時馬榖山廉訪奉唐公命，赴蒙城調和蒙練、苗練之事。是時，僧邸已生擒巨捻張落刑磔之，駐節(jié)亳州白龍王廟。榖山去后，營務處遂一人任之。十日，唐公接僧邸咨，屬其赴亳會商善后事宜，欲亟往；余力止之，三上書籌備苗練事，蓋料其必復叛也。十四日，唐公率親軍四營赴邸帥營，以宋鎮(zhèn)（慶）千三百人守臨淮兩岸，歸余節(jié)制；而留病卒五、六十人畀余守老營。余重違其意，為留守焉；凡一應軍事、吏事、餉事，皆得以權宜裁決。其時聞邸帥將去、苗逆叛志已萌，飛函曾相，請其派兵守壽州正陽城關要隘，以伐奸謀；請?zhí)乒炝羯〕嗣缥磁眩劝l(fā)制之：事皆不行。三月，營中無餉，多方拊循。嗣聞僧邸定期回東，飛書唐公請其速回臨淮，以靜待動；不果。而苗逆遂得以十六日劫我蚌埠戈船，踞懷遠縣城，逐知縣、戕典史；蓋黑夜舉事也。十七日早，戈船自蚌埠退回——僅六十里，順風下行，瞬息可到；軒然大波，倏忽而起。商賈居民，紛紛遷避；訛言苗逆乘主帥未歸，以二十萬眾、定期二十日分道取鳳陽府縣，并襲臨淮大營。營中人人震恐，以為其勢萬不能守，宜速為計；意欲慫余。余策苗練多智，而見事遲三日必不能來，尚可從容料量；因出告示，不準屯積米糧。分派炮船巡上下游，不準居民出境。日派戈什帶領親兵巡行街市，緝拏游勇，禁止謠言。三豉，騎馬與秦觀察（榮）查夜，或坐炮船巡河，以系人心；又虛張聲勢，出示謂鮑軍門追賊已至廬州、唐帥已帶親軍自蒙回至臨維。又修理老營四角大炮，借宋鎮(zhèn)炮手數(shù)十人守之。黑夜，令將所存旗幟、槍械于天未明時偏行豎立營墻，不知者以為果有援軍至也。于是又咨調張軍門（得勝）梁園之師速行撤回，以二營守定遠、三營守臨淮。并派親兵改裝四出，赴唐公蒙城行營告變；人謂其必不能達，以苗逆處處伏人短劫，而余不顧也。營中見余守志甚堅，不敢輕動；苗逆不測我軍虛實，亦未敢襲。余復外示安閑，辦事后，即為門人周賓卿講學不輟。二十一日，張軍門（得勝）自梁園來，人心粗定。唐公在蒙聞變，愴然曰：『臨淮不守矣』！行次宿州，得余信「臨淮、鳳陽巍然猶存」，大喜過望；以為非某守臨淮，不至此。冒雨兼程，于二十三日回臨淮。二十四日，請?zhí)乒杀呍畨壑荩黄鋾r苗逆尚未合圍，因無餉而止，惜哉！二十六日，派兵進蚌埠，以圖懷遠。二十七日，上疏請皇上一意主剿，以唐裴度平淮、蔡事為證。并請褫從苗已保提鎮(zhèn)、道、府諸人之職，以明順逆；如能自拔來歸，再請開復。唐公并以余苦守微勞，有裨大局上聞。余本不敢言功，唐公初歸，余書「愿無伐善、無施勞」二句揭于壁間；然竟不能辭也。其疏片云：『再，臨淮為臣營根本，長淮樞紐。素知臣營務處前員外郎吳大廷才略過人、諳練軍務，臣于前月馳赴蒙、亳時，飭令該員留守老營，總理庶政。月余以來，辦理裕如。比苗逆?zhèn)}卒舉事，與臨淮近在咫尺，徒黨四出，人心洶洶；我軍兵孤餉絕，大有朝夕莫保之勢。該員向在李續(xù)宜軍中，素知苗逆伎倆。此次聞警，竟能屹立不移、從容料量：拊循戰(zhàn)士，鎮(zhèn)定人心；聯(lián)絡官民，力修守備。該逆?zhèn)芍婪渡鯂溃锤襾矸福槐Ｈ獏^(qū)，厥功甚偉。前湖北撫臣胡林翼深重該員，商之李續(xù)宜，于咸豐十一年春間奏調來營；一切倚任，頗著勤勞。臣在鄂時，實所親見。曾國藩亦大加賞識；去年四月間，復經(jīng)浙江撫臣左宗棠奏保「堪勝浙江司道之任」：眾論允孚。該員學術正大，識微見遠；上年八月自入臣營，諸多劻助。此次保全臨淮，心力交瘁。臣未便沒有微勞，可否仍照左宗棠所奏「以道員交軍機處記名，遇有道員缺出，請旨簡放，并賞戴花翎」？出自天恩逾格』云云。同治二年四月初七日，欽奉初三日廷寄：『唐訓方所請吳大廷以道員記名之處，已諭軍機處遇缺請簡矣』。同日又奉旨：『吳大廷著賞戴花翎。欽此』。初十日，同唐公赴前敵北蚌埠大營；是時，苗黨距黑窯相去僅二、三里也。十三日，返臨淮；商之唐公，咨請清江吳漕帥（棠）派炮船相助，以懷遠地為渦、淮交匯之區(qū)，非水師不為功也。先是，潁上縣與懷遠同日并陷；至是，苗逆北圍蒙城、南圍壽州。蒙城有馬廉訪新貽督兵駐守。壽州則毛牧維翼以饑卒五百與之相持；而蔣觀察之純、周軍門寬世奉曾相檄援壽州，屢次多傷精銳，不能解圍，其勢岌岌殆哉！五月，發(fā)捻合眾數(shù)萬，由鄂入皖北，越舒、桐，趨六安，余料其必由壽州，趨爐橋以經(jīng)定遠；已而果然。捻首張宗雨困敝已極，偽請投誠，唐公欲許之；而余策其為苗逆所誘，力為阻止。張宗雨果以苗逆接入懷遠城中，少住二日，資送回亳州雉河老巢，以分蒙城兵勢。是時營中絕糧數(shù)日，大有潰散之勢；余多方拊循。每夜四鼓至中軍帳，仰天長嘆而已。六月初十日，坐萬斤炮船赴前敵。四鼓，至黑窯，提督張得勝過余舟告曰：『林家圩已投誠矣，懷遠可以得手』！蓋林家圩為渦、淮咽喉，不奪此隘，懷遠終不可得也。余曰：『何據(jù)』？伊出苗黨投誠稟示余。余見稟中有「沛霖侄苗景開已由圩入懷遠縣、返下蔡」之語，即察其偽，力戒以宜備；張不以為然。五豉，至李家嘴普鎮(zhèn)軍（承堯）營中，張以告普；普更以為真。余復力阻之，不可；則勸其預備防敵具，勿徒手受縛。并傳水師各營官：天明出隊，見賊即擊，勿受張、普節(jié)制；其時已將曉矣。將熟睡，而聞炮聲震天；從者告余，謂『林家圩賊果以投誠賺我，張軍受傷退；幸炮船先受余誡，已出不意直趨下洪』。余亟起觀戰(zhàn)，但聞炮聲如雷；不一時，而水師大捷，奪獲賊船十九只、擊沈者不計。使張、普能信吾言，水陸兩路均可獲大捷也；惜哉！十五日，返臨淮；即得壽州失守之信，蔣、周等軍俱奉曾相檄，撤回六安；臨淮前敵與蒙城，勢益吃緊。乃商唐公謀之曾相，調何鎮(zhèn)紹彩四營自寧國回臨淮，以資策應。是時，苗逆派黨斜出普軍之下，于南蚌埠河沿筑三壘，以阻糧道；唐公欲自臨淮派行隊擊之，余力阻，不允。至十九日三鼓，分布已定；余趨寢所，告之曰：『苗逆善守，天氣酷熱，我軍趨七十里至蚌埠，苗伏兵不動。侍至日中，我軍饑渴，溽暑逼人，其勢必退；退則苗逆自后擊我，取敗之道也。否則，我軍一到，肉薄攻墻，其勢必多傷精銳；而賊壘亦卒不可破』。唐公卒不允。余曰：『毋已，則請派兵先至長淮衛(wèi)立營，次早進兵；勝固妙，即不得手，而我退守老營僅二十里，其勢可不至敗』。唐公允之。二十日，臨淮隊至長淮衛(wèi)，并糾合張得勝自上擊下。二十二日，兩路并進，肉薄登墻；果傷二百余人而還。曹溜集苗黨，偽請集練扎營御苗，唐公已給札矣；余曰：『此詐也！苗勢正盛，伊等何為而至我哉』！不聽。已而，果肆擄掠為患。七月，苗逆復添萬余人，斜出張得勝黑窯之后；層層包裹，其勢甚危。蓋兩岸賊壘濱河，大為糧道之患。唐公曰：『事急矣！非子親往一行，就近調度不可』。余慨允之。

