六月諭：?？蛋驳茸喾Q，向來臺灣各營，自總兵至守備衙門，皆有兵丁聽候差遣，分為旗牌、伴當、內丁、管班四項名目，各有目兵管領；總兵署內多至三百人，副將以至守備依次遞減，至少亦有三十余人。請嗣后將四項名目全行禁革。從之。
又諭：前將萬鍾杰補放臺灣道時，特令加按察使銜，原欲令該員遇有應奏事宜，得以自行陳奏。嗣后遇有補放臺灣道員者，俱著加按察使銜，俾得自行奏事。
七月諭：柴大紀在臺灣總兵任內，任意廢弛營伍，縱容兵丁贓私累萬盈千。迨賊匪竊發，并不實時帶兵親往撲滅；復托詞回城調兵，遷延時日，以致釀成賊勢。及收復嘉義縣城時，又不并力追剿，與賊以暇，致賊人復得占踞斗六門、大里杙等處，修筑抵御。種種貽誤軍機，經?？蛋驳榷〝M斬決，解京辦理。朕以柴大紀情罪重大，本應立正典刑；其在嘉義奏稱不忍以十數萬生靈委之賊手、情愿固守之處，雖查系義民不肯放出、皆屬謊詞，朕究念其尚有守城微勞，欲俟解到覆訊后，加恩從寬末減，改為監候。茲據軍機大臣等覆訊，柴大紀復思狡展，翻供低賴，豈可復從寬典？柴大紀著照所擬，即行處斬，以為昧良狡詐退縮者戒！
十月諭：據徐嗣曾奏，柴大紀所奏正法及戮尸各犯內有許懷等三十五名本系誤拏，經知縣陳良翼審屬良民，據保釋放；柴大紀必欲回護原奏，按名正法。爭執再三，復令該縣扶同捏報，始準釋放。是柴大紀妄奏冒功，幾令無辜良民數十人陷于重辟，情節尤為可惡。著將柴大紀之子查明發往伊犁，給與兵丁為奴，以示懲儆。
五十五年（一七九〇）三月，免福建臺灣府屬應征供粟，其官莊租息銀免十分之三。
十一月，徐嗣曾卒，調浦霖為福建巡撫（以上東華錄）。
五十七年（一七九二）六月，臺灣地大震（東溟文后集）。
六十年（一七九五）三月甲子，臺灣匪民陳周全作亂，陷鹿港。乙丑，攻彰化，陷之。先是二月，南路鳳山匪民陳光愛謀反，攻石井汛，未破被獲，斬其黨數十人，眾潰，事且定矣，捕少懈。已而內地米貴，商船爭集；臺米亦貴，石米錢五千文。北路彰化游民聚眾搶奪，知府遇昌，右營游擊陳大恩馳往，擒治十數人，曉諭彰鹿有榖之家出糶，市價平。三月，遇昌回郡，大恩留彰化彈壓，陳周全遂為亂。周全，同安人，生長臺灣。乾隆五十七年回籍，與同安匪民蘇葉謀反未成，事敗逃至鳳山，與陳光愛結會；再敗，逃至彰化湖仔莊泉州人馬江家，復與潮州人陳容（郎陳光輝）、漳州人黃朝、黃親分漳、泉、粵三股各招千人作亂。周全稱長，拜晉江人洪棟為軍師，陳光秀、許篇、阮四、吳加令、楊成隹皆封偽將軍。詭言內地朱一貴之后朱九桃有海船數千，將以三月十五入鹿港；令旗書「大盟主朱」，又刻木印四角刻「豎仰攻濟」四字，中為桃形，桃中刻小「朱」字，其黨皆以朱為號。至是，洪棟定計，先攻鹿港。彰化城中聞鹿港有賊將起，游擊陳大恩以兵二百人往備。