四月，之嘉興，晤徐司寇寶摩石麒。五月，返杭，晤熊行人魚山開元；感慨時事，嗚咽而別。六月，徒步二百里至劉先生家。時越城已降，先生避居楊塴，公遂自繞門山支徑入楊塴。先生臥匡床，手揮羽扇，勺水不進(jìn)者已二十日矣。公不敢哭，淚痕承睫，自序其來；先生頷之，公復(fù)徒步而返。奉太夫人避居中村。大兵東渡，郡邑望風(fēng)迎附。閏六月，我邑前吏科給事中熊公雨殷、九江道僉事孫公碩膚嘉績以一旅之師，畫江而守；公與仲、叔兩弟糾合黃竹浦子弟數(shù)百人，步迎監(jiān)國魯王于蒿壩，駐軍江上，人呼之曰世忠營。十月十日，甬上陸行人文虎訪公，因相與嘆息浙東之事（明年訃音亦值是日）。十一月，馬士英竄入方國安營，欲朝見。群臣言士英當(dāng)誅，熊公恐其挾國安為患也，曰：此非殺士英時，宜使其立功自贖耳。公曰：諸臣力不能殺耳；春秋之孔子，豈能加于陳恒？但不得謂其不當(dāng)殺也。熊公謝焉。十二月，兵部主事攝余姚縣事王正中（之仁從子）表進(jìn)公所作監(jiān)國魯元年大統(tǒng)歷；有詔優(yōu)答，宣付史臣，頒之浙東（小腆紀(jì)年隸九月，今從行朝錄）。公遺書總兵王之仁曰：公等不從赭山進(jìn)師，而日于江上放船鳴鼓，攻其有備。蕞爾三府以供十萬之眾，北兵即不發(fā)一矢，一年之后亦何能支？又曰：崇明，江海之門戶，盍以兵擾之，亦足分江上之勢？聞?wù)呓允枪裕荒苡谩９俦臀魇街叶斯簦槲莶臑闋I火，有司無所致祭；公方馳驅(qū)王事，聞之泫然。

三年（丙戌），公三十七歲。

二月，監(jiān)國以公為兵部職方司主事；公請援李泌客從例，以布衣參軍，不許。尋以柯公夏卿與孫公交薦，改監(jiān)察御史，仍兼職方。張國柱劫王鳴謙由安海入內(nèi)地，縱兵大掠，諸營大振；廷議欲封以伯。公曰：如此則益橫矣，何以待后？請署為將軍。監(jiān)國從之。陳總兵梧敗于檇李，渡海至姚，虜掠鄉(xiāng)聚；王職方正中方行縣事，遣兵擊之，鄉(xiāng)聚犄角，殺梧。行朝忌正中者，以此聲討。公謂：梧之見殺，犯眾怒也。正中為國保民，不當(dāng)罪。上疏救之，乃止。公力陳西渡之策，熊公再以所部西行，攻下海鹽，軍弱不能前進(jìn)而返。五月，孫公嘉績以所部火攻營卒盡付公，公與王正中合軍得三千人，遂偕太仆寺卿陳潛夫、職方查繼佐渡海，札潭山；適尚寶司卿朱大定、兵部主事吳乃武皆從浙西來會師，將由海寧取海鹽。百里之內(nèi)，牛酒日至。整軍抵乍浦，約崇德義士孫奭等為內(nèi)應(yīng)；會大兵已纂嚴(yán)，不得前。六月朔日，浙河兵潰，監(jiān)國由海道至閩。公歸入四明山，余兵愿從者五百人，結(jié)寨自固（公有四明山寨記）。公駐軍杖錫寺，微服潛出，欲訪監(jiān)國消息，為扈從計。山民畏禍，突焚其寨，部將茅瀚（字飛卿，歸安人）、汪涵（字叔度，梅溪人）死之。公歸而跡捕之檄累下，奉太夫人徙居化安山丙舍（次年返故居）。慈水劉瑞當(dāng)先生至，唁慰憑吊，悲嘯震空谷。

