- 蛋白質(zhì)結合位點預測及輔助分子對接
- 邱智軍
- 293字
- 2022-01-14 22:03:02
1.2.2 二級結構
蛋白質(zhì)或肽的線性延伸鏈段具有不同的、特征性的局部結構構象,稱為二級結構,其形成主要依賴于氫鍵。二級結構的兩種主要類型是α-螺旋和β-折疊。
α-螺旋是右旋螺旋。α-螺旋中氨基酸的側(cè)鏈取代基向外延伸,氫鍵形成于鏈中每個CO的氧和螺旋線中其后第四個N—H的氫之間。氫鍵使這種結構變得特別穩(wěn)定。氨基酸的側(cè)鏈取代基位于N—H基團之外。
β-折疊中的氫鍵是在肽鏈之間(股間)而不是肽鏈之內(nèi)(股內(nèi))。折疊構象是由成對并排排列的股線組成的。單鏈上的羰基氧與相鄰鏈上的氨基氫鍵合。兩股線可以是平行的,也可以是反平行的,這取決于股線方向(N端到C端)是相同還是相反。反平行的β-折疊由于氫鍵排列較為整齊而更加穩(wěn)定。