有告城中匪民吳添應賊者，反捕之，交縣收訊，復出城駐札。是夜，賊遂起。黎明，攻破鹿港，圍同知署。同知朱慧昌有勇力，持刀御賊，殺斃賊目陳光秀；眾賊齊入，遂遇害。鹿港營亦破，游擊曾紹龍、外委任尚標皆戰死。大恩聞變，還屯八卦山，為城聲援。署副將張無咎、署知縣朱瀾聞城中有賊，懼不敢守，出奔八卦山。賊趨攻彰化西門，都司焦光宗拒守，炮傷賊頗多。賊繞攻八卦山，大雨，官兵火繩淋濕，鎗炮莫施；賊乘雨奪山，殊死攻。大恩見事急，燃火藥自焚，無咎、瀾被害。城中見八卦山火起，無固守心。賊遂入，典史費增運、千總郭云秀、吳見龍皆戰死；都司焦光宗自刎未死，民人匿之。賊釋囚，掠倉庫，出榜安民?？べ\因乘雨攻山，衣濕，就周全取衣；周全令各當鋪暫借。眾賊因肆掠，民大怨，乃相謀逐賊矣。
初，彰化獲吳添，供有海盜船進鹿港，定日攻鹿港，彰化并有沿海匪民附和。翼日，果有賊陷鹿港之事。丁卯，營、縣報至，原任鳳山縣張植發自彰化奔郡，言內地紅頭賊船約數十號，俱穿白布囗〈衤領〉褂，本地附和匪徒以白粉涂株衣衫為號，其勢甚熾；初不知賊首為陳周全也?？ぷh以郡城根本重地，林逆之亂，臺灣道楊廷理固守得民心；與中軍游擊潘國材留守，哈當阿、遇昌以游擊麥瑞水陸兵九百人剿賊，使安平副將陳上高哨船赴鹿港堵截。連日夜大雨，戊辰至灣里溪，水漲不克進，遂駐之。是日，斗六門賊王快數百人與陳周全應，乘雨夜攻斗六營；守備吳大瑞出援彰化未返，千總龍升騰御之，賊退。次日復至，從賊益眾；畏營中鎗炮，以方棹側轉車輸木上，鋪浸濕棉被，賊藏棹后推擁而前。升騰約軍士持鳥鎗不發，度賊近，升騰親燃大炮擊棹破，乃排鎗齊發擊賊，死傷甚眾。又先日，因雨預備斗篷一百具，以是兵帶雨戰，火繩不濕；賊敗。守備吳大瑞兵亦至，賊走散。時升騰兵僅百人，破賊千余。
汀州府同知沈揚以督、撫委查工程至彰化，遇變，避匿城中民房，密與貢生吳升東謀，轉約廩生楊應選集義民二千余人，城內洶洶言逐賊；大肚、鹿港各處義民皆起。己已，賊出掠山仔腳、田中央社，武生林國泰率莊民擊敗之。賊懼，不敢駐城中，偽軍師洪棟先遁。都司焦光宗自田中央率義民至，自西門入，城內義民大呼逐賊，賊眾驚潰，遂復彰化。鹿港賊亦為義民逐走，復鹿港。揚安撫居民，與都司焦光宗率義民共守彰化，以收復聞，且請兵；時鎮、道皆未知也。哈當阿聞嘉義縣北虎尾溪渡船為賊焚斷，恐嘉義失守，分兵二百人令守備林國升赴嘉義協守，仍自駐灣里溪南。嘉義各莊義民首張添錫、生員張田玉率義民數千，夜扎筏渡虎尾溪至嘉義，從原任知縣單瑞龍協守縣城。臺灣道楊廷理亦選鄉勇千人，赴軍營濟之。郡中訛傳海賊且至，安平右營游擊陳光昭遙望鹿耳門外有十余艘，疑為賊，發炮擊散之。廷現聞，復添撥鄉勇助守鹿耳門。及沈揚報至，郡中人心大安。揚請增兵撥餉，以保城邑；廷理發府庫銀一萬兩，委丁憂典史陳圣增運送軍營。以收復聞，請委揚署鹿港同知、前嘉義縣知縣單瑞龍署彰化縣。
