軍進取福州，駐師烏龍江。耀沈湎酒色，不在軍事，諸將不服。清兵渡江，或議于半渡擊之，不聽。既登岸，倉皇出戰，敗回。經乃遣趙得勝、何佑代之，屯興化以御清兵（海上見聞錄、三藩紀事本末）。
十月，康親王杰書師抵延平，耿繼美等以城降。精忠聞之，大懼，隨遣精奇尼哈番劉蘊祥等赴延平獻偽總統將軍印，續遣子耿顯祚同前赍敕被留之周襄緒、陳嘉猷迎大軍。杰書抵福州府，十月朔日，令侍讀學士尹泰赍免死敕諭前往。初八日，康親王同將軍赍塔督兵敗賊于大溪灘下江山縣，遂克仙霞關，攻拔浦城縣。是時，鄭經擾興化及福州。精忠與其黨武灝、沈偉、郭景汾、羅萬里等搜括福寧、建寧、延平財利以餌眾將，不繼，偽鎮李朝政駐連江縣，盡勒客戶民居為兵，又屢為大兵挫衄，勢益窮蹙。康親王自建陽移書精忠招降。精忠得書，猶豫未決；答書言『自愿歸誠，恐部眾不從，致滋變患；望奏賜明詔，許赦罪立功，以慰眾心，乃可率屬降』。時諸將已密謀投誠，精忠欲乘船奔海，為都尉徐文耀所脅，不得出城。至是，于初四日剃發，率文武官員出城迎降，獻所屬官兵冊藉。尋精忠請隨大兵立功贖罪，杰書以聞（皇朝武功紀盛、海上見聞錄、東華錄、逆臣傳、連江志）。
上命耿精忠仍留靖南王爵，率伊所屬官兵隨大兵征剿海寇，圖功贖罪。原任巡撫劉秉政等俱著來京，其藩下官員及兩鎮下武弁仍留原任。兵丁照額設外，其余愿效力者分隸提鎮各標，愿歸農者原籍安插（東華錄）。
十一月，精忠邵武偽守將楊德以州款于經，經以德為后勁鎮，吳淑入據之。當是時，經悉有泉、潮、漳、詔、惠、汀、興、邵八郡之地（三藩紀事本末）。
十二月，清兵至邵武，淑御之；大雪嚴寒，諸軍涉溪，皆凍不能走，遂棄邵武，屯汀州。汀州前納款于經，守汀薛進思驚懼失措；汀州鎮劉應麟愿傾資助餉固守，進思不從，棄城而走。應麟奔潮州依劉進忠，病死；淑奔還島中（海上見聞錄、三藩紀事本末）。
康親王杰書奏：耿繼善前聞大兵將至，即棄邵武府遁往江西；?？軈鞘绯藙萑∩畚涑?，復犯延平。伊弟吳潛率兵渡河屯浦塘迎敵，副都統伯穆赫林等率滿漢官兵屢次擊敗之，陣斬偽總兵楊大任等，殺賊兵萬余，生擒偽總兵阮信等三百四十余人，所獲軍器無算。偽武定將軍彭世勛以邵武府降。又奏：耿精忠藩下編作佐領兵丁外，又有左右兩鎮兵。今福建經制及撫標兵俱照原額全設。精忠見率伊佐領下兵隨大兵征剿?？?，未為不足；當節省餉銀之際，其兩鎮官兵應請裁革。又藩下總兵官曾養性及原任溫州總兵官祖宏勛俱自溫州率兵至福州，祖宏勛應照劉秉政例赴京候補。得旨：俱如所奏（以上東華錄）。
——錄自福建通紀卷十二。
十六年（永歷三十一年、一六七七）正月，鄭經兵自館頭踰嶺，夜掠水南，焚民居數十家；守備鄭興卻之（連江志）。
康親王杰書奏：副都統伯穆赫林等追剿?？?，恢復泰寧、建寧、寧化、長汀、清流、歸化、連城七縣及汀州府城，招降偽官七十三員、兵丁二千五百余名（東華錄）。
清寧海將軍喇哈達、平南將軍賴塔等兵至興化。時鄭經諸軍銳氣已喪，何佑又與趙得勝不睦，疑其貳于清，得勝指天自誓，佑不之信，登臺以望趙師。師潰，得勝抽蕞注射，應弦皆倒。既見佑軍之不動也，嘆曰：『吾不幸與若輩同事，死固宜也』。下據胡床，挽強殺數十人以死。佑蓬發奔泉州，興化遂陷（海上見聞錄、三藩紀事本末、小腆紀年）。
