乙酉五月，南都失守。總兵官鄭鴻逵、鄭彩退師回閩，會唐王從河南來，奉之至福州；與巡撫張肯堂、巡按吳春枝、原任禮部尚書黃道周、南安伯鄭芝龍等，共議唐王監國。王太祖后，封南陽。初失愛于祖父，兩叔謀奪嫡，未得請名；及祖端王薨，守道陳奇瑜、知府王之柱為之請，得嗣。后以統兵勤王，擅離南陽，錮高墻；會赦，出。性率直；喜詩書，手草傳檄，灑灑數千言。鴻逵請正位以饜眾心，芝龍意別有在，固爭以為不可。諸大臣皆言監國名正，俟出關尺寸，建號未遲。而李長倩亦疏言急出關、緩正位，示監國無富天下之心；不報。擁戴臣貪定策功，不數日，即位于福州；改元隆武，大赦。時閏六月十五日也。是日，郊天。大風拔木揚沙，駕回宮，尚寶司卿坐馬忽驚躍，玉璽墮地，損一角；人咸異之。改福州為天興府，以布政司為大內。封鄭芝龍平虜侯、鄭鴻逵定虜伯、鄭芝豹澄濟伯、鄭彩永勝伯。設六部九卿，以張肯堂為吏部尚書、李長倩為戶部尚書、曹學佺為禮部尚書、吳春枝為兵部尚書、周應祥為刑部尚書、鄭瑄為工部尚書、馬思禮為通政司使、鄭廣英為錦衣衛都督。以天興、建寧、延平、興化四府為上游，汀州、邵武、漳州、泉州四府為下游，各設撫按。起蔣德璟、黃道周、黃景昉、蘇觀生、何楷、陳洪謐、林欲楫、朱繼祚、黃鳴俊為大學士。改庶吉士為庶萃士；命蘇觀生主之，以招選賢才。又起曾櫻、何吾騶、郭維經、葉廷柱入閣辦事。閣臣至二十余員；其遠不能至者，尚有王應熊、楊廷麟等，僅列其名。其有票旨，隆武帝手為之；閣臣閑居而已。德璟、景昉、欲楫力疏辭；行人以死請，乃至。德璟陛見，首請親屯、練軍。集廷臣議戰守，兵定二十萬：自仙霞關而外宜守者一百七十處，計十萬；其十萬，今冬精練、明春出關，一出浙東、一出江西。統二十萬之兵，合八閩、兩浙、兩粵之餉計之，尚不給；然竟成筑舍。
時內外文武濟濟，然兵餉、戰守悉委之芝龍。芝龍，泉州人；城南三十瑞安平鎮，其故府在焉。芝龍從幼在海為盜，凡海盜皆其故盟、或其門下。自就撫后，海舟非鄭氏旗號不能往來；每舟例入三千金，歲入以千萬計，富擬于國。自筑城安平，海梢直逼，臥內可徑達海。守城兵餉皆自給，不取于官；旗幟鮮明，戈甲堅利。盜有遁入海者，檄付芝龍，取之如寄。弟芝虎，勇冠三軍；昔征劉香老，歿于海。次鴻逵、次芝豹：一門聲勢赫奕東南。芝龍開府城南，坐見九卿，入不揖、出不送。其貴倨如此。
粵西靖江王某，于八月亦稱監國，不奉詔；舉兵將東，廣西巡撫瞿式耜移書丁魁楚為備，又檄思恩參將陳邦傅防梧。靖江王遣桂平道井濟促式耜入見，式耜不往。末幾，靖江王提兵至梧，命式耜易朝服朝，式耜不從；以兵脅之，卒不奪。靖江王旋為魁楚所敗，返桂林。時粵西總兵楊國威亦從靖江王，式耜授計于焦璉（國威旗鼓），而邦傅亦應檄至，遂擒靖江王及國威并吏科給事顧奕等；械至，斬之。封魁楚伯爵，式耜進兵部侍郎。
