五月，康親王杰書奏：海澄危急，巳檄駐守廣東潮州將軍賴塔率所部兵之半及綠旗兵赴援（以上東華錄）。
逮總督郎廷相，以布政使姚啟圣代之；巡撫楊熙致仕，以按察使吳興祚代之。江南提督楊捷代段應舉為全省水陸提督（海上見聞錄以為四月事，三藩紀事本末以為六月事）。援兵四集，屯筆架山，以救海澄。國軒以筆架山南小寨懸崖，狀如掛燈（俗呼燈火寨），下臨大溪，順流可通海澄，問誰可扼守？吳淑請往；乘夜進寨，天明寨柵完備。是月十日酉時，滿營發炮攻擊，連夜不絕；淑令軍士穴地藏身，無死傷者。馳報國軒，以為乘夜發炮，意不在寨，當別防之。滿漢兵已至祖山、岳嶺，破林彪、張鳳二營，鳳戰死，進攻林陛營；國軒援兵至。姚啟圣之子姚義統韓大任兵以牛載土囊填溝，至第三重，國軒發火炮擊之之滿溪兵多填于塹，遂退（海上見聞錄、平閩紀、小腆紀年、東華錄）。
六月朔諭：康親王杰書用兵甚為巽愞，自至浙江，安居無事，及屢降嚴旨督趣，始破衢州之賊，進定福建。福建既平，不事豫防固守，俾海寇登岸，遂困海澄。杰書罷庸，怠忽軍紀，宜并參贊大臣嚴行處分。但現在出征破賊，俟師還察議（東華錄）。
福建提督楊捷以閩疆剿撫需才，奏請將江南游擊王嘉會、劉起龍、守備何濱、李英、張瑞、楊懋紱調閩補用（平閩紀）。
十日，劉國軒攻入海澄。段應舉、黃藍、穆赫林，希佛死之，獲孟安、馬虎等滿漢官三余員，皆釋之，授官給俸。滿兵千余，遷之東寧。海澄城中滿甲二千、馬八十余匹、綠旗兵守城兵計二萬余，圍八十三日，糧盡殺馬而食，馬盡，屑馬骨食之，死亡及泅水而出者過半。閩省震恐，諸援兵退守漳郡。國軒議乘虛取泉州，令吳淑分兵下長泰縣。國軒進兵，陷至同安。都統（一作梅勒）雅塔里走回泉州城守，何佑與江欽、楊德等十余騎至泉州，循清源山相視營地，城中兵不敢出。久之，隊伍始至，札空營于平地。城中兵終不敢出（海上見聞錄）。
七月，國軒水陸并進。江欽攻南安，殺守將。諸縣守兵相繼棄城走，遂進占泉州南門橋，載龍熕及大銃數十攻南門，城崩壞四十余丈，盡為平地。城內再筑短墻以守。城守馬勝等以釘裝船板，鋪于地上；兵入，無踔足處，損傷甚多。會天大雨，城竟不拔。圍泉兩月（同上）。
康親王杰書奏：賊圍泉州，副都統紀爾他布、提督石調聲退至興化，惠安復陷。臣隨檄將軍賴塔、總督姚啟圣守漳州，調將軍喇哈達速率兵來援泉州（東華錄）。
姚啟圣奏：平和失陷，臣會商海澄公黃芳泰遣參將呂孝德等進剿，大敗海寇，復平和縣（同上）。
八月，楊捷密奏言：福建舊制，原有專設水師提督，后因海面無警，鄭氏竄伏臺灣，故爾裁去。今則海寇見駐廈門，于漳、泉等處水陸交犯，狂逞之勢十倍于昔。自應循照舊制，特設專員，令其統轄沿海兵將，調度水戰；俾臣得以盡力陸路，一心剿御（平閩紀）。
