正月二十七日（丙申），常青奏言：遵旨仍駐蚶江、廈門一帶調度策應，務期鎮靜，不敢少動聲色。時飭沿海文武員弁慎密巡查；并與撫臣曉諭居民，懸立重賞，遇有賊匪潛逃回籍，捕獲首報，總不使余孽得以漏網。又南澳總兵陸廷柱自愿赴臺剿賊，固屬急公勇往，但南澳地方緊接臺灣，關系緊要；今粵省之兵，既已派有李化龍帶領，陸廷柱自可毋庸再往，應飭令速回本任。
同日徐嗣曾奏言：林爽文本系積賊，因被拿情急，起意抗拒，而游手無賴之徒，乘機附和，烏合遂多。茲據報提臣任承恩于正月初四日放洋，副將徐鼎士等系正月初八日放洋；到臺即有先后，要亦不過數日之間。提臣黃仕簡系十二月二十八日放洋，先由南路鹿耳門進發，直抵府城。計其統轄之兵，陸續已四千八百余名，兵力已厚。又鹿仔港、北淡水兩路之兵，接續前進。雖閩人不免剽輕，而兵威愈壯，三路夾攻，必可蕆事。至賊匪林爽文，系漳州人，恐漳人因此自疑。今蒙圣明指示，無論何處民人，從賊者，即系伙黨，自應按名駢戮；果能應募拒賊，即系良民，自應加以獎賞，不應預存岐視。臣現已札飭該道府等，榜示城鄉，明白關導。現據漳浦縣羅澤坤稟報，拿獲匪犯陳樵，訊系賊匪遣回探聽官兵消息，業經督臣常青就近提審。臣以賊匪遣人探信，所遣必不止一人，并亦不止一處，嚴飭各屬慎密查拿。此后竄逃偷渡回家，亦必不少，并飭加意防范，仍懸賞格諭令親屬鄰右捕拿首報。至一應軍行供支糧餉火藥等項，督同司道妥速辦理，不敢稍有忽誤。又聞黃仕簡抵臺后，剿捕賊匪，開炮打死二千余人，賊俱星散奔逃內山，合并陳明。再，漳浦縣知縣羅澤坤、浦城縣知縣鈕琨，均經部議降調。查漳浦縣濱臨海洋，所轄舊鎮一澳與彰化縣之七鯤山相對，民俗刁悍，稽查不易；浦城縣為上游入境首站，有稽察文報之事，該二縣均不便驟易生手。又莆田縣亦系濱海要區，候補知縣郭廷魁歷署繁缺，俱能辦理裕如，臣現在委令前往署理；但亦已緣事降調。懇準將羅澤坤、鈕琨暫留漳浦、浦城之任，郭廷魁暫署莆田縣事，候剿匪事竣，再行交卸。又，閩安協副將徐鼎士，亦緣事降調，臣現令其帶印領兵，由閩安出口，前赴淡水八里坌剿捕賊匪。均奏入。
上命軍機大臣傳諭李侍堯、常青、徐嗣曾曰：現在該省兵差往來，正需熟手，所有降調人員，自應留本任，以資駕輕就熟。但該省似此等降調人員，自必尚有，李侍堯到閩后，應于剿捕事竣，會同徐嗣曾核其功過，分別辦理。此時，祗須匯總咨部存案，亦可毋庸逐員特奏也。又，徐嗣曾奏：拿獲匪犯陳樵，訊系賊匪遣回探聽官兵消息，恐所遣不止一人，亦不止一處，現經督臣提犯審訊等語。此應留心者，該督等務須嚴飭各屬慎密查拿，加意防范，毋任竄逸偷渡。
同日孫士毅奏言：現在接準閩浙督臣常青咨稱，天地會根源起于粵東，有和尚洪二房及朱姓人住居后溪鳳花亭，不知何俯何縣地方？該犯楊詠等現已解京，令臣密查辦理等因。查天地會名目起于逆犯林爽文，而根源由于該二犯平日必系素為眾匪信奉親近之人，實系何府何縣人氏，伙犯斷無不知之理。臣一面飭屬密速查拿，一面札覆常青，如再獲有他犯，將洪、朱二犯籍貫究訊明確，立即移知到臣，查拿更易。就臣臆見，總不離惠、潮二府民人。緣潮郡民人赴臺貿易者多，惠郡次之，煽惑入伙，事所應有。臣于上年臘底，即嚴飭惠、潮二府州縣密查平日曾經赴臺貿易之人，此時曾否回家？