時浙東亦奉魯王監國。先最，清兵入杭州，潞王以城降，原任巡撫祁彪佳赴水死。左都御史劉宗周不食死；有絕命詞云：『留此旬日死，少存匡濟意；決此一朝死，了我平生事。慷慨與從容，何難亦何易』！又示婿秦示瞻詩云：『信國不可為，偷生豈能久！止水與迭山，只爭死先后；若云袁夏甫，時地皆非偶。得正而弊矣，庶幾全所受』。門人會稽諸生王毓蓍聞變，即遺書先生云：『愿先生早自決，毋為王炎午所吊』！即投泖橋而死。儒士潘集奔東渡橋，袖石自沉死。周卜年赴海死。大學士高弘圖流寓紹興城外，至野寺不食死。原任山西僉事鄭之尹子遵謙殺浙江招撫使某于江上，遂同張國維、方逢年、柯夏卿、宋之普、陳函輝、陳汝霖、孫嘉績等迎立魯王于臺。會朱大典于金華亦遣唐玨上表勸進，王遂監國于紹興。以國維、逢年、之普為大學士。國維督師江上，賜上方劍行事；其子世鳳為將軍。封方國安荊國公，守嚴州；張鵬翼永豐伯，守衢州；鄭遵謙義興伯、王之仁武安伯。補陳潛夫原任御史，加太仆寺少卿，監各藩鎮兵馬。七月，復富陽；八月，復于潛。時兵馬雖集，各不相統，部曲騷然。國維疏請『克期會戰，則彼此迭入，我有番休之逸；而攻堅搗虛，敵無應接之暇。且必聯諸帥之心化為一心，然后可使人人之功罪化為一人之功罪』。馬士英奉弘光帝太妃至紹興，人士猶未知弘光所在。國維首疏參馬士英誤國十大罪；土英懼，不敢入朝。原任禮部囗囗王思任疏請斬士英以謝天下；王疏云：『戰斗之氣，必發于忠憤之心；忠憤之心，又發于廉恥之念。事至今日，人人無恥、在在不憤矣。所以然者，南都定位以來，從不曾真真實實講求報雪也。主上寬仁有余而剛斷不足，心惑奸相馬士英援立之功，將天下大計盡行交付。而士英公竊太阿，肆無忌憚；窺上之微，而有以中之。上嗜飲，則進囗〈酉靈〉醁；上悅色，則獻妖淫；上喜音，則貢優鮑；上好玩，則奉古董。以為君逸臣勞，而以疆場擔子一肩推與史可法；又心忌其成功，而決不照應之。每一出朝，招集無賴賣官鬻爵，攫盡金珠；而四方狐狗輩愿出其門下者，得一望見費至百金、得一登簿費至千金。以至文選、職方乘機打劫，巡撫、總督見兌即題。其余編頭修腳、服錦橫行者，不在話下矣。所以然者，士英獨掌朝綱、手握樞柄，知利而不知害、知存而不知亡，朝廷篤信之以至于此也！茲事急矣，政本閣臣可以走乎？兵部尚書可以逃乎？不戰、不守而身擁重兵，口稱護太后之駕；則圣駕獨不當護耶？一味欺蒙、滿口謊說，英雄所以解體、豪杰所以灰心也，及今猶可呼號泣召之際，太后宜速趣上照臨出政，斷酒絕色、臥薪嘗膽；立斬士英之頭傳示各省，以為誤國欺君之戒。仍下哀痛罪己之詔，以昭悔悟；則四方之人心、士氣猶可復振，而戰鼓可厲、苞桑可固也』。乙酉五月，又上揭土英云：『為一人定國，可以因敗為功；千載留名，可以去邪從正事。閣下文采風流、才情義俠，職所素欣者慕者。
即當國破眾疑之際，援立今上，毅然主之，以定時局；豈不中外悅服，以為古之郭汾陽、今之于少保也，何快何幸！然而一立之后，閣下氣驕腹滿，政本自由、兵權獨握，從不讓戰守之事，只知貪黷之謀。酒色逢君、門墻固黨，以致人心解體、士氣不揚，叛兵至則束手無策、強敵來而先期以走。致令乘輿播遷、社稷邱墟；高皇帝鼎鍾之華闕，麏聚腥膻。閣下謀國至此，即喙長三尺，亦何以自解也！憤極神人、懼兼夷夏，恐閣下展轉清夜，夢寐亦不得安！略計將來，良心亦不盡死。以職上計，莫若明水一孟，自刎以謝天下：則忠憤節義之士，尚爾相亮無他；閣下妻孥子孫，庶幾可留苗裔。