二月，諭戶部：閩地經?？軘_害，又遭逆賊暴征橫斂，民困已極；今年錢糧盡與蠲免。其遭亂竄避人民，俱招徠還籍，各安本業。
康親王杰書奏：副都統伯穆赫林等恢復上杭、武平、永定等縣，招降偽總兵尹云龍、曾顯洪、張威等（以上東華錄）。
康親王遣知府張仲舉復與鄭經申前議，經不從（三藩紀事本末）。
清兵至泉州，守將林定無備；城破，標將林孟、參宿營謝貴死之。定走免，諸軍潰散。十九日，清兵至漳州。經倉皇登舟至華港，棄而不守；至廈門，欲回東寧，百姓號泣攀留。角宿營吳桂整兵防守，眾賴以安。繼而余眾稍集，乃遣水師分汛而守。祭趙得勝，親臨哭之。斬薛進思（原姓名裴德）、許耀（東華錄許耀已陣斬），捆責何佑、吳淑戴罪自效。諸將家眷搬回東寧。王進功、沈瑞、張學堯等陸續起程。一時七府俱潰。經既崩剝，不知所為，國事盡委之劉國軒（海上見聞錄、小腆紀年）。
三月，康親王杰書奏：鄭經大敗于興化、泉州，遂棄漳州、海澄而遁。海澄偽副將孫紹芳、漳州偽知府程夢蘭等相繼納款，寧海將軍喇哈達等于二月二十日抵漳州，遂復府城及海澄等十縣，閩地悉平（東華錄）。
漳浦巫者朱寅，挾左道，詭稱三太子；聚集海上殘兵，率二百余人于十九夜襲泉州，攀堞而入，鳴鼓揚旗，從開元寺前至西街。守兵以為海兵復至，乃于雙門前發一大炮。寅入城而去，人以為神，附者日眾，蔓延于漳、泉屬縣。凡深山窮谷巖寨，無所不到，派糧以食。頭裹白布，時謂之白頭賊（海上見聞錄）。
福建既定，康親王杰書奏：以將軍喇哈達、都統賴塔統兵同耿精忠進取潮州（逆臣傳）。
汀、漳、興、泉、邵武諸郡，以次收復。劉進忠、苗之秀以潮州碣石來歸。于是海上稍靖。耿精忠奏：請入京服罪（皇朝武功紀盛）。
四月，耿精忠奏：遣子顯祚入侍。命列散秩大臣（逆臣傳、東華錄作十月事）。
五月，令黃芳世仍襲海澄公、鎮守福建水師提督總兵官，愈加訓練，以靖海氛（東華錄）。
六月，尚之信歸清。劉國軒在惠州，鄭經遣水師迎之，乃率所部航海而歸（海上見聞錄）。
九月，康親王令將軍賴塔偕精忠所屬都統馬九玉率將士守潮州，撤精忠還福州；詔止之（海上見聞錄）。
福建總督郎廷相奏：鄭經監軍侍郎陳愈侯攜帶家口人丁自海上投誠。又奏：長泰縣天柱山最為險要，山?？苜\多聚于此；臣調兵搜剿，同原海澄公標總兵魏茂等殺賊三百余名，生擒偽提督中軍副將孫公等。其偽總督林鳳等俱帶重傷逃遁，天柱山已經蕩平。又進剿東囗〈土彔〉、塔潭等處，擊殺偽將軍吳田，賊將遠遁。又奏總兵黃藍敗海賊于小盈，提督段應舉等擒偽將軍李復貴、偽軍師林日向等（以上東華錄）。
十月，鄭經遣何佑等至南靖小溪收兵，吳淑等至長泰筑天成寨以遙應之（海上見聞錄）。
