秦皇歷626年秋，墨家內部召開大會，由于墨家獨掌朝政所帶來的生產結構的變化，以及《日月干支斗數》所帶來的影響。墨家原始的四堂制已經無法滿足于治理國家的要求。由此墨家開始了對于內部制度的改革。
首先，墨家吸收了以家族制為單位的一大批工匠。他們中首要的代表人物就是從戰國之始的公輸家族，也有蜀中的后起之秀致力于金屬冶煉的馬氏家族，荊州的研究機械構造的黃氏家族，推崇于修道醫術的霧隱山張家，以船舶制造見長的蔡家，專攻水利建設的李家和酈氏，以及擅長于車輛改造的薛氏和御龍氏。
正是由于接納了這些家族以后，墨家在工業技術方面迎來了突飛猛進的階段。但是限于教育的原因，能夠致力于研究擁有一定知識功底的技術人員嚴重不足。墨家由此召回了所有外派負責普及技術工藝的墨者，將普及和更新社會技術工藝的任務下發到各個工匠家族，為了形成統一的管理制度。墨家罕見的改變了其單首的巨子制，新的制度采用了雙首制。廢除原本的4堂制，采用了天干地支體系命名的22部門制。采用天干10部，地支12族的管理方式。天干10部由墨子進行管理，其中甲部負責新人員的甄選、培訓、以及分配和工作調整。乙部主要由原來的暗堂人員構成，負責墨家人員的安保、刑律，以及對敵隊人員的甄別工作。丙部負責內部技術資料的審核，編撰和管理工作。丁部作為財政部門負責墨家的對外交易。之后的六部則分別負責金屬鍛造、水利工程、生產機械、藥物制劑與火藥、農牧馴養、天文歷法這6個方面新技術的研究和開發工程。
而地支12族以公輸家族為首，公輸家族的首領被稱為墨師，他們接過原本普通墨者的任務，宣揚墨家思想，向民眾推廣新的生產技術。而在新的制度當中，墨家巨子為首的天干十部仍舊是以師徒傳承的方式確定繼承人。而以公輸家族為首的墨師地支十二族仍舊以家族傳承的方式進行發展。
秦皇歷634年，經過8年的潛心發展，蜀國的生產方式發生了巨大的變化。首先是在金屬制造領域，改良了原本的窯爐，使用水利鼓風，水利機械攪拌進行炒鋼法煉鋼，水利鍛臺能夠使用灌鋼工藝大量生產精鋼制品。而在此之前，鋼鐵制品還只依賴于手工鍛造的夾鋼工藝，能制造出來的工具有限，質量參差不齊。
得益于金屬冶煉技術的進步，新式機械也有了長足的進步，水利紡織機，新的提花機使得蜀錦的生產工藝和產量進一步提升。鐵制鏟頭的鐵犁、樓車、鏟、鋤等農業工具也開始大量在民間使用，進一步提高民眾的生產效率。金屬冶煉技術的革新，使得新式兵刃開始普及，在造船工業上依托于輻輪改造而來的圓櫓及其傳動機構開始在樓船以外的中型船只上大規模應用開來。除此以外更耐用的龍骨水車，新式水磨，以及應用于開采鹽井的輪式頓鉆，絞架式裝卸裝置，木模活字印刷，轉輪式發石車，單人連弩，噴火車等一系列技術被發明出來。
秦皇歷635年，經過9年厲兵秣馬，更新了軍備的蜀軍開始北伐。當蜀軍北出陳倉之時，代國的軍隊還在玩騎兵沖陣的戰術，但是可惜的是這種輕騎兵戰術在精銳的重甲步兵以及蜀軍鋪天蓋地的箭矢和人頭大小的飛石聯合打擊之下損失慘重。重甲步兵手持鍛鋼制造的斬馬刀甚至能夠一刀斬下戰馬的頭顱。
在精良武器的加持之下，蜀軍打的缺乏鎧甲的鮮卑人抱頭鼠竄，迅速收復了咸陽。之后沿運城盆地北上晉陽，準備收復三秦舊地。可就在此時蜀國后方傳來了噩耗，趁著蜀軍主力北伐之際，長沙郡守謝安在越國朝堂的默許之下發動了白衣渡江，在越國商人的引領下，偷襲了蜀國南郡，荊州失守；謝安此舉對他個人而言洗清了當初出售荊州所帶來的不利影響，但是也將漢水之盟淪為了笑話。從那以后雙方開戰，必先清理邊境商人和普通百姓。