若但求全首領，亦當立解樞權，授之才能、清正大臣以號召英雄、豪杰，呼號惕厲，猶可幸望中興；所謂一人定國者也。如或逍遙湖上、潦倒煙霞，仍效賈似道之故轍，則千古笑齒已經冷絕。再不然，如伯嚭渡江，吾越乃報仇雪恥之國、非藏垢納污之區也！職當先越胥濤，乞素車白馬以拒閣下；上干洪怒，死不贖辜。閣下以國法處之，則當束身以候緹騎；以私法處之，則當引領以待鋤麑。言粗意妄，不勝皇恧』！第二揭云：『為明主宜明、正人宜正，懇乞亟請皇上當陽以還剝復事。某伏處林泉，耄病無識。然聞道路悲啼，仳離逃竄，岌乎殆哉，朝不保夕矣！輒歡國家之事，遂至于此！詢問乘輿，俱云不知去向。堂堂天子，可以喝招乎？可以寄放乎？可以藏匿乎？閣下自許，豈不附于正臣；然皇上乃大明之主也，當曉然與眾共知。啟蹕何日？駐蹕何方？經過行在，委曲圖存。自當一一大書，布告中外。而今閣下以揆首樞元拋撇主人，擁兵自衛，托言護太后駕來，亦如虜中事，謂之「攝政」；豈不羞須眉而喪衣冠之氣耳？閣下身為大臣，又為親臣、愛臣，形影相依、呼吸相屬，豈有不知今上所在者！而詭秘若此，無非慮虜之追上，而且自為逃也。正乎？不正乎？皇上何以待閣下，而閣下設心至此，天容之否！且某聞之：君猶日也；日有晦、有蝕，而天上斷無二日之理。天上不可一日無日，則天下不可一日無君。今帝座虛十幾日矣，有何妙用、有何奇謀？某以為光明正大，仍是我朝君相之事；若再欺蒙茍且、不明不白則中囗囗囗囗囗閣下主何意矣！近聞黃靖南戰勝，虜遁。閣下即當從皇上所在，立請復至留都；如皇上駕在浙境，亦當請至會城，定位以安天下，庶為正理，閣下仍猶不失為正臣。嗟乎！閣下果肯盡忠如靖南之戰，皇上既已親征，正是祈父戮力之時；而閣下星夜走避，帶此十萬兵至浙何為？閣下勿謂天下人盡無手眼；考終命三字不易，子孫三族所系也，閣下試低頭思之』！十月，清兵至囗囗，方國安嚴陣御之；國維率王國斌、趙天祥策應，追戰于草橋門。會天大風雨，炮石俱不得發，遂各斂兵；清兵營木城于沿江。閩中詔至，諸求富貴者爭應之；監國遂下令返臺，士民復皇皇。國維馳至紹興，上疏隆武帝曰：『國當大變，凡為高皇帝子孫，當同心戮力，興復大業。俟成功之后，入關者王之；監國退居藩服，禮誼昭然。若以倫敘叔侄定分，在今日原未假易。且監國當人心奔散之日，鳩集為勞；一旦南拜正朔，鞭長不及遙制，唇亡齒寒。猝然有變，悔何可追！臣，老臣也；豈若朝秦暮楚之客哉』！疏入，議始定，而浙、閩已成水火矣。
閩餉不足，芝龍遣給事中梁應奇入粵督餉。應奇往，參遲誤者數十人；命提問，亦莫應。潮州知府楊球遂止越界，不敢入。芝龍又命撫按以下，皆捐俸助餉。官助之外，有紳助；紳助之外，有大戶助。又借征次年錢糧；又察括府縣庫積年存銀未解者，厘毫皆解。又大鬻官爵，部司價銀三百兩，后減至百兩；武札僅數十兩，或數兩。于是倡優廝隸，盡列冠裳；然無俸、無衙，空名而已。其黠者，倩軒蓋、顧仆役，拜謁官府、鞭撻里鄰。晉江令金允治蒞訟，兩造稱職官，則立而語，互毆于庭不可制；受害者延頸。然猶苦餉不足，所招關門兵不過疲癃數百人耳。時廷臣請出關者章滿公交車，隆武亦欲躬履行間，而芝龍以缺餉為辭；十月，會后至，乃暫止。