四年（丁亥），公三十八歲。

居山中，甘露降。注授時歷；王侍御仲撝自郡城來，受之而去（公在窮島空山，古松流水間布算簌簌，自謂屠龍之技，無可與語者。所著有春秋日食歷、授時歷故、大統(tǒng)歷推法、授時歷假如、回回歷假如、公歷假如、氣運(yùn)算法、勾股圖說、開方命算、測圓要義諸書，在此數(shù)年中）。

五年（戊子），公三十九歲。

劉瑞當(dāng)先生訪公于竹浦，信宿而去。十月辛丑（十日），季弟司輿公卒（公有志，年二十有七）。

六年（己丑），公四十歲。

監(jiān)國還至海上，公赴行朝，晉左僉都御史，再晉左副都御史。六月，定西侯張名振由南田復(fù)健跳所。七月壬戌，公與大學(xué)士沈公宸荃、劉公沂春、尚書吳公鐘巒、李公向中、侍郎孫公延齡、右僉都御史張公煌言扈監(jiān)國次健跳所。壬午，北師圍健跳；蕩胡伯阮進(jìn)救，卻之。王翊卻北師，發(fā)使貢方物于監(jiān)國；張名振以表貢不由己達(dá)，頗忮之。公上言：諸營文則稱侍郎、都御史，武則稱將軍、都督，惟翊乃心王室，不自張大，而兵又最強(qiáng)；宜優(yōu)其爵，使之總臨諸營，以捍海上。監(jiān)國乃授翊右僉都御史。明年，晉翊兵部右侍郎。時國事盡歸定西侯，即閣臣張公肯堂亦不得有所豫。諸帥之悍，甚于方、王；文臣稍異同其間，立致禍。公既失兵，日與吳尚書霞舟鐘巒正襟講學(xué)；暇則注授時、泰西、回回三歷。已而，中朝以勝國遺臣不順命者，令有司錄家口上聞。公聞而嘆曰：主上以忠臣之后仗我，我所以棲棲不忍去也。今方寸已亂，不能為姜伯約矣。乃陳情監(jiān)國，得請間行歸家。吳公駕三板船，送之二十里外，嗚咽濤中。八月，四十初度；有句云：先公殉國余三載（忠端公殉難，時四十三歲），孔子懸弧易一辰（公祿命與至圣只換一時）。是年所作詩，名「窮島集」。山中亂，奉太夫人徙居邑城（明年返故居）。十月，監(jiān)國由健跳至舟山，復(fù)召公偕馮侍郎躋仲京第副澄波將軍阮美乞師日本，抵長崎，不得請。公為賦式微之章，以感將士（是馮公第二次乞師事）；有日本乞師紀(jì)、海外慟哭紀(jì)（案全氏祖望曰：公日本乞師紀(jì)，但載馮公奉使始末，而于己無與。惟避地賦有曰：歷長崎與薩斯瑪兮，方粉飾夫隆平；又曰：返余旆而西行兮，胡為乎泥中。則是公嘗偕馮以行，而后諱之。又案神道碑所載有贛州失事紀(jì)、紹武爭立紀(jì)、舟山興廢、沙定洲紀(jì)亂、賜姓本末各一卷，皆此數(shù)年間所紀(jì)。后合隆武、魯監(jiān)國、永歷紀(jì)年為行朝錄。又有汰存錄一卷）。

七年（庚寅），公四十一歲。

時，大帥治浙東，凡得名籍與海上有連者，即行名捕。公弟晦木公以參馮侍郎軍事被獲，待死牢戶中；公潛至甬，與萬履安、高旦中、馮濟(jì)道諸公以計活之（詳見鮚埼亭集鷓鴣先生神道表）。三月，公至常熟，館錢氏絳云樓下，因得盡翻其書籍。返至崇德，訪孫子度方，欲與之劇談；而陸麗京聞公至，強(qiáng)之入城，同宿吳子虎家。公有句云：桑間隱跡懷孫爽，藥籠偷生憶陸圻。熊公夫人將逮入京，公為調(diào)護(hù)而脫之。冬，自西園移居柳下；故次庚寅至乙未之詩為「老柳集」，猶昔人之傷心于枯樹也（宅前向有老柳，為大風(fēng)拔去三株，僅存其一；故云）。外舅葉六桐先生遷葬邑東西黃浦，公送葬。

