是時大禮議起，先生夜坐碧霞池，有詩曰：“一雨秋涼入夜新，池邊孤月倍精神。潛魚水底傳心訣，樓鳥枝頭說道真。莫謂天機非嗜欲，須知萬物是吾身。無端禮樂紛紛議，誰與青天掃舊塵？”又曰：“獨坐秋庭月色新，乾坤何處更閑人？高歌度與清風去，幽意自隨流水春。千圣本無心外訣，《六經》須拂鏡中塵。卻憐擾擾周公夢，未及惺惺陋巷貧。”蓋有感時事，二詩已示其微矣。
四月，服闋，朝中屢疏引薦。霍兀涯、席元山、黃宗賢、黃宗明先后皆以大禮問，竟不答。
十月，門人南大吉續刻《傳習錄》。
《傳習錄》薛侃首刻于虔，凡三卷。至是年，大吉取先生論學書，復增五卷，續刻于越。
四年乙酉，先生五十四歲，在越。
正月，夫人諸氏卒。四月，祔葬于徐山。
是月，作稽山書院《尊經閣記》。略曰：“圣人之扶人極憂后世而述《六經》也，猶之富家者之父祖，慮其產業庫藏之積，其子孫者或至于遺亡失散，卒困窮而無以自全也，而記籍其家之所有以貽之，使之世守其產業庫藏之積而享用焉，以免于困窮之患。故《六經》者，吾心之記籍也，而《六經》之實則具于吾心；猶之產業庫藏之實，種種色色，具存于其家，其記籍者，特名狀數目而已。而世之學者不知求《六經》之實于吾心，而徒考索于影響之間，牽制于文義之末，硁硁然以為是《六經》矣。是猶富家之子孫，不務守成規享用其產業庫藏之實積，日遺忘散失，至于窶人丐夫，而猶囂囂然指其記籍曰：‘斯吾產業庫藏之積也。’何以異于是？”
按，是年南大吉匾蒞政之堂曰“親民堂”，山陰知縣吳嬴重修縣學，提學僉事萬潮與監察御史潘仿拓新萬松書院于省城南，取試士之未盡錄者廩餼之，咸以記請，先生皆為作記。
六月，禮部尚書席書薦。
先生服闋，例應起復，御史石金等交章論薦，皆不報。尚書席書為疏特薦曰：“生在臣前者見一人，曰楊一清；生在臣后者見一人，曰王守仁。且使親領誥卷，趨闕謝恩。”于是楊一清入閣辦事。明年有領卷謝恩之召，尋不果。
九月，歸姚省墓。
先生歸，定會于龍泉寺之中天閣，每月以朔望初八廿三為期。書壁以勉諸生曰：“雖有天下易生之物，一日暴之，十日寒之，未有能生者也。承諸君子不鄙，每予來歸，咸集于此，以問學為事，甚盛意也。然不能旬日之留，而旬日之間又不過三四會。一別之后，輒復離群索居，不相見者動經年歲。然則豈惟十日之寒而已乎？若是而求萌蘗之暢茂條達，不可得矣。故予切望諸君勿以予之去留為聚散，或五六日，八九日，雖有俗事相妨，亦須破冗一會于此。務在誘掖獎勸，砥礪切磋，使道德仁義之習日親日近，則勢利紛華之染亦日遠日疏：所謂相觀而善，百工居肆以成其事者也。相會之時，尤須虛心遜志，相親相敬。大抵朋友之交，以相下為益，或議論未合，要在從容涵育，相感以成；不得動氣求勝，長傲遂非，務在默而成之，不言而信。其或矜己之長，攻人之短，粗心浮氣，矯以沽名，訐以為道，挾勝心而行憤嫉，以圮族敗群為志，則雖日講時習于此，亦無益矣。”
答顧東橋璘書有曰：“朱子所謂格物云者，是以吾心而求理于事事物物之中，如求孝子之理于其親之謂也。求孝之理果在于吾之心耶？抑果在于親之身耶？假而果在于親之身，而親沒之后，吾心遂無孝之理與？見孺子之入井，必有惻隱之理，是惻隱之理果在孺子之身與？抑在于吾身之良知與？以是例之，萬事萬物之理，莫不皆然。是可以見析心與理為二之非矣。若鄙人所謂致知格物者，致吾心之良知于事事物物也。吾心之良知，即所謂天理也。致吾心之天理于事事物物，則事事物物皆得其理矣。故曰：‘致吾心之良知者，致知也。事事物物皆得其理者，格物也。’是合心與理而為一者也。合心與理而為一，則凡區區前之所云，與朱子晚年之論，皆可不言而喻矣。”又曰：“心者身之主也，而心之虛靈明覺，即所謂本然良知也。其虛靈明覺之良知應感而動者，謂之意；有知而后有意，無知則無意矣。知非意之體乎？意之所用，必有其物，物即事也，如意用于事親，即事親為一物；意用于治民，則治民為一物；意用于讀書，即讀書為一物；意用于聽訟，即聽訟為一物；凡意之所在，無有無物者，有是意，即有是物，無是意，即無是物。