福建巡撫楊熙奏：朱統锠以前明宗室名號糾集黨羽，盤踞山谷；臣巳招撫偽總兵陳龍等，隨遣按察使吳興祚星赴光澤，率兵剿撫。吳興祚設計遣投誠總兵蔡淑佯回賊營，以作內應；蔡淑隨差人密報，投誠總兵陳龍復首先率眾斬關奪路，官兵分道斫寨，剿殺偽弁兵丁四千五百余各，獲朱統锠子朱義潛、侄朱義質。偽總兵馮珩等勢窮計迫，執朱統锠并銀印一顆，兵丁三千余名。又逆賊許志遠恃朱統锠犄角之勢，屢抗我師；今朱統锠被擒，聞風膽落，率眾投誠，計偽官一百有八員、兵九千一百余名。
康親王杰書奏：漳州龍溪縣班山、南安縣五都、同安縣三保溪等處，賊匪立營結寨，盤踞山谷，騷擾百姓，為害已久。臣遣前鋒參領都克納、侯馬三奇、副將馮兆京、副都統紀爾他布等分率官兵，于班山等處進剿。賊眾屢次擊敗，并招撫偽副將黃邦漢等。又奏：續順公沈瑞為?？軋掏_灣，其官兵家口散處無依，應令會集一處。上命匯駐潮州，以副都統張夢吉、宋文科統之。
福建總督郎廷相奏：朱寅勾連海寇，橫肆鴟張。臣遣海澄總兵官黃藍等會同滿洲官兵三路進剿。至灌口、楊坑地方，大敗賊眾，連奪賊營七所，陣斬一千余名，生擒偽左營將謝良、楊德六十余員，余孽逃遁。
十一月，耿精忠藩下參領徐鴻弼（一作朝弼）、佐領劉延應、護衛呂應賜、典儀陳良棟、護軍蘇云會等具狀遣人赴部，首精忠歸順后尚蓄逆謀凡五款：一、違康親王令，不悉舉出奸黨。一、仍遣王進功潛結海寇，通音問。一、與劉進忠執手耳語，謂乞降非所愿。一、密令腹心藏黑鉛藥于王星家，約俟異日收用。一、遣散舊兵歸農，令勿攜兵器、勿留供大軍；又將降前三日，殺范承謨以滅口；又遣王子玉至吳三桂處乞援。部臣以狀聞，昭忠在福州同參贊大臣介山、吳弩春亦以鴻弼首詞具疏入告。疏留中（逆臣傳、皇朝武功紀盛）。
康親王杰書等奏：夸蘭大、杜巴等率大兵敗賊朱寅等于泉州關口，總兵官侯馬三奇等敗賊于和平橋、草蒲港地方，副都統伯穆赫林敗賊于石井、清寺等處，遂恢復之。
福建總督郎廷相奏：署游擊韓六合敗賊吳萬勝于崇安縣界，殺賊二千九百余級。
十二月，康親王杰書奏：海寇圍泉州府屬小營地方，副都督楊鳳翔、提督段應舉領兵往援，擊敗賊眾，生擒總兵黃忠等，水陸共殺賊三千余人（以上東華錄）。
清兵圍吳淑于天成寨，朱寅率眾來援，吳淑突圍而出。
康親王遣漳、泉二府知府同泉紳黃志美等照朝鮮例議撫，海上不從，亦無報使（海上見聞錄）。
十七年（永歷三十二年、一六七八）二月，福建總督郎廷相奏：?？芩畮焸慰偠搅钟⒌确溉萁?，提督段應舉遣標下參將朱起龍等大敗之于日湖等處，生擒偽總兵林耀、偽副將黃宏等（東華錄）。
鄭經以劉國軒為中提督，總督諸軍；吳淑、何佑為副。十日，至海澄，攻玉川（一作洲），守將劉宗降；三汊河、福河、下滸等堡皆下。十八日，進取江東橋，守將王重祿、呂韜等奔潰，遂燒斷橋梁，分擊漳州。援兵三戰三捷，軍聲大振。二十三夜，取石碼，遂入鎮，取灣腰樹、馬州、丹州諸堡，軍于祖山頭，以逼海澄。副都統孟安等自潮來援，國軒退屯石瑪，筑垣據守，仍分兵屯漳州。時總督郎廷相、海澄公黃芳世、都統胡圖、穆赫林按兵漳上，提督段應舉自泉州來，寧將海軍喇哈達自福州來，平南將軍賴塔自潮州來，其余副將朱志麟、姚公子、李阿哥等先后來援；芳世、穆赫林敗于灣腰樹，胡圖敗于鎮北山，應舉敗于祖山頭。國軒兵僅數千，倏水倏陸，飄忽馳突，滿漢疲于奔命。國軒遂取平和、漳平，圍海澄（海上見聞錄、三藩紀事本末、小腆紀年）。