八年（辛卯），公四十二歲。

住柳下，王侍御仲撝來訪。夏秋之交，遣間使入海告警。九月丙子（二日），大兵下翁洲（即舟山）；城陷，監(jiān)國再入閩。是年，季子壽生。

九年（壬辰），公四十三歲。

著律呂新義；王仲撝侍御來，受之而去。

十年（癸巳），公四十四歲。

五月，華亭申山人自然浦南從汴梁蘇氏來訪，梅雨連綿。蘇氏述其昨夢，有裨舊史；山人間戲為江湖相士，膏唇調(diào)笑，以破寂寞。太夫人六旬壽辰，甬上萬履安先生以所作正氣堂壽燕序來祝，陽羨陳少保于庭、定生貞慧父子，皆有詩為壽。

十一年（甲午），公四十五歲。

元夕，悼周侍者。定西侯間使至，被執(zhí)于天臺；公于是又招名捕。冬，送女至甬東朱氏（公第三女，適諸生朱沆），寓萬氏寒松齋，與董次公守諭、高旦中斗魁兩先生話舊。董以草廬易纂言為問，公即疏其卦下之義以答之。馮行人愷章乞中丞留仙公神道碑銘。

十二年（乙未），公四十六歲。

從化安山至門士魏己任思澄故居，愴然有賦。除夕，季子壽殤；公最鐘愛，集中有壙志。故括丙申年之詩，為「杏殤集」。

十三年（丙申），公四十七歲。

二月朔，山燒將及禁塋，夜同澤望公入化安山。三月，墓祭戴家山，公與弟晦木、澤望、孝先三公均為山賊所縛；沈、李二君救之，乃得放歸。因避亂入城，寓外家。四月，次子婦孫孺人卒于寓。五月，一孫以痘殤。公詩云：八口旅人將去半，十年亂世尚無央。紀(jì)其事也。旋返故居而屋崩，繼而糧絕；太夫人徙半霖，秋返故居。慈水寨主沉爾緒禍作，公遭名捕，脫死毫厘間；仲弟晦木公被補(bǔ)，公頓足曰：死矣。賴故人朱湛、侯雅淳（其子諸生林，公之長婿也）、諸雅六救之，得免。

十四年（丁酉），公四十八歲。

春，甬上高旦中過訪。花朝前，宿石井，作詩志慨（去年為山兵縛至此地）。

登蘿壁山碧霞元君祠。公為仲子直方公就婚上虞虞氏，即館于其家。上虞之名山，為金罍、蘿巖、鳳鳴，其遺民為顏敘伯、陸苞甫、范裒生，公于是得與往來游覽，歡然道古。至杭，訪汪孝廉魏美沨，即寓孤山，講龍溪調(diào)息之法；各賦三詩契勘。

十五年（戊戌），公四十九歲。

同澤望公之郡城，過滿聽軒，吊倪鴻寶先生；登柳橋，吊王元趾先生。之杭，寓昭慶寺。吳門鄒文江來訪，始得沉征君眉生消息，因作詩寄之（時眉生已返故園）。集丁酉、戊戌兩年詩，名「金罌集」。

十六年（己亥），公五十歲。

二月，之杭孤山；訪注孝廉云居，訪仁庵師。海上亂，防海之師望門而食；故居苦于蹂躪，乃移居剡中（即化安山）。有山居雜詠詩；公謂讀之橫身苦楚、淋漓滿紙者也。晦木公奉太夫人寓三溪口，公間日往來定省（明年冬，返故居）。哭沉昆銅有句云：傳死傳生經(jīng)二載，果然烈火燎黃琮。

十七年庚子，公五十一歲。

居龍虎山堂（四明北麓有化安山，故宋所謂剡中也。東峰狀類虎、西峰狀類龍，公丙舍適當(dāng)其間，因名曰龍虎山堂）。八月甲午（十一日），為匡廬之游。過蕭山，訪徐徽之，不遇。渡錢塘，天章寺晤高旦中。九月丙寅（十四日），抵南康。