物非意之用乎？‘格’字之義，有以‘至’字訓者。如‘格于文祖’，必純孝誠敬，幽明之間，無一不得其理，而后謂之格；有苗之頑，實文德誕敷而后格，則亦兼有‘正’字之義在其間，未可專以‘至’字盡之也。如‘格其非心’，‘大臣格君心之非’之類，是則一皆正其不正以歸于正之義，而不可以‘至’字為訓矣。且《大學》格物之訓，又安知不以‘正’字為義乎？如以‘至’字為義者，必曰窮至事物之理，而后其說始通。是其用功之要全在一‘窮’字，用力之地全在一‘理’字也。若上去一‘窮’字，下去一‘理’字，而直曰‘致知在至物’，其可通乎？夫窮理盡性，圣人之成訓見于《系辭》者也。茍格物之說而果即窮理之義，則圣人何不直曰‘致知在窮理’，而必為此轉折不完之語，以啟后世之弊耶？蓋《大學》格物之說，自與《系辭》窮理大旨雖同，而微有分辨。窮理者，兼格致城正而為功也；故言窮理，則格致誠正之功皆在其中；言格物，則必兼舉致知、誠意、正心，而后其功始備而密。今偏舉格物而遂謂之窮理，此非惟不得格物之旨，并窮理之義而失之矣。”其末繼以拔本塞源之論，其略曰：“圣人之心，視天下之人無內外遠近，凡有血氣，皆其昆弟赤子之親，莫不安全而教養之，以遂其萬物一體之念。天下之人心，其始亦非有異于圣人也，特其間于有我之私，隔于物欲之蔽；大者以小，通者以塞，甚有視其父子、兄弟如仇仇者。圣人有憂之，是以推其天地萬物一體之仁以教天下，使之皆有以克其私、去其蔽，以復其心體之同然。其教之大端，則堯、舜、禹之相授，所謂‘道心惟微，惟精惟一，允執厥中’。而其節目，則舜之命契，所謂‘父子有親，君臣有義，夫婦有別，長幼有序，朋友有信’五者而已。當是之時，人無異見，家無異習，安此者謂之圣，勉此者謂之賢，而背此者，雖啟明如朱，亦謂之不肖。下至閭井田野農工商賈之賤，莫不皆有是學，而惟以成其德行為務。何者？無有聞見之雜，記誦之煩，辭章之靡濫，功利之馳逐，而但使之孝其親，弟其長，信其朋友，以復其心體之同然，則人亦孰不能之乎？學校之中，惟以成德為事；有長于禮樂，長于政教，長于水土播植者，則就其成德而因使益精其能。迨夫舉德而任，則用之者惟知同心一德，以共安天下之民，視才之稱否，而不以崇卑為輕重；效用者亦惟知同心一德，以共安天下之民，茍當其能，則終身安于卑瑣而不以為賤。當是時，才質之下者，則安其農工商賈之分，各勤其業以相生相養，而無有乎希高慕外之心；才能之異若皋、夔、稷、契者，則出而各效其能，或營衣食，或通有無，或備器用，集謀并力，以求遂其仰事俯育之愿。譬之一身，目不恥其無聰，而耳之所涉，目必營焉；足不恥其無執，而手之所探，足必前焉；蓋其元氣充周，血脈條暢，是以癢疴呼吸，感觸神應，有不言而喻之妙。此圣人之學所以惟在復心體之同然，而知識技能，非所以與論也。三代以降，教者不復以此為教，而學者不復以此為學。霸者之徒，竊取先生之近似者，假之于外以內濟其私，天下靡然宗之，圣人之道遂以蕪塞。世之儒者慨然悲傷，蒐獵先圣王之典章法制，而掇拾修補于煨燼之余，圣學之門墻遂不可復觀。于是乎有訓詁之學，而傳之以為名；有記誦之學，而言之以為博；有詞章之學，而侈之以為麗。相矜以知，相軋以勢，相爭以利，相高以技能，相取以聲譽。其出而仕也，理錢谷者，則欲并夫兵刑；典禮樂者，又欲與于銓軸；處郡縣，則思藩臬之高；居臺諫，則望宰執之要。故不能其事，則不得以兼其官；不通其說，則不可以要其譽；記誦之廣，適以長其敖也；知識之多，適以行其惡也；聞見之博，適以肆其辯也；辭章之富，適以飾其偽也。嗚呼！以若是之積染，以若是之心志，而又講之以若是之學術，宜其聞吾圣人之教，而視之以為贅疣柄鑿矣。非豪杰之士無所待而興者，吾誰與望乎！”
十月，立陽明書院于越城。
門人為之也。書院在越城西郭門內光相橋之東。后十二年丁酉，巡按御史門大周汝員建祠于樓前，匾曰：“陽明先生祠”。
五年丙戌，先生五十五歲，在越。