初，隆武帝孑身南來，鴻逵以所掠美人十二獻。及后至，乃大興將作，擴構宮殿；卮匜之器，悉用黃金。開織造府，造龍袍；后服下體，皆織龍鳳形。后性警敏，頗知書，有賢能聲。每召對奏事，后于屏后共決進止；隆武帝頗嚴憚之。而尚未有嗣，芝龍乃令子森入，賜國姓，改名成功。每伺隆武帝意所向，輒先告芝龍；由是，廷臣無敢異同者，宰相半出其門下。何楷與芝龍爭朝班不合，乞歸；中途被盜截其耳，詔求賊不得。給事中劉中藻亦以忤鄭氏去。或密以鄭氏攬權告隆武帝，帝切實芝龍。芝龍怒，佯謝事；帝隨固留曰：『此非朕意，乃某人言也』。芝龍潛中傷之。于是，左右無一同心者矣。南來無賴之徒，爭上疏談兵，即得召對；片言合旨，賚寶錠、賜官爵。久之漸多，部曹幾及千人；所賞，芝龍亦不應。隆武心知芝龍不可恃，卒無以制之。芝龍亦以不出關無以饜眾心，乃分兵為二，聲言萬人，實不滿千人；以鄭鴻逵為大元帥出浙東、鄭彩為副元帥出江西。隆武仿淮陰故事，筑壇于郊，拜而送之。既出關，疏稱候餉，駐不行。月余，內催二將檄如雨，而切責鄭彩『畏縮不前，自有國法在』！不得已，逾關行四、五百里而還；仍疏言餉絕，留如故。
于是黃道周以師相請募兵江西。江西多其子弟，愿俱效死軍前；芝龍不與一錢，隆武給空札百函為行資而已。道周以札號召門下，得百人；居吉安，與楊廷麟、萬元吉為呼應。出兵徽州，被擒；械送江寧。道周絕粒不食，十四日不死。內院洪承疇疏救，言『道周清節夙學，負有重望。今罪在不赦，而臣察江南人情無不憐憫痛惜道周者，伏望皇上赦其重罪，待以不死』。上不允。尋同中書賴雍、蔡繼謹等死于西市。
吏部尚書張肯堂與郎中趙玉成疏言：『臣等生長海濱，請以水師千人由海道直抵金山，襲取金陵，以迎陛下』。隆武帝大喜，促芝龍造舟，芝龍笑諾。會有言水師諸臣宜留其眷屬以防潛逸者，帝遂止。
丙戌春，以足板（？）擲蔣德璟，幾傷。隆武帝決意親征；二月，駐建寧。楚撫何騰蛟、江右楊廷麟皆具疏迎請，隆武帝欲往江右，意未決；而芝龍固請回閩，閩人數萬呼擁，因駐蹕劍津。而以兵部尚書吳春枝留守，晉大學士；辭不受，留駐浦城。蔣德璟自請行關，相機督戰；隆武許之。比至，則疲兵弱卒、朽甲鈍戈，無一可為；德璟告病去。而戶部尚書李長倩以餉不繼，憂死；提學御史毛協恭亦憤卒。六月，吳炳自江右單騎入關，命以布政提調棘闈；而用編修劉以修為主試官，取中舉子葉瓚等百余人。一時（？）皇子誕生，群臣表賀，有「日月為明、止戈為武」語；隆武嗟賞。大赦，覃恩。凡鄭氏廝養，俱得三代對誥；撰敕織軸者，日不暇給。時兵弱餉匱，當事無談及者；舉朝如醉如夢，不待識者而知其敗矣。
時清遣大學士洪承疇經略江南、御史黃熙胤招撫福建，皆晉江人，與芝龍同里，芝龍密遣人通款；而隆武帝日與魯監〔國〕相仇。監國遣都督陳謙、行人林垐奉使，趑趄未敢入關；芝龍以書招之，乃入。陛見，啟函稱皇叔父，而不稱陛下；隆武帝大怒，下二人獄。芝龍疏救，不聽。陳謙者，武進人；乙酉春，赍弘光詔封芝龍為南安伯。比啟讀，券乃誤書「安南」；謙謂芝龍曰：『安南則兼兩廣，南安僅一邑耳。請留券而易詔，更進伯為侯』。芝龍大喜，厚贈而別，及半途而南京變；芝龍素德謙。