辛未，入山；拜李忠毅公祠，宿開先寺，與嚴(yán)羽儀夜坐。游萬杉寺，訪白鹿洞、經(jīng)凈妙寺，歷凌霄巖，登五老峰絕頂；下萬松坪，遇徐州閻古古爾梅，限韻賦詩大林寺。尋虞永興碑，歸宗寺、辨真凈元社，至玉川門，與雁川夜話，即柬方密之（檢討方以智。時已為僧，改名宏智，字無可）。十月丁亥（五日），返南康。庚子，舟發(fā)五老峰下，猶上云龍寺、探雨花洞，遂之金陵。復(fù)買舟至崇德，適高旦中、澤望公在城中，入宿其寓。十一月己巳（十八日），發(fā)崇德。丁丑，返姚江。有匡廬行腳詩、匡廬游錄。

十八年（辛丑），公五十二歲。

仍居龍虎山堂，著易學(xué)象數(shù)論（鈔入四庫全書，新安門士校梓）。元夕，甬上門士萬允誠斯禎、季野斯同、貞一言訪公山中。春暮，之甬上，寓高氏小樓；與辰四斗權(quán)、旦中斗魁昆仲賦詩話舊。王侍御仲撝來，公授以天官壬遁之學(xué)。公方著緯書三史，仲撝欲居剡共學(xué)。常熟鄧孝廉起西大臨（時已為道士）自甬返，過訪，倡和旬日；公與之偕至武林。歲盡，避盜出龍虎山，權(quán)寓故居。

康熙元年（壬寅），公五十三歲。

元夕，甬上萬子貞一來訪。越數(shù)日，郡中劉百繩先生汋（忠正公子）來訪。二月壬子（八日），龍虎山堂災(zāi)。五月乙亥（三日），故居又災(zāi)。公詩所云：「半生濱十死，兩火際一年」是也。九月，徙住藍(lán)溪市（即陸家埠）。約是年詩為「露車集」，志不安處也。著明夷待訪錄（次年冬削筆，二老閣校梓。公又著有留書一卷）。

二年（癸卯），公五十四歲。

四月，至語溪。館于呂氏梅花閣，有水生草堂唱和詩。吳孟舉之振暨猶子自牧讀書水生草堂，與公聯(lián)床分檠，共選宋詩鈔。踰月，以弟澤望公報病，馳歸。八月癸卯（八日），澤望公卒（詳公所作壙志）。太夫人七十壽慶，公有句云：白首有兒仍向?qū)W，浙河此母尚安全。是年詩名「心斷集」，用盂襄陽「心斷脊鸰原」之句也。劉伯繩先生問律呂，公以書答之。

三年（甲辰），公五十五歲。

二月，同弟晦木公偕高旦中之語溪。四月杪，益以呂用晦、吳孟舉，同至常熟；適虞山病革，一見即以喪事相托。公未之答；虞山言顧鹽臺求文三篇（一莊子注序、一顧云華封翁墓志、一云華詩序），潤筆千金，使人代草，不合我意，知非兄不可。即導(dǎo)公入室，反鎖于外；公急欲出，二鼓而畢。虞山叩首稱謝。鄧起西以精舍館公，款對數(shù)人，張雪崖、顧石賓皆起西之道侶也。尋與顧公子玉書麟生（裕愍公子），訪李膚公遜之（忠毅公子）于赤峰、訪熊漁山開元于烏目（時熊受法于靈巖繼公）。返棹，起西送公于城西楊忠烈祠下，涕泗而別。吳門，訪周子佩茂蘭（忠介公子）兄弟，即主于其家。越數(shù)日，同弟晦木公暨高旦中上靈巖，宏繼起儲，集文蓀符秉（文肅公子）、徐昭法枋、周子潔、鄒文江、王雙白于天山堂，中有文數(shù)篇，昭法見之，嗟賞不已，謂此真震川也；繼起遂乞公作三峰第二碑。公約文江同訪沉眉生；文江失約，公亦悵然而止。返杭，寓湖上，遇申山人自然于南屏；公問其癸巳同來之客，霜霰將盡，相視唏噓。凈慈奯堂為公燒豬沽酒，痛飲而歸。六月，返里。甬上門士萬公擇斯選過謁，見公詩稿零落，許寫凈本；公因汰其三之二，取蘇文忠行記之意，曰「南雷詩歷」。是年詩，系之「吳艇集」。問劉伯繩先生病，留郡城半月。十月初，復(fù)之語溪。十二月初。旋里。

四年（乙巳），公五十六歲。