諭：提督楊捷可專轄陸路兵，水師提督別行補授。楊捷又奏：臣向在山東，深悉山東、河南兵熟習交槍、鳥槍者甚多，乞各發千人；江南兵有熟習弓箭火炮者，亦發千人赴閩。從之（東華錄）。
鄭氏屯船定海，欲俟陸兵南下，為尾后之策；閩安副將田萬侯同總兵林賢、黃鎬、林子威等調集各路兵船往剿，于八月二十七日在赤澳、黃崎以及官塘等處三路奮擊。經水師總鎮蕭琛議以舟寡且小，欲據上流牽制之；水師章元鎮欲先發制人，率所部十舟進戰，眾寡不敵，阻風逆流，一軍盡沒。章元鎮被虜入福州，殺之。蕭琛退泊海壇，經召回，斬以徇，令援剿左鎮陳諒、后鎮陳起明督朱天貴（精忠將以舟師降）等防御北船（平閩紀、海上見聞錄）。
鄭氏兵焚掠五里渡及港頭、起步一帶居民（羅源志）。
國軒既乘勝下漳平、長泰、同安，略取南安、惠安、安溪、永春、德化諸邑（逆臣傳以下諸邑為春間事），乃自圍漳、遣兵圍泉，而斷漳之江東橋及泉之萬安橋以拒王師。
康親王駐軍福州，不敢進。已而楊捷出興化，復惠安；吳興祚由仙游出永春，與賴塔復漳平。捷遣兵襲破陳山壩，以出萬安橋之背，奪其橋。而賴塔軍之阻江漲者，亦得在籍學士李光地為鄉道，由安溪間道出同安。捷會同參贊大臣禪布、福寧總兵黃大來、浙江提督石調聲直抵泉州城，圍遂解。國軒乃率二十八鎮還漳州，筑十九寨，吳淑、何佑亦帥十一鎮軍于溪西。九月，國軒入江東橋至長泰，以二十一鎮兵與滿兵戰于龍虎山。精忠為右拒、賴塔為左拒，胡圖在前戰小卻，姚啟圣援之亦不利。精忠故仇鄭，親督戰，立斬退者三人，大呼而入。將軍馬某繼之，陣斬鄭英、吳正璽等，破營十六座，斬首四千、捕虜千二百人，亡溺以萬數。國軒中炮掀墜地，有滿洲披甲前蒙國軒放回，遇之，以騎授之，始走免。于是賴塔復長泰、姚儀復同安，南安亦不守，國軒泅河遁入海澄。海澄三面環海，其陸地一面復掘濠引潮，以阻清軍。時出犯江東橋，列營觀音山，與滿漢兵軍壘相望（三藩紀事本末、平閩紀、海上見聞錄、小腆紀年）。
吳興祚奏：官兵敗于白鴿嶺，復永春、德化等縣（東華錄）。
初，鄭氏將章元鎮等攻掠幕浦堡，游擊侯大經以兵趨救，馬傷而蹶，寇將及之，千總劉某揮大刀前進，殺二人，獲一人以歸，侯乃免。寇盡俘男女于廈門索贖。有皮七者，前嘗投誠，寓幕浦，與大戶習。嘗以二舟載堡民往來議贖，不取其直；貧而不能贖者，則貸而助之。諸大戶亦皆賴以脫，擄者前后多歸。至是，陳君翼率舟師破鄭氏兵于定海，獲元鎮，復奪回前掠者數十人（連江志）。
鄭氏將王一鵬率眾嘯聚于驛坂餔地方，欲阻絕要路。提督楊捷與巡撫吳興祚定議，密遣連江營守備鄭興隨征。總兵張韜率兵細探，果聚于上西、蕭厝、沙格三處，乘夜進剿。官兵鏖戰竟日，殺死七百有余、生擒六人，溺水者不計（平閩紀）。
十月，姚啟圣遣人議撫，意欲得海澄；經不從（海上見聞錄）。
十一月，京口將軍王之鼎仍以將軍調補福建水師提督，楊捷仍以原銜管福建陸路提督事務（平閩紀）。