有鎮江錢邦芑者，本出芝龍門下；以召對稱旨，擢為御史，為隆武信任。密啟曰：『陳謙為魯心腹，且與鄭至交；不急除，恐有內變』！或以告芝龍；芝龍謂刑所必經其門，臨期救之未晚。至夜半，內傳片楮，別移謙斬之。芝龍聞，伏尸哭極哀，以千金、百布葬謙；為文以祭，有「我雖不殺伯仁，伯仁由我而死」之語。遂疏稱『海寇狎至，今三關餉取之臣，臣取之海；無海則無家，非遄征不可』。拜表即行。中使手敕云：『先生稍遲，朕與先生同行』！及之河，則飛帆已過延平矣。芝龍既去，守關將施福聲言缺餉，盡撤兵還安平；蓋微聞錢塘信也。
錢塘自正月至三月，各營皆西望心裂；王之仁疏言：『始事之日，人人有直取黃龍之志；乃一敗之后，遂欲以錢搪為鴻溝。天下事何忍言！臣今惟有前死一策，以所隸舟師決戰。今日欲死，猶戰而死；他日即死，恐不能戰也』！三月朔，清兵開堰驅舟入江。國維命之仁統舟師江心接戰；值東南風作，之仁揚帆奮擊，國維督諸軍渡江。會隆武帝命陸清源變詔至江犒師，馬士英嗾方國安斬之；且出檄數隆武帝過。國維曰：『禍在此矣』！四月，清兵守杭州；監國議抽兵命國維西征，而以禮部尚書余煌兼兵部事，督師江上。時清貝勒王屯兵北岸，江涸可試馬；用炮擊南營，碎國安廚鍋。國安曰：『天奪吾食也』！因念隆武帝曾以手敕相招，往必大用；否亦可入滇、黔。遂于五月二十七夜拔營走紹興，劫監國南行。次日，江上諸師聞之，俱潰；鄭遵謙移貲入海中。二十九日，王之仁兵尚在，亦將入海；國維議抽其兵五千分守各營，之仁泣曰：『壞天下事者，方國安也。今清兵數萬倏渡南岸，孤軍何以迎敵？之仁有舟可入海；公并無舟，何以為計』？國維乃追扈監國行。尚書余煌盡啟九門，令民出走；既畢，整衣冠赴水死。六月朔，清兵過錢塘，國維行次黃石巖。方、阮、馬三家兵斷所過橋，橋下刻大字兩行云：『方馬至此止』。國安、士英定謀，出獻監國，遣人入守。值守者病，監國脫登海舟；傳諭國維退保四邑，遂過東陽：六月十八日也。二十八日，清兵破義烏。有勸國維入山者；國維曰：『誤天下者，文山、迭山也，一死而已』。次日，清兵至七里寺。國維作絕命詩三章；詩一章「自述」曰：『艱難百戰戴吾君，拒敵辭唐氣厲云；時去仍為朱氏鬼，精靈當傍孝陵墳』！詩二章「念母」曰：『一瞑纖塵不掛胸，惟哀耋母暮途窮；仁人錫類能無意，存歿銜恩結草同』。詩三章「訓子」曰：『夙訓詩書暫鼓鉦，而今絕口莫談兵！蒼蒼若肯施存恤，秉耒全身答所生』！具衣冠，南向再拜曰：『臣力竭矣』！從容赴園池死。興國公王之仁載其妻妾并兩子婦、幼女、諸孫盡沉于蛟門下，捧所封敕印，北面再拜，投之水。獨至南京，峨冠登陸，百姓駭愕聚觀；之仁從容入，見內院洪承疇，自稱『仁系前朝大帥，不肯身泛波濤；愿來投見，死于明處』。承疇優接以禮，命剃發，不從；八月二十四日，就戮西市。兵部侍郎陳函輝哭入云峰寺，作絕命詞八首。詞云：『生為大明之人，死作大明之鬼；笑指白云深處，簫然一無所累』。『子房始終為韓，木叔生死為魯；赤松千古成名，黃蘗寸心獨苦』。『父母恩無可報，妻兒面不能親；落日樵夫湖上，應憐故國孤臣』！『臣年五十有七，回頭萬事已畢；徒慚赤手擎天，惟見白虹貫日』。