十四年八月十九日，圣駕視學，釋奠禮成，步至東西廡，遍閱諸先儒神位，因召禮部左侍郎王錫袞、右侍郎蔣德、祭酒南居仁三臣諭曰：“宋儒周、程、張、朱、邵六子，有功圣門最大，今稱以先儒，位在漢、唐諸儒下，禮殊未稱。爾部會同詹翰等官，議所以尊崇之。至于六子格言，即督令儒臣編纂成書，以弘圣教。”三臣承旨，即于九月題請開館編纂六子諸書。而尊崇位號，時廷議不一，不果行。
大學士周延儒罷。延儒林居時，長興周仲璉特往通譜，敘叔侄禮，事之惟謹。延儒之再召也，秀水吳昌時為之效力奔走。延儒入都，仲璉宮兵部員外，昌時官禮部郎中，共入其幕下。每朝夕，輒便衣直達臥室，與侍者交通，探聽閣中消息，隨在外招搖市權。昌時醉心吏部，誠得一日稱吏部郎，即死無恨，宜興亦擬借此塞其望而遠之，遂以郎中調文選司，破格極矣。往時科道年例在二、八兩月，科一人，道二人，間或吏部一人，此舊例也。昌時為政，例推給事中范士髦等四人，御史陳藎等六人。科道群起大嘩。吏科都給事中吳麟徵、河南掌道御史祁彪佳率兩衙門集于公所，與時昌面議。及是日，科道齊集，援集例相責，昌時怙過，絕無引咎意。御史某不勝其憤，以所坐椅搏之，昌時倉皇而出，且曰：“若奚為待我如此？我當盡例出諸御史。”諸御史聞之，咸怒發上指，與時昌有不兩立之勢矣。又宜興自恃圣眷，視同官蔑如也，井研輩皆有慍心。緹帥駱養性有陰事，宜興刺得之，以挾制駱，使為己用，往來傳遞者，昌時也。養性時有厚饋，宜興不受，昌時竟隱匿焉，養性以此飲恨刺骨。內奄王之心頗不樂宜興，曾向宜興云：“我們才力有限，還求老先生包容。”聞者危之，而宜興不以介意。清兵入犯，宜興督師逐之。總督范志完，宜興辛未所取士，其人大言不慚，無纖毫實用，宜興以一切軍情委之。宜興之出督師也，上注望甚殷，刻刻遣人偵伺。而宜興駐通川，每日幕客攢集，午后始開門收文書，應故事，所謂躬歷戎行，鼓舞將士者，未之能也。清兵出口，各路援師尾之而行，不敢邀擊，厚賄宜興以求敘功，宜興諾之。襄城伯李國禎與王奄俱有私人，欲入敘功疏中，宜興不從，乃比而揭其短入告，謂：“清兵已驕，邀而擊之，可只輪不返，宜興私通清兵，禁諸將不得一矢相加遺，坐是，安然出口。”上信以為然。適給事中吳甘來、御史王章疏參本兵張國維，而德州兵備雷演祚亦疏參范志完，皆與宜興有連。奉旨：“周延儒著府部九卿科道議處。”閣臣各詞申救，得旨：“內外多艱，用人罔效，誤國害民，皆朕不德所致。周延儒著致仕去。”
特旨：“修撰魏藻德升禮部左侍郎兼東閣大學士。”藻德辭，陳演請：“改少詹事辦事，仍照三品用。”上從之。此與劉之綸同一破格。然之綸以戒事超授，雖未成功，猶歿于陳，與藻德天淵矣。
八月，會試天下士，命大學士陳演、魏藻德為試官，取中陳名夏等三百五十人。時以邊警，大計改五月，會試改八月，閣臣循序，應以蔣德為副，時上究心天象，凡日月見食，及星宿纏犯，取中國歷驗之不甚應，以西歷驗之輒應，遂加西人湯若望尚寶司卿，專理歷法。先是召對，德奏及之，曰：“湯若望有何好處，皇上如此優禮？”上曰：“古帝皇招來遠人，湯若望遠夷慕化，朕故優待之有加。卿言清兵屢次內犯，震驚宗廟，卿何不攆之使去？”及是，遂抑德而用藻德。而棘闈之役，亦止于此。藻德離李廉未三年，驟典文場，說者謂文脈亦促甚矣。
