（一）協助夫君登上汗位
年少的布木布泰婚后離開了熟悉的大草原，從科爾沁來到了遙遠的東京城，她面臨的是一個全新的環境。在這里，父母不在身邊，兄長不在身邊，沒有了無微不至的關懷，所有的一切都必須要自己去面對，她必須承擔起新生活的種種考驗。
在他們的蜜月還沒有度完，父王努爾哈赤于后金天命十年（1625年）三月一日，向下屬的貝勒大臣宣布要將國都遷到盛京（今沈陽）。盛京處于四通八達的“形勝之地”，軍事進取十分方便，西征明朝可由都爾鼻（今遼寧彰武境內）渡遼河，路直且近，去蒙古地區一二日即可到達。當時因遼陽東京城剛剛建成不久，諸將對放棄這座新城都很不理解。可新婚的皇太極和布木布泰卻堅決支持父王的決定。3月3日，努爾哈赤率領貝勒大臣及八旗官兵，浩浩蕩蕩地開進了新都盛京。
因盛京此前從未做過都城，無現成的宮殿可用。努爾哈赤遷都盛京后，居住在城北門的“汗宮”里，規模很小。皇太極的貝勒府也就更窄小了，布木布泰從不講排場，對此毫無怨言，深得皇太極的喜愛。
來到盛京后，努爾哈赤雄心勃勃，要大展宏圖。當時的皇太極因為地位顯赫，需要常常與父親努爾哈赤商議軍機，要隨時出征，不可能天天留在家里陪伴布木布泰。新婚的新鮮與歡愉尚來不及細細品味，布木布泰就要忙于替丈夫收拾戎裝了。她心中不免有些惆悵，但識大體的布木布泰從無怨言，她似乎已經懂得，皇太極還有許多比關愛她更重要的軍國大事要料理。布木布泰的成熟與賢惠，讓皇太極刮目相看。他也認為，一定要在軍務閑暇之余給這個善解人意的福晉以體貼、溫存。但是眼下，皇太極還不可能盡情與她享受夫妻之歡、男女之愛。因為這一時期，后金與大明之間戰爭頻仍，互有勝負，在山海關附近已形成膠著相峙之勢。
天命十一年（1626年）二月，也就是布木布泰婚后的第二年，努爾哈赤率兵十三萬，號稱二十萬，大舉進攻寧遠（今遼寧興城）。此時，堅守寧遠城的是明朝著名將領袁崇煥。熊廷弼被殺后，袁崇煥奉命鎮守寧遠，后因金兵攻勢甚猛，繼任經略使的高第曾下令放棄遼西，退守山海關以內，但袁崇煥不從，仍堅守寧遠孤城。寧遠之戰打響后，努爾哈赤攻勢甚猛，袁崇煥率部浴血奮戰，打敗后金大軍。這是努爾哈赤25歲興兵以來的第一次慘敗。這對抱有一統天下之志的努爾哈赤無疑是致命打擊。在這次戰爭中，努爾哈赤被炮火擊中受傷，此后，背后又生疽。禍不單行的努爾哈赤遂撤往清河溫泉沐養，八個月后，病情加重，在返回盛京途中，病死在離盛京四十里的愛雞堡，享年68歲。
國家一旦失去了最高領袖，馬上就陷入了群龍無首的狀態。努爾哈赤一死，手下人立即對汗位的繼承發生了激烈的爭執。除了代善、阿敏、莽古爾泰、皇太極四大貝勒以外，阿濟格與多爾袞、多鐸等人也有問鼎之意，一場奪嗣之爭一觸即發，形勢十分危機。皇太極的文治武功在諸人之中最為出眾，但由于黨派之爭，一時也陷入了困境之中。布木布泰勸慰丈夫說：“夫君儀仗功勛，所缺乏的不過是名分，如果能有大貝勒代善的支持，何愁繼承不了汗位呢？”皇太極沒想到年輕的側福晉具有如此的識略，他聽取了布木布泰的建議，最終爭取到了大貝勒代善的支持。大貝勒代善系努爾哈赤福晉佟佳氏所生，與褚英系同胞兄弟。褚英以長子被立為嗣子，后因諸兄告其無狀被廢，不久死去。代善遂為努爾哈赤諸子中最長者，他又系兩紅旗額真（旗主），頗有威儀。
在代善的支持下，皇太極于天命十一年（1626年）十月二十日在盛京繼位，時年34歲，改元天聰。
（二）初涉政治的險惡殘忍