將行，龔智軒大令（黼林）曰：『須坐炮船為妥。民船猝有變，不可恃』！唐公以為然，乃函致前敵飛調炮船來臨淮，而苗逆已于河中洲宋家灘筑營六座，并以鐵鎖攔江，糧道大阻；前敵消息已不可通矣。十二月，曾相派外江炮船百只赴援，軍威甚盛；余指示形勢，并告以宜水戰(zhàn)，先清賊劃，切勿登陸。十三日，外江師船自蚌埠進，奪獲賊劃十九只。遂乘勝攻賊陸壘，更番迭進，皆受重傷，其勢幾不能軍矣；而前敵缺糧更甚。十五日，清江水師來援；唐公命余赴前敵聯(lián)絡客軍，商運糧之計。二鼓，抵蚌埠賊壘下泊，賊以炮擊我，未中也；乃請外江水師助戰(zhàn)，而以清江水師斬關破煉，送糧前敵。十五日黎明，出隊；清江水師痛擊賊沙洲，拔椿斬煉而過。然僅送糧三萬斤，只敷兩日之食。而苗逆益加椿、加煉；并沈民船，實以沙土，橫亙河中。余請諸將再商運糧之法，皆氣餒不能任也；余乃回營。十八日晚，張得勝自賊營偷過，來營求救；商量至四更余。二十一日，高寶水師黃鎮(zhèn)開榜來營，請救甚急；唐公憂甚，復請余往。余毅然任之，立即登舟。抵蚌埠，詢悉前敵，仍議以北岸渡過南岸，一齊退下炮船，能沖下固善；不則燒之，不可棄以資敵。張君已率八十死士親至宋家灘東扎卡，擬令上游陸師扎卡宋家灘之西，緊逼賊壘以牽制之；令上游炮船得以專力沖下。余曰：『雖然，張?zhí)彳姴挥H回黑窯，則北岸無主，必亂』！乃遣張君去后。高寶統(tǒng)將請外江水師助戰(zhàn)，余乃婉告王提軍吉、成提軍發(fā)翔，俱蒙允諾。舟泊河心，密邇賊壘，不能成寐；四鼓后，傳言前敵已撤、炮船已燒、軍資器械盡行拋棄，勇丁傷亡不少。有請余速回者；余曰：『余行，則近于畏葸；始俟之，以作亡羊補牢之計』。天甫曙，有前敵勇丁來，詢之果然；余仍堅忍不動，并留糧艘，擬待諸營取食。至辰刻，南岸賊壘豎旗出隊，北岸賊距岸不遠；余令坐船裝炮首先逆敵，而賊馬已東下矣。是日，風逆浪高，坐船顛簸。至午刻，高寶及外江水師紛紛下駛；余知不可留，又恐臨淮有失，乃冒雨歸。二更，抵營。或謂某軍與賊私通，留之恐貽后患，不留又恐為變；唐公乃委余辦之，并告以如何方妥。余對曰：『謹盡力』！唐曰：『勢已至此，吾諸事賴君；君乃不下斷語，吾誰望乎』！余曰：『非此之謂也；且竭吾力而為之』。費數(shù)日勸諭，乃撤張得勝部下譚鎮(zhèn)善夫、唐副將萬清、趙副將昌富三營。然謂其通賊，吾不敢信；謂其久戰(zhàn)膽怯、貪戀妻室、不能整齊隊伍，則彼亦無詞以對矣。