兵部尚書張國維罷，逮總督范志完、順天巡撫潘永圖下獄。時給事中吳甘來疏論：“國維昔任撫江南，惟以巧言令色為務，有‘浪子中丞’之稱。及任本兵，寸籌莫展，惟首輔意旨是徇，打恭作揖，便成職業”云云。上頗知國維罪狀，疑加重譴，國維捐厚資，乞援于內奄。乃得旨：“閑住。”德州兵備雷演祚，疏論志完在山東縱兵淫掠及金銀鞍數千兩，馬百匹，行賄京師等事。有旨：“志完革職逮問。”永圖以失機，亦奉旨：“革職逮問。”
范志完伏誅。上特召雷演祚入朝，與志完面質于中左，問疏內所奏事款，歷歷有據。上又問演祚曰：“爾所言稱公頌德，遍于班聯者，誰也？”演祚對：“周延儒招權納賄，如起廢清獄租，皆自居為功；考選科道，盡收門下；凡求總兵、巡撫者，必先通賄幕客董廷獻，然后得之。”上即命逮廷獻，上問志完金鞍馬匹，招稱送右諭德方拱乾。上并召拱乾，拱乾力辨云：“臣以詞林冷局，無票擬招駁之責，且甫入都，安有此事？”上即令拱乾去。志完被逮，知上方注意封疆，決無生理，滿載輜重，望門投送，而不得要領，卒置于法。永圖亦坐封疆失事律，決不待時。
逮大學士周延儒于家，吏部尚書鄭三俊罷。先是，御史祁彪佳賀登選各疏，參吳昌時紊制弄權，給事中郝昌疏劾：“吳昌時、周仲璉竊權附勢，納賄行私。內閣票擬機密，每事先知。總之延儒天下之罪人，昌時、仲璉，又延儒之罪人。”至是，御史蔣拱宸疏論：
“昌時入延儒之幕，與董廷獻表里為奸，無所不至，贓證累累，萬目共見。即如南場一榜，非其親戚，即以賄賂，皆昌時為之過付，伊弟肖儒、伊子弈封公然中式，毫無顧忌，以至白丁銅臭汪庶、陳咨稷等，皆夤緣登榜。其貪橫如此，尚知有朝廷法紀哉！”
末又指“通內”一事。時緹帥駱養性細刺昌時與延儒通賄諸款，具事件上聞，諸奄亦盡發延儒蒙蔽狀，復遣緹騎逮延儒對勘，而三俊以舉用昌時引罪回籍。延儒就逮，將所居樓閣三楹盡行焚毀，蓋生平寶藏，咸集于此。紫貂帳以十計，清河參有一只重十兩者，金珠非最上乘不能登此樓。焚時，火焰皆作五色云。
蔣拱宸疏參宜興及吳昌時，內有“通內”一事，為上所最忌。七月二十五日，召府部九卿科道廷鞫，上角素，率太子與定王同訊。呼昌時前，詰其通內，上聲色俱厲。昌時辨：“祖宗之制，交結內侍者斬，法極森嚴，臣不才，安能犯此？”上呼蔣拱宸面質，拱宸戰栗，匍伏不能措一語。上愈怒，叱退拱宸，然上意已有成局，不待拱宸之對質也。昌時始終不為屈，曰：“皇上必欲以是坐臣，臣何敢抗違圣意？自應承受。若欲屈招，則實不能。”上即命內侍用刑，閣臣蔣德、魏藻德出班奏曰：“殿陛之間，無用刑之例，伏乞將昌時付法司究問。”上曰：“此輩奸黨，神通徹天，若離此三尺地，誰敢據法從公勘問者？”二閣臣奏：“殿陛用刑，實三百年未有之事。”上曰：“吳昌時這廝，亦三百年未有之人。”二閣臣口塞，叩頭而退。內侍遂進用夾，兩脛皆絕，昏迷不省人事，乃命下錦衣衛獄，昌時已不能行，衛役負之以出，進見衛帥駱養性曰：“請受刑。”