『去夏六月廿七，虛度一生世法；但嚴心內「春秋」，莫問人間花甲』！『斬盡一生情種，獨留性地靈光；古衲共參文佛，麻衣泣拜高皇』。『手著遺文千卷，尚存副在名山；正學焚書亦出，所南「心史」難刪』。『慧業降生文人，此去不留只字；惟將子孝臣忠，貽與世間同志』。又作「自祭文」、「埋骨文」，從容自經死。禮部侍郎王思任不食死。太仆少卿陳潛夫偕妻孟氏、妾孟氏，夫妻、姊妹聯臂共沉河死。兵部主事葉汝囗〈艸恒〉同妻王氏溺死。兵部主事高岱絕食死；子朗為諸生，亦赴水死。通政司使吳從魯不薙發死。原任山西僉事鄭之尹沉水死。其諸生死者，諸暨方炯、山陰朱煒赴水死，蕭山楊云門（一作雪門）自縊死。醫生倪舜生（一作年）正襟危坐磁缸內，命人掩覆，朗聲誦佛死。清兵至金華，大學士朱大典固守；攻月余，不下。以紅衣炮攻之，城陷；大典縱火自焚死。其子師鄭邠，武進人；亦死之。張鵬翼守衢州，標將秦應科等為內應，城陷；鵬翼及樂安王、楚王、晉平王皆被殺。督學御史王景亮被執不屈，遇害。阮大鋮、馬士英輩猶擁殘兵數請入關，隆武帝以其罪大，不許；士英遁至臺州山寺為僧，旋為清兵搜獲。大鋮投降，貝勒令辦事內院；方逢年、方國安及尚書蘇杜等俱投順。
時舊撫田兵及方氏、鄭氏兵，號三家兵；或離、或合，透迤而南，所在劫掠。或挾婦女坐山頭，呼盧浮白，漫衍嶺界四、五日；關門無一守兵。又數日，清騎數十從容過嶺。然入閩者，或由建、或由汀、或由福寧，俱從山谷間道出不意；不必由仙霞也。潰兵先過者，焚掠求食。至建寧。科臣黃大鵬、按臣鄭為虹發倉廩犒之，皆歡呼去；一郡獨全。八月十七日，清兵至浦城，百姓請降；為虹不可。及兵入，擁為虹見貝勒；迫之跪，為虹不屈。貝勒嘉之，勸以薙發；為虹曰：『負國不忠、辱先不孝；忠孝俱虧，生亦何為，寧死不從也』！明日，復召見，責以輸餉；為虹持不可，噴血大罵。貝勒下令斬之；為虹奮躍奪刀，自刺其胸不死，遂見殺。義仆陳龍、標下游擊原某、千戶張萬明及子都司張翹鸞、都督洪祖烈俱從死。大鵬亦同日殉難：浦民立祠焉。
隆武帝自芝龍既去，定計幸贛。八月二十一日始行，猶載書十車以從。二十四日，至順昌。聞清兵已及劍津，且踵至；倉皇騎奔，從者止何吾騶、郭維經、朱繼祚、黃鳴俊數人。既而，吾騶、維經亦散去。清兵至順昌，搜龍杠，得士英、大鋮、國安于既降后有「請駕出關為內應疏」；追之，大鋮方游山，投崖而死，仍戮尸。士英等四人駢斬延平城下，家眷百數口盡給賜兵丁。清兵過延平而東，獨陳謙之子某帥數騎追駕，欲為父報仇，及于贛州。時隆武帝將入廣，因停一日曝龍鳳衣；遂為所及，并擒曾后及朱繼祚、黃鳴俊。械至福州，隆武帝與曾后皆遇害。繼祚勒致仕，旋為亂兵所殺；鳴俊許授五品官，以老疾辭，免。禮部尚書曹學佺、通政使馬思理俱自縊死。別遣固山韓某、李成棟略興、泉、汀、漳等處；九月八日入泉州，德化知縣陳元青迎降，大學士蔣德璟絕食死。十五日，至汀州。十月十九日，入漳州。守道傳從龍、知府金麗澤降，皆仍舊職；不數日，鄉兵起義，被殺。
