十月，調岑毓英為福建巡撫。
七年（一八八一）五月，臺灣地震，福建地震。
七月，何璟、岑毓英奏：臺灣地方孤懸海外，日本窺伺已久，不早籌整備之方，則戎心易啟；惟有隨時親往履勘，認真經營。該處情形，其北開辟未久，尤關緊要。而赴臺輪船向來由羅星塔出五虎口，繞道廈門、澎湖，必須三十六個時辰，始能到岸；設遇風狂浪大，顛簸耽延，日期更難預定。若改由五虎口經赴臺北，只須九個時辰即抵基隆，甚為妥速；而由基隆至臺灣府城，亦不過旬日可至。臣等再四籌商，擬即以北路為渡臺正路，并咨商船政大臣黎兆棠撥大輪船一號，長為渡臺之用。毓英擬將積牘清理完竣，定于閏七月十三日即行渡臺，由臺北至臺南沿途查看，應如何整頓，咨商臣璟妥為籌辦。前奉旨準調黔省安義等營練軍二千人，臣毓英已飭藩司匯撥行裝、行糧、夫價等銀，并檄行記名提督何秀林等分起管帶，陸續前來；俟到閩后，擬以二百名留為護兵，以二百名駐扎五虎口，其余一千六百名均分扎臺灣。
十一月，岑毓英奏澎湖前遭颶風，被災甚重。現查各島饑民，共有八萬余丁口，先后運到米糧不敷分散；籌由省城增廣倉義榖項下借提陳榖二萬石，運往接濟。
岑毓英奏：本月初一日，復行渡臺籌辦撫番事宜，并督修城池、炮臺、河堤工程。
八年（一八八二）四月，臺灣地震，福建地震。
五月，以張兆棟署福建巡撫。
九月，臺北大雨颶風。
九年（一八八三）三月，以張兆棟為福建巡撫（以上東華錄）。
是年，臺灣道劉璈因臺地孤懸海外，兵餉接濟為難，請以借用洋款為辭，將全臺口岸定以年限，暫質與他國；或以澎湖一島，仿照香港、澳門例賃與他國。全臺煤礦務，皆可包采納稅。各國中以德國為最宜，為暗中乞援之一法。未準行（無暇逸齋文鈔）。
十年（一八八四）閏五月諭：前直隸提督劉銘傳，著賞給巡撫銜，督辦臺灣事務；所有臺灣鎮、道以下各官，均歸節制（東華錄）。
法提督孤拔率兵船來福州馬尾，有占據地方為質、索賠兵費之說（清史紀事本末）。
督辦臺灣事務劉銘傳二十四日抵基隆，查勘炮臺形勢；商令總兵曹志忠，在外海口門社寮兩山對峙之區，各筑炮臺一座，別建護營一座。二十五日，即有法人兵船一灣泊基隆；詢所由來，答以游巡海口。二十八日，駐臺北府城。奏臺灣孤懸海外，非兵船不能設守。閩省派輪船四只，永保、琛航在臺北裝煤載貨，萬年清、伏波專備臺南調遣，俱赴閩、滬，尚未回防。查船政局有澄慶、登瀛洲、靖遠、開濟四船，均撥赴兩江。目前臺防需船，較他處為倍急。請飭下署兩江督迅飭該兵船來臺，以后餉需當由閩臺籌給。奉旨：江南防務亦殊吃緊，暫緩調撥（劉壯肅奏議）。
法艦至基隆購煤，劉銘傳飭封煤窯（東華錄）。
六月朔日，何璟、張佩綸等電報法全力注閩，已進八艘，請飭援應牽制（同上）。