養性曰：“汝甫受刑，尚不省人事，且俟后審。”越數日，衛審一如廷鞫，語不稍屈，乃刑其兩家人，亦終無所招，后有旨：“送法司。”咸謂有生機矣。不數月而斬決之旨下。先是，韓城之逮也，昌時本無所置力，而掠之居以為功。王陛彥臨刑恚恨曰：“吳昌時殺我也！”旁人皆為咋舌，而昌時更揚揚自得也。及是，奉旨：“吳昌時著即會官斬決。”與王陛彥之旨同，人以為有天道焉，其實不盡然也。
逮張國維下獄。時追論其中樞誤國之罪，故部擬“贖徒。”有旨：“張國維中樞溺職，一徒豈足蔽辜，還著再擬具奏。”
九月。廷對策士，賜楊廷鑒、陳名夏、宋之繩進士及第有差。
上點禮部尚書李建泰、左副都御史方岳貢，俱以原官兼東閣大學士入閣辦事。岳貢守松江十五年，以錢糧拖欠，停俸督徵，故久稽不遷。今春入覲，有以岳貢操守廉潔薦者，上特授左副都御史。適吏部某以某事奉旨詰責，尚書李遇知曰：“臣正行糾駁。”岳貢云：“何不即行題參？”一語深當圣意，遂同建泰入閣。從來閣臣無帶都御史銜者，亦變例也。
給事中時敏，例推金華太守，敏求援于岳貢。岳貢令急進一條陳，疏方具，忽奉嚴旨：“下部議處。”眾相訝不解所謂，及例推本上，岳貢票旨：“時敏方在議處，何得遽行升擢？員缺另推。”議本上，奉旨：“時敏著降三級照舊管事。”仍嚴然文郎矣。
周延儒賜死。宜興逮至旅邸候命，所挽回者，不遺余力，欣欣向榮之念。及是夜半，而勒令自盡之旨下，宜興從幞被扶起聽旨。旨內先歷數其罪，至姑念句，內奄止不即讀，宜興意有非望，稽首稱圣恩者再四。奄候其稽首畢，始宣“著勒令自盡。”宣興悸魄喪魂，左右不能自持，繞屋而走，妄思竄逸，緹帥令二緹騎執持之，延至四鼓，緹帥乃勉強從事。又宜興素服參附，氣斷矣，四肢猶暖潤如生，緹帥懼有他虞，急以釘釘入腦門，始敢復命，較之韓城為尤慘云。先是，上與閣臣語及宜興曰：“朕恨其太使乘。”晉江以告宜興。曰：“事如此英主，不使乖，不得也。”周仲璉費四萬金，乃免于難。
上特起沈自彰為文選郎中，改四川布政張法孔為職方郎中，加太仆卿銜，皆以其有廉名也。
上禁諸臣服飾，袖長不得過一尺，宮中盡撤金銀等器，俱用陶器，并諭誡諸臣，不得擅用金銀。說者謂黃鐘大呂，清廟明堂之器，文質彬彬，斯為美矣。亻塞極則鬼，君子病之。今以玉食萬方之主，而降為污尊懷飲之事，是貉道也，何以能久。
北兵退后，京城瘟疫盛行，朝病夕逝，有全家數十口一夕并命，人咸惴惴慮其不免。上時令張真人建醮祈安而終無驗，日中鬼出為市，店家至有收紙錢者，乃各置水一盂于門，市者令投銀錢于水，以驗真偽。民間終夜擊銅鐵器聲，以驅厲出，示聲達九重，上不能禁。景色蕭色，早知有黍離之嘆矣。
宮中有囗庫累朝不開，上至是忽欲開閱。珰以從來未開為言，而上意甚堅，珰不敢逆，開進，空無所有，止后架貯小紅箱一只，捧至，預書崇禎某年某月某日開。上以其預定也，益異之。及啟視，止盛畫三軸：其一則無數軍民，相背而立，上曰：“此殆言軍民背反耶？”其二，則無數官吏士民，俱若倉皇逃竄之狀，上曰：“嘻，亂離不遠矣。”其三，則止有一人被發赤體，其貌則儼然御容也。群珰相顧動容，上憮然不樂而出。