有無別項詭秘蹤跡？現據地方官拿獲數人，未經究有端倪。今思洪姓、朱姓，此時或現在臺灣抗拒官兵，或已潛回粵東，惟有即于此項貿易人內，切實追求，自不難由影響而得實際。臣已就近嚴諭潮屬州縣上緊設法偵拿。此案逆犯將來竄逸必多，必須大員專司督辦。已飛札臬司姚棻星速赴潮，不動聲色，專辦緝拿匪犯一事。省城現無緊要案件，藩司許祖京可以料理；撫臣圖薩布二月中旬，即可回任，為期亦屬不遠。又派赴廈門聽候調遣之南澳右營及澄海、海門營之兵丁五百名，分作兩起先行。其碣石鎮標之五百名，現亦到齊，接續前進。計正月初十至十六日，所有水師一千名，俱全數入閩省境。
同日左翼鎮總兵李化龍奏言：抵閩粵交界之黃岡地方，經督臣孫士毅會同署提臣彭承堯將派撥水師戰兵一千名，配足軍火器械，裹帶一月口糧，分作四起，自初十日起，間日行走；計十六日俱可入閩省詔安縣境。臣察看弁兵，俱各精壯踴躍。臣即定于十六日自黃岡起程，統領前往，聽候閩浙督臣調遣。均奏入，報聞。
二十八日（丁酉），常青奏言：聞提臣黃仕簡、總兵郝壯猷、副將丁朝雄等所帶兵船，俱于初三日自澎湖開駕，初四日進鹿耳門登岸。提臣任承恩統領各營官兵船只，于初六日齊抵鹿仔港。查臺灣郡城，前經差探，固守無虞。其鹿仔港一路，署守備陳邦光率同目兵義民四處搜捕，焚毀賊巢；復擒獲賊伙簡鳩，劉實、張文、林天球、林耽、朱開六名。并聞北淡水署都司易連、新莊巡檢王增錞統領弁兵，招集義民，屢次殺賊。惟淡水同知程峻、竹塹巡檢張芝馨，均已被害。又廈門同知劉嘉會稟稱，賊人已知大兵將到，紛紛散去等語。伏思賊匪本屬么〈麻上骨下〉烏合，今兩提臣俱經到臺，南北兩路會合搜剿，定可克期殲滅。臣惟嚴飭內地沿海各口岸，加緊巡查，以防竄逸。并飛提獲解匪犯到泉究審辦理。又浙、粵二省，前經撫臣徐嗣曾咨請酌撥戰兵，原系預為準備，俾資策應。旋準兩廣督臣孫士毅以臺地遠隔重洋，風汛靡定，先撥官兵一千由陸來廈。現在尚未到齊。臣計兩提臣捷音亦不日可到，應否再令前往，俟得有確信，隨宜斟酌。其余浙、粵備撥兵丁，仍咨明該督撫各于本境暫駐，毋庸遽行赴閩，致滋跋涉。至逆首林爽文籍屬漳人，臣因慮漳民或有勾串情事。但匪徒糾眾，豈必定為何處之人，若漳、泉民人果能應募拒賊，即系良民。臣惟有核其順逆，分別誅賞，斷不存岐視之見，少露形跡，以致漳民疑懼。奏入。
上命軍機大臣傳諭李侍堯、常青曰：昨據徐嗣曾奏稱，黃仕簡到臺后，開炮打死賊匪二千余人，賊俱星散奔逃內山等語。內山系生番巢穴，向聞遇有內地民人到彼，即行殺害。但現在賊匪被官兵追剿，窮蹙逃竄，明知一經官兵擒獲，萬無生理，或將所掠財物，賄結生番，容留藏匿；或恃其人眾脅制生番，而生番畏其兇惡，任聽竄處。并恐將來撤兵后，賊匪等轉勾結生番，潛出滋擾，更為可慮。猶不可不預行籌辦，凈其萌孽。現在水陸兩提督帶領多兵，在臺會剿，自應乘此兵力，搜剿殲除，勿令賊匪得以逃匿負嵎。但黃仕簡與任承恩均系提督，一同帶兵在彼辦理，體制不相上下；且水陸各有所轄，難以統攝。常青于辦理善后事宜，自不如李侍堯之諳練；而督率搜剿，則常青為優。著李侍堯抵閩后，即駐扎蚶江，常青即親自渡臺，督同黃仕簡統領官弁，將竄入內山賊匪余黨，盡數搜捕，務凈根株。仍不得因追捕賊匪，或致擾動生番，方為妥善。其任承恩于常青抵臺后，即令先回本任，以資彈壓。如此，庶事權歸一，有所責成。現在湖廣有舒常署理督篆，常青無須急赴新任，惟當督同黃仕簡悉心妥辦，鎮戢海疆，以為一勞永逸之計。再臺灣地方，前聞楊景素在道員任內，設立土牛分別內外地界，其是否辦理妥協？并著常青會同黃仕簡于剿捕事竣后，親往履勘，斟酌妥善，歸于善后事宜內，一并妥辦。