是日，又有法兵船巡泊基隆，半日即去；而前次所到之法船，仍泊不行。適新調提督章高元率毅勇五百自臺南至，因飭扎近基隆炮臺；提督蘇得勝佐之。十二日，運炮委員游學詩雇德商萬利輪船至滬尾，令將雷炮由萬利船運布基隆；法兵酋堅阻，不許卸載，仍回滬尾。十四日，續來法兵船四，直逼基隆。法酋李士卑斯遣告蘇得勝、曹志忠，稱和議不成，限期已屆；隨帶戰書告示，定于翌晨攻擊炮臺。劉銘傳十五日馳赴基隆，法人已于辰刻開炮。臺上祇存洋炮五尊，當門一面，不能從旁還擊。章高元、蘇得勝各帶百余人潛伏炮臺墻外溝中，敵炮猛攻不息，竟毀炮臺前壁，火藥房亦被轟毀；營官姜鴻勝率軍退出，傷亡弁勇六十余人。十六日卯刻，法兵四、五百人，半在曹志忠營北山上筑營；余二百人直薄曹志忠之壘，仍用輪船炸炮助攻。曹志忠一面飭守本營，親督王三星等率隊二百人出戰。銘傳令章高元、蘇得勝率隊百余人襲其東，已革游擊鄧長安率親軍小隊六十人擊其西，所持后膛槍皆能命中，擊倒山巔擁纛之法酋二人與山下法兵頭一人，一鼓登山；法兵奔潰，奪獲洋槍數十桿、賬房十余架，并獲二纛，斬首一級。法兵傷亡百余人。捷聞，奉旨：發帑銀三千兩賞給出力兵勇；查明尤為奮勇者，傳旨賞給。基隆濱海各營暨曹志忠營均飭移后山；其八斗煤礦，派營官楊洪彪督拆機器，移至山后，并將煤礦房屋一并燒毀（劉壯肅奏議）。
諭軍機大臣：據彭玉麟電報，請飭彭楚漢就近募勇助閩防。本月十五日，臺北基隆炮臺被其攻占，殊堪發指。閩防萬緊，著穆圖善等傳知彭楚漢迅速募勇成營，預籌戰守。漳、泉兩郡之人強悍可用，宜切實訓練，以資得力。并著卞寶第、彭祖賢傳知程文炳，或選帶湖北防營、或另募新勇，克日乘輪船由長江順流而下，至江西會商潘霨與前調江西陸兵合力前進，赴閩應援。所需餉項，著卞寶第等力籌撥濟，并與曾國荃會商撥給軍械。
張之洞電奏，請飭南北洋替派數艘帶水雷艇合力援閩。諭：著李鴻章、曾國荃、吳大澄、陳寶琛迅速電商定議。
七月十日、十一日，基隆法船迭開炮，臺勇憑山為障，開炮還擊，始退泊口外。十四、二十等日窺滬尾；孫開華，李彤恩將前備堵口石船接連沉塞。法人日以一兩船欄泊滬尾，遇船即搜，以絕援應。基隆口門仍泊三船。
諭：何璟著來京，另候簡用。閩浙總督著楊昌浚補授；未到任以前，著張兆棟兼理。
電諭李鴻章：閩需洋炮甚亟，著速購德國大炮十尊、次炮二十尊，解閩應用。
諭：大學士左宗棠，著授為欽差大臣，督辦福建軍務；福州將軍穆圖善、漕運總督楊昌浚，均著幫辦軍務。三品卿銜翰林院學士張佩綸，著以會辦大臣兼署船政大臣。詹事府少詹事何如璋，著來京。
諭：左宗棠奏籌議援臺一折，著照所議，南洋派兵船五艘、北洋派兵船四五艘在上海會齊。楊岳斌帶八營由漢口搭輪船赴滬，即統領各兵船赴閩；先至廈門探明法船情形，繞至鹿港等處登岸，相機援剿。李鴻章、曾國荃即將兵輪派定，并知左宗棠、楊岳斌遵照（以上東華錄）。
八月十二日，基隆突至八船，并前泊共十一船。十三日黎明，法兵千人自口外西山登岸；營官畢長和等接戰，陣斬法一酋，臺勇傷亡逾百。忽報滬尾法船五艘直犯口門，炮臺新壅泥沙，被炮即毀，陣亡炮勇十余人。劉銘傳以基隆無兵可分，滬尾又當基隆后路，離府城祗三十里，乃夜率各營自基隆趕回淡水，立派曹志忠等馳救滬尾。十六日，法人又到三船，通計八艘；孫開華等晝夜率軍分伏海濱。二十日清晨，法船忽散。