初，清兵未至泉州，鄭芝豹先至，閉城門；大索餉，皆計鄉紳家財勒取。不應，皆即梟首，至縛親家母于庭；抵暮得數萬。又其火手五百將盡焚城中宮室；以餉未足，遲至明日。俄報固山兵將至，乃奔安平。芝龍保安平，軍容烜赫、戰艦齊備，炮聲不絕震天地。以前遣洪、黃之信未通，猶豫未敢迎師。又自恃先撤關兵，無一矢相加，有大功；而兩廣素屬部下，若招兩廣以自效，閩廣總督可得，猶南面王也。貝勒令泉紳郭必昌與芝龍最厚者招之；芝龍曰：『吾非不忠于清，恐以立王為罪耳』。會固山兵逼安平，芝龍怒曰：『既招吾，何相逼也』！貝勒聞，乃切責固山，令離安平三十里，勿駐軍。而遣內院二人持書至安平；書略曰：『吾所以重將軍者，以將軍能立唐藩也。人臣事主，茍有可為，必竭其力；力盡不勝天，則投明而事，乘時而建不世之功，此豪杰事也。若將軍不輔立，吾何用將軍哉！且兩粵未平，今鑄「閩粵總督」印以相待。吾所以欲將軍來見者，欲商地方人才故也』。芝龍得書，大悅。其子弟皆勸芝龍入海：『魚不可脫于淵』；不愿降。而芝龍田園偏閩、廣，秉政以來增置莊倉五百余所；駑馬戀棧，遂進降表。過泉州，大張布告，夸投誠之勛；猶持貝勒書招搖，得官者就議價。十一月十五日，至福州，朝見貝勒；握手甚歡，折箭為誓。遂命酒痛飲，飲三日。夜半，忽拔營起，遂挾之而北矣。從者五百人皆別營不得見，亦不許通家信；芝龍對面作家書數封，皆囑無忘清朝大恩語。而謂貝勒曰：『北上面君，乃龍本愿。但子弟多不肖，今擁兵海上，倘有不測，奈何』？貝勒曰：『此與爾無與，亦非吾所慮也』。
芝龍既行，鄭彩、鄭鴻逵、鄭成功皆率所部入海；張肯堂往舟山，依魯監國。芝豹獨奉母居安平。芝龍至京陛見，奉朝請。
丁亥秋，鄭彩、鄭成功殺掠漳、泉諸郡，皆破之，汀、邵并亂；遂據建寧。戊子夏，清兵再入閩；破建寧，屠之，直抵泉州；鄭氏兵復遁入海。
附記
初，福建既陷，惟曾慶據平樂、劉中藻據福寧。己丑冬，清分兵攻之，慶既降，被殺；中藻勢窮、自縊。而延、漳、汀三州界連江右，延平所屬又處萬山中，乘清兵既回，復擁立德化王慈燁，取大田、復龍溪。十一月中，清復遣靖南王耿囗囗來攻；尚書羅南生出降，王被獲。
癸巳，清兵克舟山；魯監國囗囗囗張肯堂死之。
已亥夏六月，鄭氏復率舟師大學北伐，人心震動。師次京口，進攻江寧；軍行不戒，為梁化鳳乘間襲殺，大敗而去，海氛遂靖。至庚戌，鄭氏有投誠之志。朝廷遣大學士吳囗囗、吏部侍郎蔡毓榮、學士明珠經理其事，遂命興化知府慕天顏往復臺灣，業有成局；而三藩不欲，事遂寢。又十余年，三桂就滅，諸藩盡芟，至癸亥、甲子，鄭成功之子囗囗偕故明之后囗囗歸降。時天下大定，法網久寬，遂受之，而處之齊，魯之間；海波由是永息矣。
隆武皇帝親答監國魯主御書
王邇來無恙！謝來使赍到書啟、禮物，披閱再四，嘆王意之殷厚、媿朕躬之無似也。
吾太祖夜不解甲、日不去戈，十四年而成一統洪業，封諸藩以周天下。仰窺圣意，一日千秋；或亦曰年谷歲豐、四海咸寧，天子萬年、本支百世而已。朕與侄王同分高廟，喪亂之后，存吾二人。但使稍明理道，何忍一線嫌疑，即是自亡高廟！若求無嫌無疑，惟各善體祖意。有唐蹀血，萬世唾焉；靖難云云，痛祖斯甚！使朕處之，蓋必有道；既見令人笑往，斷不令后人笑今。此實朕志，王勿泛觀也。