三月，與鄒守益書。
守益謫判廣德州，筑復古書院以集生徒，刻《諭俗禮要》以風民俗。書至，先生復書贊之曰：“古之禮存于世者，老師宿儒當年不能窮其說，世之人苦其煩且難，遂皆廢置而不行。故今之為人上而欲導民于禮者，非詳且備之為難，惟簡切明白而使人易行之為貴耳。中間如四代位次，及祔祭之類，向時欲稍改以從俗者，今昔斟酌為之，于人情甚協。蓋天下古今之人，其情一而已矣。先王制禮，皆因人情而為之節文，是以行之萬世而皆準。其或反之吾心而有所未安者，非其傳記之訛闕，則必古今風氣習俗之異宜者矣。此雖先王未之有，亦可以義起，三王之所以不相襲禮也。后世心學不講，人失其情，難乎與之言禮。然良知之在人心，則萬古如一日，茍順吾心之良知以致之，則所謂不知足而為屨，我知其不為蕢矣。非天子不議禮制度，今之為此，非以議禮為也，徒以末世廢禮之極，聊為之兆以興起之，故特為此簡易之說，欲使之易知易從焉耳。冠婚喪祭之外，附以鄉約，其于民俗亦甚有補。至于射禮，似宜別為一書以教學者，而非所以求諭于俗。今以附于其間，卻恐民間以非所常行，視為不切；又見其說之難曉，遂并其冠婚喪祭之易曉者而棄之也。文公《家禮》所以不及于射，或亦此意也與？”
按祠堂位祔之制。
或問：“文公《家禮》高曾祖禰之位皆西上，以次而東，于心切有未安。”先生曰：“古者廟門皆南向，主皆東向。合祭之時，昭之遷主列于北牖，穆之遷主列于南牖，皆統于太祖東向之尊，是故西上，以次而東。今祠堂之制既異于古，而又無太祖東向之統，則西上之說誠有所未安。”曰：“然則今當何如？”曰：“禮以時為大，若事死如事生，則宜以高祖南向，而曾祖禰東西分列，席皆稍降而弗正對，似于人心為安。曾見浦江之祭，四代考妣皆異席，高考妣南向，曾祖禰考皆西向，妣皆東向，各依世次，稍退半席。其于男女之別，尊卑之等，兩得其宜。但恐民間廳事多淺隘，而器物亦有所不備，則不能以通行耳。”又問：“無后者之祔，于己之子侄，固可下列矣，若在高曾之行，宜何如祔？”先生曰：“古者大夫三廟，不及其高矣。適士二廟，不及其曾矣。今民間得祀高曾，蓋亦體順人情之至，例以古制，則既為僭，況在行之無后者乎？”古者士大夫無子，則為之置后，無后者鮮矣。后世人情偷薄，始有棄貧賤而不嗣者。古所謂無后，皆殤子之類耳。祭法：王下祭殤五，適子，適孫，適曾孫，適玄孫，適來孫。諸侯下祭三，大夫二，適士及庶人祭子而止。則無后之祔，皆子孫屬也。今民間既得假四代之祀，以義起之，雖及弟侄可矣。往年湖湘一士人家，有曾伯祖與堂叔祖皆賢而無后者，欲為立嗣，則族眾不可，欲弗祀，則思其賢有所不忍。以聞于某。某曰：‘不祀二三十年矣，而追為之祀，勢有所不行矣。若在士大夫家，自可依古族屬之義，于春秋二社之次，特設一祭。凡族之無后而親者，各以昭穆之次配祔之，于義亦可也。’”
四月，復南大吉書。
大吉入覲，見黜于時，致書先生，千數百言，勤勤懇懇，惟以得聞道為喜，急問學為事，恐卒不得為圣人為憂，略無一字及于得喪榮辱之間。先生讀之嘆曰：“此非真有朝聞夕死之志者，未易以涉斯境也！”于是復書曰：“世之高抗通脫之士，捐富貴，輕利害，棄爵祿，決然長往而不顧者，亦皆有之。彼其或從好于外道詭異之說，投情于詩酒山水技藝之樂，又或奮發于意氣，牽溺于嗜好，有待于物以相勝，是以去彼取此而后能。及其所之既倦，意衡心郁，情隨事移，則憂愁悲苦，隨之而作，果能捐富貴，輕利害，棄爵祿，快然終身，無入而不自得已乎？夫惟有道之士，真有以見其良知之昭明靈覺，廓然于太虛而同體。太虛之中，何物不有，而無一物能為太虛之障礙。故凡慕富貴，憂貧賤，欣戚得喪，愛憎取舍之類，皆足以蔽吾聰明睿知之體，窒吾淵泉時出之用。如明目之中而翳之以塵沙，聰耳之中而塞之以木楔也。其疾痛郁逆，將必速去之為快，而何能忍于時刻乎？關中自古多豪杰。橫渠之后，此學不講，或亦于四方無異矣。自此有所振發興起，變氣節為圣賢之學，將必自吾元善昆季始也。今日之歸，謂天為無意乎？”
答歐陽德書。