孫開華決其必登岸，親督龔占鰲等設伏各處。部署粗定，法人炮轟數百響，煙塵漲天，炸彈如雨；復以小輪分道駁兵千人猝登岸。孫開華、李定明、范惠意分途截擊，章高元等自北路迎戰。法兵各執利鎗，自辰至午，鎗聲不絕。臺軍拔短兵截殺，李彤恩所募土勇張李成一營繼之。孫開華斬執旗法酋，奪旗銳入，斬馘二十五級（內有兵酋二人），槍斃三百余人，法人大潰。臺軍追至海岸，法兵溺海者更七、八十人。法船急護敗兵，開炮亂擊；自傷小輪一只，并遺格林炮一尊，俱獲以歸。捷聞，奉旨賞給帑銀一萬兩。法踞基隆附近之暖暖等處，地皆相接，始則派夫修壘，不從則侵掠隨之；暖暖武舉王廷理、周玉謙募勇三百人，與深澳等處各董練丁，憑險堵御。彰化郎中林朝棟募勇五百人助剿，新竹郎中林汝梅募勇二百人協守新竹；卿銜林維源捐洋銀二十萬元（先繳十萬元）、月米三千石折價計銀，暫資兵食（劉壯肅奏議）。
曾國荃奏：籌撥勇營餉項渡臺，交楊昌浚由江西陸路入閩。
曾國荃等電報：官軍十七日復基隆，五路圍剿，斃法兵甚多，奪獲鎗炮多件。奉諭：聞法人雇土人驅赴前敵，多被殄戮；著劉銘傳曉諭居民，引以為戒，勿為敵誘。
九月，李鴻章電傳劉銘傳初三日由廈門轉電略云：初二日，法又到船六艘，在臺北者不下二十只。二十八日，法四船擾臺南，澎湖存亡無信，富紳多舉家逃走。土勇已募五千余，無器械，不受約束；不能御敵，徒索餉鬧事。土匪四起，軍士疫癘不止，日有死亡，能戰者不足三千人。敵勢甚大，日內必有惡戰。傳同將士惟拚命死守，保一日是一日。現在洋火藥巳缺、食鹽無來，百姓擾亂，餉路亦阻。臺局不堪設想，可為痛哭云云（以上東華錄）。
十四夜三鼓，曹志忠率隊欲趨獅頭嶺襲取九弓坑敵營。甫至山下，即炮傷四十余人；曹志忠知有嚴備，收隊退回（劉壯肅奏議）。
以劉銘傳為福建巡撫，仍駐扎臺灣，督辦防務。
何璟奏：臺、廈一帶瀕海遭風，撥款應濟。
劉銘傳電奏：臺灣勸捐軍餉官紳，皆請奏開實官捐輸。凡京職自郎中以下、外官自道府以下及三班、分先、分間、盡先各花樣，均按照例定十成銀數報捐（不準以錢文、軍械、米榖折算），作為臺灣防剿經費；予限半年，限滿即行停止。得旨允行。
曾國荃奏：九月十五日奉電旨：左宗棠奏籌議援臺一折，著照所議，南洋派兵輪五艘、北洋派兵輪四五艘在上海會齊赴閩援助。當即飭籌防局、輪船支應所不惜金價，豫備軍火與船上攻戰器具，并購買外洋六角火藥及松白煤，議派統帶官籌備一切需用各項。嗣于九月二十九日奉電旨：李鴻章現派德國水師總兵厲百齡帶快船赴閩，停滬后與南洋所撥各船會合前進，并著曾國荃、楊昌浚飭水師統帶等與厲百齡妥為聯絡商辦；或有訓練未精、見識未到之處，即囑厲百齡隨時幫同教練指示。即與李鴻章往返函商數次，又與長江提臣李成謀隨時函商：開濟、南琛、南瑞三號快船之外，惟澄慶、威靖二船可以出洋，共計五船，略為厚實，炮位略可及遠。至于統帶之員，亦惟理在總理輪船營務處提督銜總兵吳安康與各船相習較久，堪勝統帶之任；即用營務處關防，可以號令各船。所有出洋應用軍火、餉糈各件，業由籌防局寬為豫辦，不令致乏。至各船應領口糧及以后買煤經費，亦札令吳安康與各管駕面商，酌定數目，帶往應用（以上東華錄）。