朕性至淡，遇每違心。家難垂三十年，荷吾威宗，幸不墜祀。七載奉藩，日以圭紱為桎梏，辭爵雪父，蒙難八年。昨春寇變，初夏時鳳鎮牟文綬三請進營，愿躬擁戴；朕志守節，以死自甘。今其人固在，不可欺也。圣安恩宥，溯流遇變；抵嘉興，擁勸頗眾，朕復以死自誓，出揭首奉潞王。臨安再覆，黃道周、鄭鴻逵翼戴于前，鄭芝龍、浙閩臣奉迎于后，朕猶出揭讓賢；如侄王者，亦在此「讓揭」之內。其時虜勢如傾、人心如沸，瑞、桂、惠王近枝既邈不可問，但有朱家一庶宗，能發憤而纘鴻名，使我祖祀不斷，朕實甘心北面；惜不見此！乃為文武所逼，以巢、由之身被堯、禹之服；一毫利此，則天地、祖宗誅之殛之，四方萬世誅之殛之！蓋朕雖才非光武，而志愿頗效周文。秦、漢以后，帝制太濃，使篡弒接踵；傷哉此位，至苦至危！故祖制所以有「親王樂過天子」之教也。閏六月七日監國，二十七日登極，誓以身殉祖廟；御詔求助萬方，猶曰『始借大號以復舊疆，終必訪道而全高尚』。然今半年，名曰天子，依然長素布炮，宛一疇昔故我；所增者，三鼓批覽不休、黎明寒暑先起。見一好臣，如得性命；聞一警信，似痞埋胸。焦兵勞民、憂文悼武，多少傾不盡苦。朕年近知命，未耀前星；疲面癯形，或亦殉祖之實狀也。王以七月十七日監國于臺，八月十六日迎至于紹；朕方喜有分勞，而盧開歧視。日盼王之善音，如冀衣食寒暖。陳曜之回，詞愈于理，音得而未善也；今柯、曹二臣至，音善而猶未盡也。蓋「膝下」之稱，以父待予，是王之過厚；而猶曰啟、曰書，則似婉示朕不足纘鴻名而雪高廟也，朕實虛心自慚。
焦勞六月，各路之師未至、江上寸土未復；親征遲緩，累吾侄王枕戈，臨戎忍痛，然亦非無自也。侄王雖值虜沖，然所當西興一帶數百里，稍易為力。朕自頒詔四方，云、貴、兩廣、楚、豫、江、川奏賀畢至；虜寇交訌，錢糧一分末至。而數千里安危仰成于朕，致朕左支右吾。拮據六月，幸賴祖靈，闖逆授首于楚省、靖江底定于粵東，江右境土漸復、三吳臣民踵至。痛念囗戰六月，杭虜猶抗、徽逆尚梗，師未奏功。是用今臘六月，朕已親自臨戎，直趨江干督戰；先衢暫住，俟王回音。或諸臣不信朕之坦懷，各恐失其佐命；王或不答，或再復以責備，朕一定怡然自咎。惟期奮力江干，贖朕無能之過。或又不爾，則實不敢舍溫、衢，自絕八閩咽喉；躬率兵將于建、撫，為上游瞻仰孝陵之計。王勉事武林，期與侄王共至金陵。以情不忍將秦比祖、以地不得不借成說，聊以自明。蓋如所謂「先入關者王」，當關舊京、不當關一杭。咸陽之定，原有成法；是諸臣之小誤當政，勿令義帝笑人。萬一侄王排紛紛之群議，不以列國自待，而負一統高皇；朕之處王止有一讓，王之處朕豈恁恝然！監國既奉欽命，何難一表明尊；此實高廟之靈，非朕福德所至！然存亡關頭，實在于此。朕有言曰：『今而后，斷與王以玉帛見，斷不與王以弓矢見』。王未帝則無不盡其挽、王稱尊則無不盡其讓；朕志決矣，愿王首善為高廟計、次善為朕與王計也。
總之，雖變遇萬籌，朕第有樸誠自待。信筆無文，惟貴達意。王雖自有其歷，朕歷亦不忍遍頒四方而獨遺王侄不贈也。朕心切盡，置用惟王！
十一月二十日，冊封親、郡十王，令徽遼再續，功繼崇陽，以上答我高廟。王或不厭所聞，故于書尾并及。冬寒珍重，惟監國侄王亮之！