十二月，康親王杰書奏：都統賴塔等率領滿漢官兵于十月二十七日敗賊于柯鏗山、萬松關，副都統紀爾他布、總督姚啟圣、提督楊捷等敗劉國軒于江東橋，又敗之于潮溝之間，副都統胡圖敗賊吳淑于石衛寨，斬獲無算（東華錄）。
予福建殉難南安縣知縣宋煜官蔭（同上）。
復遷沿海居民于內地。耿精忠之變，閩省遷民悉復故土。康親王疏請遷界以累民，罷之。至是，督撫再請遷（海上見聞錄、三藩紀事本末）。
十八年（永歷三十三年、一六七九）正月，康親王杰書奏：劉國軒等率賊兵八千至郭塘、歐溪頭地方立營，欲斷江東橋，以犯長泰。都統賴塔與總督姚啟圣、提督楊捷等統兵直偪賊營，令副都統紀爾他布、巡撫吳興祚等領兵擊之，大敗劉國軒、吳淑、何佑等，追至江邊，斬首二千余級（東華錄）。
鄭經以朱天貴守海壇；以陳諒為水師，乘南風迅發，復犯定海。官軍集船百余，由由五虎門而出；大風暴起，官軍收回五虎。鄭氏船仍退海壇（福州府志）。
耿精忠既降，而鄭氏方踞臺灣、澎湖。浙江總督李之芳疏請操練戰船及福建水師會剿海洋諸寇；又疏請改復楓嶺營、浙閩分轄舊制（蠶尾續文集）。
思明州每月每戶本輸米一斗，自二月起，每戶再加一斗。劉國軒請停文武俸以給兵餉（海上見聞錄）。
二月，鄭經兵猶據廈門、金門，上欲乘勝厚集舟師，規取二島，以圖澎湖、臺灣。又以曩時征取金、廈，曾用荷蘭國夾板船；特諭荷蘭國王，令具夾板船二十艘，載勁兵協力攻取二島。至是，康親王杰書等議奏：戰艦水師未備，荷蘭國舟師又不能預定來會時日，勢難急圖。上斥之（東華錄）。
康親王杰書等奏：據總督姚啟圣等啟，進取金、廈須發江、浙巨艦二百艘，增閩省兵二萬，迅調荷蘭舟師來會，方可大舉。進剿之期，必俟入秋北風起后。從之（同上）。
劉國軒、吳淑、何鉆等復用船四十余只帶眾渡河，圖攻榴山寨，并欲奪江東橋。提督楊捷會同平南將軍賴塔等率兵分兩翼壓陳督戰，官兵沖至下坑山、歐溪頭各山上，鄭氏從山下遯走。官兵緊追，陣斬一千有余，獲盔甲、旗幟等甚多（平閩紀）。
三月，楊捷奏：會同平南將軍賴塔等于下坑山等處擊敗逆賊，擒斬甚多（東華錄）。
康親王杰書等奏：已將征調舟師敕諭，令荷蘭國人赍往；因趕塘、石碑洋諸地為海寇所阻，不得行，故未達而還。上諭詰責（東華錄）。
總督姚啟圣奏：偽總兵廖琠、黃靖等眾據水晶坪，聯絡山海寇賊，為害地方。臣遣官招撫廖下崗工人琠等率偽官三百余員、兵一萬二千余人，詣軍前降（同上）。
國軒偵知姚啟圣欲據果堂寨以迫江東橋，即同吳淑發兵入據其寨；漳兵至，擊走之（海上見聞錄）。
四月，陳永華啟請以經子克囗〈臧上土下〉為監國；時年十六，號曰監國世孫（同上）。