而更可笑的是就在秦皇歷636年春，謝安拿下南郡不過三月，鮮卑人同樣組織軍隊突襲了荊州。謝安為首的荊州守軍被圍，他的行為使得越蜀兩國的盟約就此作罷，雙方成為仇人，因此此時沒人會去救他。在被圍城兩個月之后，謝安率部投降鮮卑；此時蜀軍北伐主力剛好被調回至成都，代軍拿下南郡之后起初準備率軍東進。與蜀軍的夷陵守軍大戰一月余，直至蜀軍支援趕到不得不就此作罷。
秦皇歷639年，越國水軍經淮江運河北伐；北擊山陽，攻泗水郡。雙方在淮陰展開大戰，此戰越國水軍大勝，步軍攻城不利，鮮卑援軍到達，越國被迫無奈撤退。
秦皇歷641年，在張家的長期研究之下，火藥配方被改良，原材料由原本的10余種，被改良至四種：硝石粉、硫磺粉、碳粉、燃石粉（燃石就是現在的電石，一般在煤礦中作為伴生礦出現，古人在《拾遺記》中記載）。其后改進地火雷，用投石車投擲，落地則炸，蜀軍將其稱之為天火雷。同年秋，蜀軍自咸陽出，北伐晉陽，蜀代雙方大戰于絳州。鮮卑人騎兵第一次遭遇天火雷轟炸，馬驚，主將公孫郎打敗仗而回。在燕京，公孫郎私下面見代皇慕容璽，拿出一顆因為故障未爆炸的石雷，聲稱蜀軍已掌握雷法，這一次戰敗非戰之罪。
慕容璽看著這個石頭疙瘩打心眼里不信，他倒要看看這是個什么東西，于是找來石匠鑿開這個石球，里面居然另有名堂，是一堆灰黑色的粉末。經過工匠辨認，稱這里面應該是碳粉和硫磺，都只是引火之物。
慕容璽大怒，「朕如此相信于你，將十萬大軍悉數托付，你就拿這么一堆用來引火的黑粉來糊弄朕！」說話之間氣急敗壞，一把掀翻了桌子，桌子上的茶水灑進了黑粉當中，聽砰的一聲巨響。藥粉一下子就爆炸了，被炸碎的茶壺碎片飛散各地。有一些打在了公孫郎的身上，其中一顆好死不死的直奔慕容璽的眼睛。劇烈的爆炸聲引來了外面的侍衛，連忙將兩人帶下去救治。兩人都躺在太醫院中，慕容璽忍受著眼睛帶來的痛苦，對著包成粽子的公孫郎說道：「是我錯怪將軍了，秦人奸詐不可信，回頭就讓人把他砍了！」
秦皇歷642年，代國廣招工匠研究，遍尋可以爆炸的黑粉。這東西被墨家人嚴格保密，視為軍國利器，三年時間毫無進展，只能以鑼鼓聲代替爆炸聲訓練軍馬。
秦皇歷645年秋，蜀軍自崤關東出與代國大戰于洛陽。此戰鮮卑主將公孫策充分發揮輕騎兵的機動特點，只進行騷擾，絕不進行正面對抗。蜀軍只能對騎兵進行驅趕，無法進行全力攻城，消耗日漸擴大最終只能撤兵。
秦皇歷646年，蜀國皇帝秦垣駕崩。唯一的皇子鏜在墨家的扶持下登基，時年7歲。趁此時機鮮卑人發動南征之戰，在越國降臣謝安的帶領下，拿下長沙郡，隨后沿江南下兵鋒直指金陵都城，越國再次被迫南遷，將都城遷回南海郡。雙方大戰4年有余，代軍和越國在韶州大戰，代軍久攻不下，始終拿不下關城，雙方就此偃旗息鼓。
秦皇歷648年蜀軍趁著越軍和代軍大戰之際西征涼州，打的羌人抱頭鼠竄，潰不成軍。一年時間收復甘州，重建西域都護府。西向通道的打開，再次彰顯了大秦的霸主地位，（為什么說是大秦，此時雖然中原戰火連天，是三國爭奪的卻是大秦的正統地位。華夏傳統中方伯是沒有資格參加朝廷正統地位角逐的，有參加正統地位角逐的只能是王的子孫和王的親信——侯。這就相當于董事長死了，能參加董事長職位選舉的人，只有董事長的子孫以及他的這些有股份的合伙人，對于普通的公司管理人員只能說你選擇支持誰，但是在決策層的桌子上，你是沒有資格說話的。）西域各國再次前來咸陽朝貢，蜀錦通過甘州銷往西方，這次朝貢為蜀國帶來了大量戰馬。