三月一日，國軒列陣赤嶺，清兵背城迎戰，前虎衛林陛一軍當其鋒。朱寅按兵天寶山，以牽漳州之兵；黃芳世擊敗之，寅遁入長泰（后下海，封為蕩虜將軍，改名蔡義明，歲余病死）。國軒樹柵雙橋一帶，離漳數里。滿漢諸將會議，以一股同黃芳世札水頭灣腰樹、一股扎鎮安門，安炮以斷其往來水路。國軒偵知，十一日黎明焚營撤兵。漳州兵意其遁也；少頃，舉帆直抵水頭，登岸陟嶺進戰。芳世素不知兵，又與諸將不協；吳淑攻之，芳世戰敗墜馬，遇救得免，走入漳城，病月余死。自水頭之敗，海澄道阻，段應舉會綠旗兵及滿洲兵數萬，列營祖山頭。十八日下午，國軒兵至，應舉揮兵迎敵；何佑、吳淑等繞出祖山之背，國軒督勁卒登山沖滿洲營，滿兵大潰。國軒又以兵截漳州大路，滿漢兵棄輜重，自相殘踏，奔入海澄。國軒夜令軍士鑿塹，一人一丈，引江水環城外；又鑿溝數里，兩岸安銃守之。由是，內外隔絕（海上見聞錄）。
福建水師提督黃芳世奏：海寇集其伙數萬，負嵎石碼城。于三月初六日，偽提督吳淑等率眾二萬有余上岸，副都統孟安等同臣標副將楊壯猷等率兵極力追剿，擊沈賊船，賊眾敗退。
案此奏，飾大敗為小勝。
閏三月，蔡寅擁眾萬余，突犯安溪。知縣李鈺同駐防千總王國棟等率兵役丁壯親身督戰，賊遁去，仍在山立木城踞守。署泉州城守營參將寧惟國，署提標后營游擊王旭等各帶兵，及該道府廳調撥民兵，并在籍侍讀學士李光地募發丁壯，令弟侄等統領，并力進剿，殺敗賊眾，燒毀賊營，保全縣城。
案犯安溪，東華錄既見于去年十月，又見于此；但據李光地年譜、傳志等列在本年，今削彼存此。
四月，漳州安塘報：副都統穆赫林、海澄公黃芳世等師次灣腰樹，與蔡寅（即朱寅）戰失利，平和失陷，賊偪潮州立營。得旨：康親王兵既分援諸路、蒙古兵復撤回閩中，兵力似單；今浙江平靖，可于杭、臺、衢三府滿洲、蒙古、漢軍兵內選六百名，令副都統雅塔理率赴福建。到日，聽康親王調遣。并檄將軍喇哈達、賴塔、靖南王耿精忠等交相計議，剿滅漳、潮間賊寇。
黃芳世奏：閩省變亂時，臣叔黃梧、弟芳度所部官兵，并已離散。臣抵漳之后，頗復收集，請減兵額為三千，付臣弟黃芳泰統轄。
總督郎廷相奏：?？軇菅嫒帐?，勾連山賊，互相應援。臣標兵止二千五百，所在告警，不能分應；請增臣標兵二千五百，設立五營。今韓大任投誠之兵見給糧餉，即以此兵補入臣標，可不煩別糜糧餉。得旨：悉如所請；但韓大任之兵新經招撫，不宜聚處一軍。大將軍康親王及參贊大臣將軍耿昭忠及該督撫提等詳議，將撫提標舊兵與新附之兵相參配合，以足兵額。統轄官員，該督選擇題補。
康親王杰書奏：奏副都統胡圖、海澄公黃芳世等于閏三月初十、十一日連破漳州海賊，陣斬偽提督總兵等，焚毀賊營，獲偽印札、船只、器械無算。
漳州安塘筆帖式報：?？墉h圍海澄，我兵失利于灣腰樹，賊勢益張。聞海澄城中糧已匱乏，賊復日犯漳州。
總督郎廷相奏：海賊猖獗，閩省兵單，請調江南、浙江、廣東三省滿漢官兵赴援漳、泉，又請調三省水師戰艦，并于福建召募水卒，規取廈門。