二十九日（戊戌），常青奏言：官兵登舟之后，雖因風阻不能迅速直達，但節次探明臺灣郡城固守無虞。其鹿仔港及臺北之艋舺等境，均有官兵及義民人等互相保護，較之從前朱一貴滋事，全臺失陷一案，情形已屬不同。且兩提臣俱經率師前往，更易辦理。臣已傳知該提臣等務須并力合攻，以期一舉蕆事。一俟得有收復各縣及殲匪情形，即將拿獲首伙各犯，該處迅速正法。并將一切善后事宜，留交黃仕簡辦理。奏入。
上命軍機大臣傳諭李侍堯、常青曰：本日，常青由六百里加緊奏到一摺，以為剿滅臺灣逆賊之信，及至拆看，祗系覆奏事件，又何必由驛馳遞，徒勞驛馬乎！常青何不知事體輕重若此。前曾有旨，令藍元枚赴閩署理陸路提督，并諭常青探聽臺地消息，一俟蕆功，即可傳知，藍元枚行抵何處，速回江南本任。今思任承恩在臺統兵會剿，于該處情形皆所目擊，而松江提督已有人署理，現無緊要應辦之事。著常青自抵臺后，即令任承恩迅速馳驛來京，候朕面加詢問一切。其福建陸路提督著藍元枚仍行署理，毋須即回江南本任。至林爽文、王芬二犯，系此案首惡渠魁，如經官兵生獲，著該督等派委妥干員弁解京審辦；并飭該委員等沿途小心，加意防范，毋得稍有疏虞，致干咎戾。
二月初一日（巳亥），徐嗣曾奏言：聞淡水守備董得魁招集泉民，剿捕賊匪。十二月十八日，有原署淡水同知程峻之幕友壽同春，用計退賊，會同俸滿巡檢李生椿及塹城書院掌教之原任榆林縣知縣孫讓，率勵義勇，收復竹塹，追獲賊匪王作等三十余人正法。
該守備馳往塹城，協同守御。又署淡水都司易連、新莊巡檢王增錞于十二月二十三及二十六、七、八等日，分路剿殺大姑坑等處賊匪，官兵、義民各皆奮勇，殺賊百余人、數十人不等；先后擒獲陳軒等十名正法；奪獲旗桿器械。義民間有受傷。賊匪雖屢經剿殺，旋散，旋聚。現聞提臣黃仕簡、總兵郝壯猷皆于初四日由鹿耳門登岸，賊匪知大兵已到，紛紛散去。黃仕簡定于十三日前往收復諸羅。陸路提臣任承恩初六日抵鹿仔港登岸，亦定于十三日分兵進剿。查鹿仔港、鹿耳門相距頗遠，兩提臣先后進口，皆克期于十三日剿賊，正與圣訓相符。而鹿仔港署守備陳邦光，于提臣任承恩未到之先，又擒獲賊匪簡鳩等六名。鹿仔港與北淡水相去較近，徐鼎士等兵抵北淡水，又復適當其時，三路圍攻，自必一舉蕆事。此時沿海一帶，猶宜嚴密截拿，防其竄逸。但賊匪內竄，必不敢由正口逕入，自漳、泉、興化至福州、福寧濱海各縣，〈氵義〉港紛岐，在在皆可偷渡。臣先已嚴飭文武員弁選撥兵役，于凡可偷渡之處，羅織巡查。現復通飭，以賊匪洗蕩在即，加意堵防，毋使一名漏網。至郡城既保守無虞，而彰化、淡水等處，又有鄉勇、義民協同剿御：大兵一到，賊即紛紛逃潰。不但無須鄰省策應，即本省官兵亦不值多為調派。臣知識短淺，身親其事，不能辨晰，實深感愧！奏入。