八月初八日，婉辭唐公，告歸省墓，就便勸捐助飼。十一日，登舟；同行為秦子仁都轉（榮）。開行三十里，至茅灘泊；署鳳陽縣周述人（星讆）來別，并執(zhí)贄為弟子。經(jīng)安瀾集、雙溝、舊縣、盱眙，至蔣壩、盤壩換船；歷雷城、泛水、高郵州，謁露筋祠。經(jīng)邵伯，過揚州，出三囗〈氵義〉河；至瓜洲。出口到七濠口，望金、焦二山，回泊瓜洲。出三囗〈氵義〉河，至儀征泗源溝，換湘鄉(xiāng)釣鉤船。三十日，出江，過通江關；至草鞋夾，泊。九月朔，出夾，過九袱洲；至南京雨花臺曾沅圃中丞大營，留一日。初二日早餐后，告辭回舟。初四日，過兔兒磯，訪楊軍門載福，并訪邑子楊生紹銓。初八日，過板子磯，晤邑人王鳳藻；鳳藻為派炮船送之。十三日，由王家洲，坐舢舨；十四日，到安慶，妾輩已登舟矣。新知為江達川方伯（忠浚）、鄧伯昭明經(jīng)（瑤）、徐毅甫孝廉（子苓）；江、鄧二人皆寶慶人，徐則合肥人也。二十二日，由安慶開行。十月二日，至湖口縣，復登石鐘山。十三日，至黃岡界七磯洪，阻風。詢知吾故友吳又桓觀察靈柩已回，距此僅十里；乃造其室哭之，且致賻焉。十七日，至漢口。二十一日，同劉個亭登黃鶴樓，謁胡文忠祠。二十八日，過新堤。冬月朔，至岳州；龔智軒來會，同登岳陽樓。已而，李儲源來；初二日，去；泊君山。初九日，至常德，易舟上行。二十日，至北溶。許生顯榮授徒于此，遣人相邀；并謁其祖姑周節(jié)母——節(jié)母猶道及先大夫之厚德也。二十二日，至辰州。詰朝，步行至先父母墓展祭。家人親族紛紛來見，以次展謁先塋歸；棲墓側賬房。二十五日，到家。除夕，復與老姊至先父母墓側，燔柴以祭；歸，已二更矣。

自八月二十二日過雷城、至冬月朔至岳州，成「馮魯川觀察詩序」一首、吳又桓觀察、周志甫明經(jīng)「哀辭」各一首、秦太夫人、吳府君「墓表」各一首、「太史公報任少卿書書后」一首、「通蔽論」（上）（下）二篇、江忠烈、胡文忠「行狀、「書后」各一首、「謝老仆傳」一首。

三年（甲子），四十一歲（是年，到浙。冬十有二月，「讀易隨筆」成）。

正月，在沅陵原籍。月杪，謁祖墓，辭行。