雖然當上了汗王，但皇太極還不能獨自“面南而坐”，因為代善、阿敏、莽古爾泰都是旗主，都有相當的勢力，皇太極只好根據父親臨終前的旨意，哥幾個一塊“面南坐受”朝拜，實行“集體領導”。結果事事受到掣肘。加上努爾哈赤時期遺留下來的一些問題，諸如宮廷內部矛盾、滿漢矛盾、制度不健全、生產不景氣、物價飛漲、盜賊蜂起等。這一切都使剛剛登基的皇太極困難重重，舉步維艱。但是，皇太極畢竟不是等閑之輩，況且還有兩位聰明的科爾沁蒙古姑娘做他的賢內助，使他登基不久就表現出了非凡的政治才能。為了平息宮廷內部矛盾，為了宮廷長治久安，為了防止出現意外，特別是引起諸皇子之間日后的紛爭，皇太極大權在握之后，立即就表現出了政治上的成熟與老練，他以努爾哈赤“遺命”的名義，策動諸王貝勒逼迫父親努爾哈赤的大妃烏拉納喇氏阿巴亥殉葬。阿巴亥12歲時嫁給努爾哈赤，深受寵愛，她生有阿濟格、多爾袞、多鐸三個兒子，都聰穎勇猛，深受努爾哈赤喜愛。兄弟三人還未長大成人，就已被努爾哈赤封為和碩貝勒。阿巴亥是一位很有韜謀的女子，她希望有朝一日自己的兒子能夠繼承汗位，因此對皇太極繼承汗位十分不滿，她暗中結交王公大臣，只等時機成熟，就要向皇太極發難問罪。皇太極決心先下手為強，鏟除隱患。當向阿巴亥宣布殉葬遺命時，她先表示懷疑而不從。眾貝勒大臣隨聲附和且態度強硬地說：“先帝有命，雖欲不從，也辦不到呀！”她見事已至此，無法挽回，便隨機應變，穿上禮服，飾以珠寶，哀切切地對諸王說：“我從12歲侍奉先帝，豐衣美食，已二十六年，我不忍與其離別，故愿追從與地下。我那兩個最小的孩子多爾袞、多鐸，請代為撫養。”諸王轉怒為悲，含淚回答她說：“吾等若不撫養幼弟，是忘父也。請大妃放心去吧！”
于是，年近37歲的大妃阿巴亥火葬殉夫了。當熊熊大火燃燒起來的時候，布木布泰就站在一邊，這一宮內慘烈的一幕，在她心中留下了深刻的記憶，她不僅對宮廷生活的殘酷內涵多了一層直觀的感悟，而且也為她日后的活動確立了準則和經驗。以致十八年后，她面臨與大妃阿巴亥同樣的形勢時，毅然采取了先發制人的手段，躲過了同樣的一場劫難。
戰爭的繼續進行不但考驗著建功立業的男人們，也考驗著他們身后的女人。皇太極繼位后，繼續對明朝的進攻，他繼續攻打寧遠，想振奮軍隊士氣，為父親報仇，但是袁崇煥炮火猛烈，皇太極屢屢受挫。皇太極見攻城不成，于是利用反間計，勾結明朝奸臣，四處宣揚袁崇煥意欲謀反，崇禎果然中計，袁崇煥被明朝廷下獄凌遲處死。后金失去了一個最大的敵人，入關指日可待了。
此時明朝內部農民運動蜂起，后金內部矛盾也不少，皇太極一方面積極備戰，一方面處理內部事務，年輕的布木布泰在政治紛擾中慢慢地成熟起來，她也盡可能地協助皇太極，替他分憂解愁。
親王阿巴泰直爽粗魯，他是努爾哈赤的第七子，作戰勇猛，他自恃功高，職位卻低于其他貝勒，常常發牢騷。有一次，皇太極舉行宴會，他竟然說天冷無衣御寒，拒不赴宴。布木布泰立即以大汗的名義給阿巴泰送去了珍貴的衣物，請他赴宴。阿巴泰接受了衣服，卻仍不赴宴。布木布泰知道他并無惡心，只是慪氣而已，于是親自前往邀請，阿巴泰見大汗妃親自來請，立即表示認罪，從此之后忠心耿耿，成為皇太極的得力干將。事后，皇太極曾問布木布泰：“你身為側福晉，卻賜衣物給貝勒，不怕落個私交外臣的罪名嗎？”布木布泰坦然答道：“阿巴泰是您的兄弟，不是外人，我只想你們弟兄合心，不曾想過要私交什么人。若是連自己的手足都不愿輔佐您，哪還能指望別人呢？您若是因為這事而怪罪我，我也無話可說。”皇太極聽著，只是不住地點頭。
天聰十年（1636年），即明崇禎九年，皇太極以更雄武的姿態在盛京去汗號，稱皇帝，并改國號金為清，年號改為崇德，歷史上稱之為清太宗。他以嶄新的姿態把清帶入新的歷史發展階段。此時，皇太極又對宮廷制度進行了調整，后宮也開始有了位號。崇德元年（1636年），皇太極冊封了五宮妃子，布木布泰的姑母哲哲為清寧宮中宮皇后；博爾濟吉特布木布泰為永福宮莊妃；布木布泰的姐姐海蘭珠為關雎宮東宮宸妃。另外二位為衍慶宮次東宮淑妃和麟趾宮西宮貴妃，也都姓博爾濟吉特氏。皇太極的后宮全部由蒙古博爾濟吉特氏女子充任，僅科爾沁部就占了三位。并且，哲哲、布木布泰、海蘭珠親姑侄三人同事一夫，這在中外歷史上是十分罕見的。
由于皇太極的寵愛，莊妃得以在清朝創業肇基之際，經受磨煉。據《康熙起居注》載：莊妃“佐太宗文皇帝（皇太極）肇造丕基”，她自己也曾說：“我雖在宮中，太宗行政亦略知之。”正是由于她“贊助內政，越既有年”，對于創業時期的皇太極幫助甚多。