秦皇歷652年，蜀軍再次東出，此戰分兩路，雙管齊下，一路進攻洛陽，另一路沿大江東下進攻荊州。鮮卑人兩面應戰，先戰敗于荊州，之后又再次戰敗于洛陽，653年蜀軍在南陽完成會師。鮮卑和蜀國各掌半壁江山。
秦皇歷655年中原大旱，此時中原的土地早已兼并嚴重，大規模良田化作牧場，而在齊魯之地則構建建成了以曲阜孔氏為核心的大規模糧食生產基地。當天災來臨之時，代國非但沒有震災，反而大規模征丁征糧，整軍備戰。曲阜孔氏此時已經成為千年世家，400年一次的大規模干旱早已經歷了兩次，他們開始大規模屯糧。
秦皇歷656年，蜀國圍繞滎陽和朝歌一線與代國展開大戰；這一戰將決定中原之歸屬，雙方都是全力以赴。雙方在前線打的慘烈，而代國的后方卻出了問題，在泗水爆發了中原歷史上第三次大規模農民起義。陳朝仙是個世代耕種的農民，大旱災爆發時，他還只有17歲。父母餓死了，家中就餓的剩了他一個人，好不容易挨到了秋天，上門征稅的稅吏來了，要搶走他家里最后一包糧種，可憐這包種子父母要餓死的時候都舍不得吃，一個氣血方剛的年輕人能這樣就讓人把自己的命根子搶走？他抄起自己挖野菜用的錐子一下子就從后面捅死了毫無防備的稅吏，搶了他的腰刀沖出家門接連砍傷三個運糧的隨從，其他人做鳥獸散。就這樣他有了一車八袋糧食。
地是種不下去了，怎么辦呢？憑借這8袋糧食招攬了一些兒時的玩伴，干脆上山落草為寇。這時候他們在路上又撿到一個人，看樣子是個書生，餓的半死不活，心存良善的他帶上了這個可憐的家伙。救活這個家伙之后，才知道他是個落榜的書生。自認為熟讀四書五經，《墨經》《管子》以及道家經典也略懂一二。于是這個出身寒門的家伙就跑到燕京進行考舉，現實狠狠的給了他一巴掌。代國的考舉在四書五經的基礎上加入了鮮卑文（東還的匈奴人在烏爾都語的基礎上繁生了鮮卑文），當時代國朝廷主持考舉的是以前的匈奴貴族，他們在慕容氏的暗中指示下進行了國文考試不過關的人不納的潛規則。可憐這個叫王景友的家伙辛辛苦苦考了三天，國文交了白卷，結果初試都沒過。他不服氣呀！于是就跑到貢院去問，貢院的官員警告他別鬧事，還朝他臉上啐了一口：“國文都不會的家伙，也敢來考舉，想當官想瘋了吧！”
他回去之后越想越氣，于是在京城中打聽哪里能教國文，這一打聽之下他人崩了，燕京國文書院入院繳納白銀5000兩，學三年，其后每年1000兩。得知消息之后，他氣炸了，這不是明擺著買官賣官嗎？我這輩子書就這么白讀了？失魂落魄的他踏上了南下回鄉的路。
書當然不會白讀，就這么機緣巧合之下他隨著陳朝仙上了山，當了他的軍師。災情越來越嚴重，跟著他們落草的人一開始的十幾個人增加到了幾百人。他們那點糧食吃空了，合計之下干脆搶稅糧。要去搶官府的稅糧，就要有一個名義讓這些人敢跟著你去，這怎么辦呢？陳朝仙掏出一本族譜，還是是一本被燒掉了一半的族譜。他舉著這半本族譜大聲喊：「我乃大秦宗室陳侯之后，有族譜為證，如今鬼方（中原自古以來將北方游牧民族稱為鬼方）入侵，不孝子孫陳朝仙，將起兵抵抗北蠻，在場的諸夏兒女有敢跟我去的嗎？敢跟我一起去的勇士我們今天吃完山上山最后一頓糧，去殺出一個朗朗盛世。」