賊眾既潰，陳周全只身南遁，至埔心莊。甲戌，鄉民陳祈、莊南光誘執之以獻。守備吳大瑞亦與義民邱景山獲賊目陳光輝。馬江為鋪民所殺。各路報獲余賊甚眾。哈當阿夜渡虎尾溪，乙亥至彰化，遣游擊麥瑞以水師一百人、廣東義民三百人、鹿港義民一千人赴鹿港。
南路賊鄭賀（綽號紅面猴）住鳳山中州，與陳光愛余黨許強善。鄭賀聞提鎮赴彰化剿賊，意郡城兵單，謀作亂；陳喜、黃皮、李和尚、鄒茂、郭旭等附之，約分招賊黨。賀夜往邀許強，強先見臺灣道示諭各賊投誠或能擒賊自效皆免罪，乃陽許之。飲以酒，乘醉擒賀以獻。陳善等至大目降，亦為網民郭猴助義民首方耀漢等所獲解郡，又擒獻賊目李計、趙好、沈輝、陳韭、許強；貢生李登元又獲其族人為匪者李聰明、李占解獻，皆誅之。南路平。哈當阿自彰化分兵與吳大瑞、遇昌搜捕各路，埔鹽、湖仔、內埤腳、梧厝、水尾、河婆侖、四塊厝、浸水、同安寮、荷包厝凡十莊，皆賊巢穴，捕獲百余人，悉誅之，焚毀其巢；獲賊目楊成佳、黃潮與陳周全、陳光輝解郡。北路平（以上東差紀略）。
四月諭：義民首楊仲舍等能招集多人，誘獲賊首，實屬可嘉之至。除楊仲舍等四人交伍拉納等查明，照從前義民黃奠邦、郭廷筠等之例超擢官職、優加賞賚，俟事定后送部引見外，所有義民首及義民等，查明廣東是何村莊、福建是何村莊？將本年應納錢糧，均著該督撫詳查，分晰住址，概予寬免。
諭：臺灣奸民陳周全等糾眾滋事一案，伍位納身為總督，乃僅派烏蘭保帶兵前去，竟在內地安坐，并廈門亦不前往；節經降旨嚴飭，仍在內地逗遛，尚復何顏忝膺封疆重寄？伍拉納著即遵旨速赴臺灣查辦一切，仍交部嚴加議處。至前據哈當阿奏，鹿耳門外有船十余只，在洋游奕，似非商船形狀；當即連放兩炮，各船四散等語，實不成話。在洋游奕船只，既屬遙望，何以知其確非商船，即系賊船？若實系商民船只，遽行用炮擊打，豈不令商民無故受驚？且果實系賊船，正當誘其近岸，伏兵擒捕；或派兵出洋，駛船追剿，方為正辦。豈止圖賊船逃散，遂可置之不問耶？所辦實大錯謬。哈當阿亦著交部嚴加議處（以上東華錄）。
七月，臺灣地大震（東溟文后集）。
——錄自福建通紀卷十五。
仁宗嘉慶元年（一七九六）五月，大學士閩浙總督?？蛋沧溆谲?。
六月，以魁倫為閩浙總督、姚棻護理福建巡撫。
二年（一七九七）四月，姚棻以疾免，以田鳳儀為福建巡撫。
七月，田鳳儀丁憂，調費淳為福建巡撫。
以汪志伊為福建巡撫。
十一月，魁倫丁憂，以富昌署閩浙總督。
四年（一七九九）三月，以書麟協辦大學士，署閩浙總督。
七年（一八〇二）十月，以長麟為閩浙總督（以上東華錄）。