是年正月，李賊圍承天，知府某開門迎賊，巡撫宋一鶴、鐘祥知縣蕭漢皆死之，巡按李振聲迎降，與賊通譜。飲天監博士楊永裕亦降，請發顯陵，忽大聲起山谷若雷震，賊懼而止。賊至黃陂，知縣某挈印走，賊設偽官，士民殺偽官，賊怒，反兵屠之，遂陷德安。黃州守將王允成棄城東下，方國安諸賊退屯漢口，左良玉亦東下。
江陵舉人陳萬策、李開先為賊侍郎喻上猷所開薦。賊檄下，萬策自縊，開先觸墻死。
獻賊襲陷蘄州，屠之，兵備許文岐徇難，復陷蘄水，亦屠之。
二月，湖廣賊陷澧州，又陷武岡川，岷王遇害，隨合于闖。闖賊令老犭回犭回守承天，羅汝才守襄陽，而自攻郟縣。知縣李貞率士民堅守，殺賊甚眾，力竭乃陷。李貞罵賊不已，賊怒，褫其衣冠，倒懸于地，貞大呼曰：“高皇帝有靈，我必訴之，愿為厲鬼以殺賊！”賊愈怒，斷其舌，剮之；母喬氏及妻俱死。賊還屯荊州。
五月，李賊攻常德，巡撫陳睿謨逃，城遂陷。嗣是辰、岳相繼俱陷。獻賊自蘄水一夕馳至黃州，乘大霧攻城，城遂陷，原任副使樊為城罵城，賊刺之，洞胸死。麻城周文江降，賊署為偽知府。
闖賊襲殺革里眼、左金王、并其眾。時群賊俱奉闖賊約束，惟革里眼不相下，闖賊置酒宴左、革，殺之席上。革里眼，即賀一龍也。
四月，闖賊突入羅汝才營，即其帳中斬之，并殺其謀主袁圭。
五月，賊攻袁時中，殺之。時中初合于闖，闖許配以女。至是，時中通款于河南巡按蘇京，又擒闖賊零騎請攻剿，故殺之。
五月，獻賊逼武昌。時議募兵守城，而庫藏空虛，三司長詣楚王請貸數十萬，王不應。募兵皆謂宜募土著。適承德潰兵東下，楚王盡招之，號為“楚府兵。”乃獻賊陷漢陽，臨江欲渡，武昌大震，議撤江上兵，嬰城而守，都指揮崔文榮曰：“磨盤、煤炭諸洲，淺不過馬腹，縱之飛渡，而嬰城坐困，非策也。”議者不從，賊果從煤炭洲南渡，直逼城下，攻武勝門，文榮率軍御之，多殺傷。而楚府新募兵，開門迎戰，文榮躍馬持矛大呼，殺賊三人，賊攢刺之，死。舊輔賀逢圣合家投塾子河死。長史徐學顏與賊格斗，左臂斷，右臂持刀撲之，賊臠之。游擊朱士鼎為賊所執，戟手大罵，賊去其左右手，自沉于江死。賊執楚王，盡取宮中藏金，輦數百車不盡，楚人于是憾王之愚也。賊沉王于江，屠戮士民數十萬，沿江積尸千里。其幸存民，或刖手足，或鑿自鼻，無一全形者。
闖賊陷保康，知縣石維壇死之。別賊至禹州，守將楊芬、張朗降。
七月，總督孫傳庭發兵潼關，以總兵牛成虎、盧光祖為先鋒，會河南總兵卜從善、陳永福，合兵雒陽之下池寨，檄左良玉赴汝寧夾擊。令副總兵高杰將降丁為中軍，總兵王定官撫民，率榆、寧二鎮兵為后勁。
總兵方國安合副將徐懋德、馬士秀等由蘄州進發，夜擊賊于大冶，斬首千級。前鋒既勝，左鎮諸軍并進，獻賊令賊將守武門為浮橋于金口，悉眾西渡向岳州。
八月，孫傳庭師次閿鄉，闖賊亦進，盡發荊、襄諸賊，會于河南。牛成虎前驅，遇賊于雒陽，擊敗之，再擊于河岸，又敗之，追走至汝州，成虎以孤軍無繼，退屯澠池。