湖廣岳州水師總兵官萬正色奏閩海情形、水陸戰守機宜。上諭：萬正色剿寇洞庭，著有勞績，今岳州、長沙諸處悉已恢復，無煩水師；且萬正色閩人，稔知水性。茲剿海寇之際，從優加太子少保，調為福建水師總兵官，率所部官兵克期速赴閩中。旋以萬正色為福建水師提督，統轄全閩水師營務。
總督姚啟圣奏：偽總兵鄭奇烈率偽官五十三員、兵丁千余投誠。
雙頭洞系浙、閩交界，賊首陳超萬等嘯聚。總督姚啟圣會同提督楊捷、撫臣吳興祚于五月初九日至流江地方，水陸夾擊，大敗賊眾，殺傷無數，獲其船只器械。
五月，康親王杰書奏：偽總統劉國軒等侵犯江東橋，平南將軍賴塔等統官兵迎擊，賊敗走太平寨。
初，湖南用兵，令江南造鳥船百艘送岳州軍前。至是，岳州既復，上諭萬正色赴閩時即領在岳鳥船并水手以行；至江南、浙江，更選戰艦百艘攜往，以資進剿（以上東華錄）。
六月，鄭氏將楊忠等會合深滬，圖窺犯；游擊劉國興率各營三路夾擊，敗之。楊忠被箭落水，擒其副將楊德，陣斬一千余名，焚毀大小船七只；斬其官四員，生擒一十八員（平閩紀）。
鄭時英駐東石督餉。時禁界鹽貴，居人多私來東石販鹽；時英獻策，欲掘沿海鹽埕，則利盡歸于我。經乃檄林升、令楊忠往潯尾掘南北鹽埋。忠至，舍舟登岸，連掘兩日夜。竿頭守將密請泉城大隊兵至，四面合攻，忠力戰不支，歿于海，余死傷逃亡過半。界禁既嚴，私販亦絕（海上見聞錄）。
七月，國軒筑潯尾寨，一夜而成；同安兵至，擊走之（同上）。
八月，福建總督姚啟圣奏：鄭經志必不降，斷不可遣人招撫。劉國軒乃賊中巨帥，頗能用兵，請赦其前罪，授以公爵。吳淑本無反志，由部將迫脅，請赦其前罪，授以侯爵。至偽總兵陳昌、林升、江欽、吳潛均請畀以總兵官，實授管事。此數人若解體投誠，則鄭經勢孤，海寇根株立可芟滅（東華錄）。
福建巡撫吳興祚奏：招撫偽總兵蔡沖琱等三員、偽官八十五員、兵丁一萬二千五百一十七名，招回島民三千一百九十余名。共獲大小船六十只，分撥水師營用（同上）。
九月，泉州馬步數千攻東石。時施廷、陳申守東石，散卒祗三百余人。施廷被創，陳申戰死，兵民赴海死者無數。泉州兵仍筑三寨，犄角以守（海上見聞錄）。
江南賊呂貴、蘇亮等率伙三千余眾，驟犯崇安汛，據險結巢，與鄭氏遙為聲援。游擊李英會同各營官兵暨崇安縣知縣金章鼓勵鄉壯，直下新嶺，攻破賊寨木城二十六座，斬偽將謝瓚郎等五員、殺賊八百余人、生擒二十六名，搜獲器械無算（平閩紀）。
十月，諭康親王杰書曰：海寇竊踞海澄，倚廈門、金門為營窟，騎兵無所用其力；惟藉水師樓櫓攻取，甚屬緊要。今因荷蘭國之船未至，故前議不行。近者，福建綠旗兵丁漸增數倍，即無滿兵，止以綠旗兵丁剿滅賊寇，未為不足；見在福建滿兵甚多，應即撤一半以省糧餉。但耿精忠尚在閩中，虞有意外之變；王當開諭精忠，令其陳奏請安，詣京陛見。倘精忠因王之言具奏，可令其自來；若精忠未能即行，王不可獨率滿兵一半先回。此事關系甚為重大，王當詳籌具奏（東華錄）。