初，嘉慶四年，閩浙海盜有安南大艇幫四總兵三十余艘曰艇盜，鳳尾水澳蔡牽三幫各六七十艘、箬橫小幫浙盜二十余艘附之。時阮元為浙江巡撫，五年六月，乘風勒兵擊之。安南巨盜五、六千人及土盜小船全蕩平于臺州松門，四總兵溺死者三、磔死者一。奉旨：以總兵敕印擲還安南王阮光纘。光纘言但令總兵巡海，不慮其入浙為盜，上表謝罪。自后，安南夷寇不復入浙；其在閩者，皆為牽所并。牽，同安人（一作漳州人）；奸猾善埤闔，能使其眾。既得夷艇夷炮，大猖獗；凡商船出洋者勒稅銀四百圓，回船倍之，乃免劫。且結陸地會匪，陰濟船械、硝磺、米糧。而官修戰艦笨窳，不能放洋，轉雇商船為剿捕之用。于是阮元率官商捐金十余萬付李長庚赴閩造大艦三十，名曰霆船；鑄大炮四百余配之。賊畏霆船甚，厚賂閩商更造大于霆船者，先后載貨出洋，偽報被劫。牽得大海舶，遂能渡橫洋，窺臺灣。是年五月，復犯鹿耳門，劫臺灣米數千石，分濟粵盜朱濆，連囗〈舟宗〉八十余猝入閩；閩師不敢擊。會浙江總兵胡振聲以二十四艘運造舟木于閩，閩督玉德檄振聲擊之；而閩師不援，為賊火攻所陷，遂與同船弁兵八十余人同時死之。詔逮不援臺之金門鎮總兵吳奇貴（弟子記作海壇鎮孫大剛）、副將張世熊等治罪（揅經室二集、圣武記、雷塘庵弟子記、雕菰樓文集）。
初，浙江巡撫阮元與閩省督、撫會奏「請以李長庚為總統，一提兩鎮不分閩浙、嚴拏海盜蔡牽」折，略曰：應請令浙江提督李長庚為總統，帶浙省兵船二十只，浙江溫州鎮總兵胡振聲、福建海壇鎮總兵孫大剛為左右兩翼，各配船二十只，共船六十只。其未經飭調者，仍各領兵船在本汛巡緝；如遇提督追賊至境，一體策應。六月命下，而振聲已死。
八月，提督李長庚率四鎮兵船攻蔡牽于定海北洋，獲船一只，炮沉一只；炮幾及牽，生擒黃奎等五十二人。朱濆船被剿多傷，遂與蔡匪分散，遁回閩、廣，賊勢益孤。初，胡鎮軍陣亡后，兩省兵氣大餒；蔡匪復竄浙洋，八十余船復與粵盜朱濆相合來浙，其勢甚熾。阮元與李長庚謀，且勿輕擊，俟各鎮兵船修調齊集，乃于秋半合擊，大破之。
十一年（一八〇六）正月，玉德奏稱：蔡牽豎旗滋事，自稱鎮海王，于上年十一月二十三日搶入鳳山縣城，經官兵攻散后，賊船復駛入鹿耳門，在府城外登岸劫擄，并勾結嘉義縣匪徒洪四老等乘機滋事。奉諭：賊勢鴟張，不得不大加懲辦。所有軍火、糧餉、器械、船只等項，照軍興例動帑經理；一切均責成玉德，不可稍有貽誤。又諭：賽沖阿久歷行陣，于剿捕事宜素為諳練；見發去欽差大臣關防一顆，交該將軍行用。不拘何處接奉此旨，即由該處馳驛前赴閩省。玉德見駐之常武?？冢谠摱皆浔葥窬殢妷颜邘ьI放洋，悉力督剿。該處提督自李長庚、許文謨以下各將弁，均受該將軍節制調撥。
免蔡牽滋擾之臺灣府屬地方額賦。
以魏元烺為福建巡撫。
三月，臺灣鎮總兵官愛新泰等奏，攻克洲仔尾等處賊寨。
愛新泰奏，克復鳳山縣城。得旨嘉獎，賞云騎尉世襲（以上東華錄）。