就這么開局一把鋼刀，幾百根木棍陳朝仙的隊伍越搶越大，這個時候天災嚴重，到處都缺糧食。他們先后攻破了泗水縣、山陰城直接截斷了連通南北的漕運。這下子滎陽前線就斷了糧，代軍南線直接吃了敗仗。
拿下了山陰縣，截斷了漕運的陳朝仙發現他依舊養不活這么多人，在這種情況下，他聽說曲阜孔氏有糧，于是開啟了北進戰略，沿著運河一路北上他直接帶領他的兵馬打到了徐州城下。面對極其堅固的徐州城防，起義軍嚴重缺乏攻城器械，就如同餓狼咬烏龜無從下口。他們一合計，北方到處都沒糧，這么圍下去也不是辦法，既然南方能有糧沿著漕運北上，那南方的災害肯定不如北方嚴重；南方指定有糧，在王景友的策劃之下，起義軍開始南下，一路打到金陵城下，金陵的城墻雖然同樣堅固，但是城外到處都是江河湖泊，不愁沒地方找吃的，金陵城一圍就是一年多。等到鮮卑北方戰敗，金陵守軍自知獲救的希望渺茫。于是開城投降了，起義軍占領了金陵，開始招降納叛。658年，陳朝仙登基稱帝，在金陵宣布建立陳國，在丞相王景友策劃之下吸納大量的寒門書生進入朝堂理政；由農民軍建立的草臺班子陳國首次出現在了歷史的舞臺上。
秦皇歷659年陳朝仙在金陵建立陳國的消息傳到了北方災民的耳中，頓時就引起了軒然大波，一時間中原大地龍蛇四起，各類起義軍層出不窮，甚至在齊魯之地上有人打出了先入曲阜者為皇的旗號，一時間無數饑民在向著曲阜朝圣的路上絡繹不絕。孔氏見勢不妙，急忙派人進入燕京求援，剛打了大敗仗的鮮卑人哪里還有兵力去救援孔家。于是一縷寫著「朝無救，奈何」的布條綁上了信鴿的腿飛往了曲阜。
第二天一只鴿子飛了回來，腿上的布條上寫著「求于蜀」，收到布條的人急急忙忙的跑到廚房里，要了7天的干糧一匹快馬，提著蒙著黑布的的鳥籠出了西城門，一路快馬加鞭趕向朝歌。原本七天的行程，六天就趕到了，路上還累死一匹馬。到了朝歌以后，這個人憑借一塊玉佩一路闖過前線的封鎖直接到了蜀軍軍營之外，巡邏的小兵直接把他抓了起來。壓到蜀軍主將面前；“報告將軍抓到個奸細。”
那人翻了個白眼，轉身對后面的伍長說道：「你見過哪個奸細會穿著錦帛，站在兵營門口等你抓的！趕緊給我松開，我是孔家派來的使者，有要事和你們將軍商議！」
那伍長看了看主將，將領揮了揮手。于是他解開了綁著的繩結，帶著自己的繩子出了營帳。“你是什么人？”蜀軍的將領坐在籍案前問他。
「曲阜孔氏孔游，奉家主之命前來拜會！將軍也不必試探，我明著告訴你代國經歷此戰元氣大傷，前線不會再有援軍前來了，就連燕都也快要斷糧了！曲阜此時應該是快被饑民圍困了，我此行是來向貴軍求援的，希望貴軍能發兵前往曲阜解圍。」來人十分灑脫，說話直奔主題。
“早對中原大災有所耳聞，只是未曾想到如今災禍都已發展到如此程度了嗎？可是我們即便去了也沒有糧草借給你們！”那將軍皺著眉頭說道。
「曲阜有糧230萬擔，但是兵力嚴重不足，根本不敢開倉放糧。只要貴軍能夠前去，貴軍所需糧草，孔家一力承擔！」那人苦笑著說道，“一開始預測到大災的孔家就在瘋狂的屯糧，屯到糧食在糧倉里裝不下。等到外面激起了民憤之后，族老們松了口想要放糧之時候，外面的饑民蜂擁而來，孔廟缺乏軍隊，只有族丁5000余人根本不敢再開倉放糧了。外面的饑民如果入了城，就怕孔氏宗廟毀于一旦，傳承了千年的古文典籍若有損傷，那便是千古罪人了。”
“此事我做不了主，只能連夜送你過河前往滎陽城，救與不救只能由主帥定奪！”那將軍身為墨家之人，心中冷笑。大災之初不想著救民于水火之中，現如今宗廟不保，才想著開倉平息事端。