臺灣道劉璈請開缺專辦克復基隆（劉璈稟）。
十二月諭：臺北急需援師，左宗棠前派恪靖軍千人赴臺，兩營繼發著催令速渡，并再撥勁旅千人。臺南現無法船，新竹等處皆可登岸；克日前往，歸劉銘傳、孫開華節制。劉銘傳稱方恭軍廣勇不得力，請調舊部吳宏洛軍；兩軍更調，尚屬相宜，著張之洞酌籌電奏（東華錄）。
初十日，法兵千余分攻臺北大水窟、圓窗嶺，別船載兵四百自八斗上岸，抄襲深澳坑后路。守隘民團，寡不敵眾，俱潰；法遂進至暖暖對河之月眉山。營官張仁貴率勇二百沖入山下竹林中被圍，巨雨竟夕。十一日，林朝棟馳往救援，營官廖得勝、葉友勝亦各帶楚勇三百人夾攻，張仁貴始出重圍。法又增兵千余前來接戰，以百人奪踞月眉山。廖得勝、張仁貴等奮力仰攻，槍斃山上敵兵十數人，始奪踞其巔。其分犯大水窟者，亦經林朝棟擊退。圓窗嶺僅有桂占彪楚兵一哨、蘇樹森土勇一營，蘇得勝命營官鄧長安以土勇三百合練兵百余人助之。十二日，曹志忠親赴督戰。十三日，槍斃法酋，始退里許，仍伏月眉山、圓窗嶺下。曹志忠見敵不退，筑壘月眉山待戰；法亦筑壘山下。十六夜，曹志忠、林朝棟會商攻襲其壘；法全隊拒戰，至黎明始收隊回營。二十日，法兵四百復犯大武侖，營官陳士貴、林則榮率隊奮擊，始退（劉壯肅奏議）。
十一年（一八八五）正月，李鴻章派聶士成淮勇八百五十人、左宗棠派王詩正恪靖五營至臺北。詩正統帶五營，于十八日即赴前敵。法人添兵大至，以四艦濟兵，自八斗登岸，猝襲月眉山。曹志忠所統楚軍六營，既以兩營分扎大武侖、又以三百守戲臺山，僅率一千四百人分守月眉山、深澳坑長墻十七里。十九日，法兵二千自枕頭山、竹篙山、龍潭堵三道進偪，突以千人自深澳坑抄襲墻背，將戲臺軍截斷，遂破月眉山頭卡，并以炸炮夾擊深澳。新筑長墻，雨久多坍倒。劉朝祜、廖得勝因勇丁死傷甚多，乃退至山下，合曹志忠、蘇得勝暫壁新煤廠以待。王詩正至五堵聞報，十九日派威、良兩營疾赴六堵救援。十九夜，劉銘傳率聶士成所部四百人馳赴六堵策應。因至暖暖必過敵壘，白日不便行走，王詩正率兵夜進。銘傳令合曹志忠據暖暖夾河為營，保大水窟后路。法兵集月眉山巔，以巨炮擊林朝棟、蘇樹森壘，勢甚危岌。王詩正未至暖暖之先，威、良兩軍乘間攻襲月眉山尾，依山蛇進；法兵數十拒之。王詩正所帶剛營自山后繞至，法兵退至山腰，遂奪月眉山尾一卡，王詩正令威、良、剛等四營分屯卡后。二十一日黎明，合曹志忠攻月眉山嶺；法已集水陸全軍以待。王詩正向前猛攻，哨官胡少亭、羅國旺中炮陣亡；哨官李經青、龍春芳奪回兩尸，各受重傷。營官申道發殿軍，死戰傷足，始退。法既敗月眉山之軍，遂分兩道：一自月眉山襲暖暖之前、一自鳥嘴峰襲大水窟之后。王、曹兩軍前后受敵，乃退河南。于是大水窟、四腳亭亦三面受敵；朝棟、朝祜抵拒長墻，救出四腳亭蘇樹森土勇，鳥嘴峰團勇俱潰莫能支。劉銘傳督聶士成等駐六堵間，以扼臺北孔道；孫開華督飭滬防各軍筑塹掘濠，嚴備以待（保臺略）。