丙寅，方國安等復黃州，斬偽官。癸酉，諸將進次楊邏堡，距武昌三舍。監紀推官吳敏師聯絡蘄、黃義勇萬人，與師會，總兵常安國以舟師先進，轉戰金沙洲，奪賊百艘。丙了，諸將齊至武昌，獻賊出戰，大敗，遂西走，陷咸寧、蒲圻，距岳州百里，湖南巡撫李乾德、總兵孔希貴，盡移居民遠徙，而伏兵于內，開門迎賊，賊入，伏兵盡發，盡殲之，留四賊，各割一耳，貫箭縱回。獻賊怒，益來攻，乾德虛立營壘，下伏大炮，而積薪其上，賊以火攻之，大炮發，殺賊數千。賊愈怒，悉眾圍岳州，百道并攻，遂陷，乾德、希貴走長沙。戊寅，賊至湘陰，城已一空，獻賊登舟南渡，忽大風起，覆舟，溺死賊數千，復還岳州，盡殺所掠婦女，焚其舟。陸行抵長沙，士民空城走，乾德奉吉王、惠王走衡州。守將尹先民迎降，推官蔡道憲不屈，殺之。健卒林俊等，解衣裹尸，葬道憲于南郊，俱自縊。
九月，孫傳庭次汝州，偽都尉四天王李養純率所部來降，知賊在寶豐，傳庭進圍寶豐，賊堅守不下。闖賊以輕兵來援，白廣恩、高杰、盧光祖逆戰于城東，敗之。次日，復以精騎數千，直攻官軍，復擊走之。傳庭曰：“寶豐不急下，而援兵大至，賊腹背受敵矣。”親督諸軍，悉力攻城，拔之，斬偽官陳可新等千余人，遂以大兵搗唐縣。時賊家口盡在唐縣，官兵入城，盡殺之。甲辰，傳庭復郟縣。縣甚窮，官軍乏食。闖將將精騎萬余逆戰，官軍擊斷闖賊坐纛，三戰三勝，闖將奔襄城，官軍進逼之。時河南所在饑荒，官軍饋糧不繼。壬子，兵噪于汝州，降盜李際遇陰通賊。癸丑，賊率精騎大至，傳庭問計于諸將，高杰請戰，白廣恩曰：“師老矣，宜分據要害，步步為營，以圖萬全。”傳廷恐賊遁，曰：“將軍何怯也，獨不如高將軍耶？”廣恩不怪，引所部八千人南走。賊設伏以待官軍，官軍接戰，陷賊伏中，大敗。高杰乘嶺上望之，曰：“不可支矣。”麾眾急退，官軍大奔，賊驅大隊來，追至孟津。是役也，士卒死者四萬余人，盡喪其軍資甲仗，傳庭與杰走河北。戊午，闖賊向潼關，白廣恩擊走之，傳庭亦加軍潼關，眾尚有四萬人。
獻賊襲陷衡州，桂王及吉、惠二王走永州，獻賊復追之，湖南巡撫劉熙祚遣兵護三王入廣西，而自入永州拒守。奸人內應，熙祚不屈遇害。戊戌，官軍復岳州，盡誅偽官。獻賊東犯江西萍鄉。
十月辛酉朔，副總兵沈萬登復汝寧。是日，賊將軍馬司尚志蒞任，萬登擁眾突入，誅尚志，并殺諸偽官。時襄、雒豪杰并起，萬登與毛顯文、劉洪起皆起布衣，聚眾數萬，各保寨以逐賊。闖賊偽授萬登威武大將軍，不受。鳳督馬士英承制，授為副總兵。
闖賊遣弟一只虎陷閿鄉，遂攻潼關。闖賊間道緣出崖出潼關后，官軍大驚，遂潰，賊盡入關掠。傳庭、白廣恩退屯渭南，賊合眾十余萬陷渭南，傳庭陣亡，知縣楊暄死之，隨陷商州，商雒道黃世清死之，直抵西安，巡撫馮師孔督兵出戰，被執不屈死。西安陷，按察使黃綱自盡，長安知縣吳從義、指揮崔爾達、秦府長史章尚纟，俱投井死。鄉紳右都御史焦源溥、御史王道純、禮部主事南居益、都司使邱從周，俱罵賊死。宣府巡撫焦源清、山西參政田時震，俱不受偽職死。磁州兵備祝萬齡自經。學官山東僉事王徵七日不食死。舉人席增光、朱誼俱投井死。而左布政陸之祺、總兵白廣恩俱降。闖賊據秦王府，授秦王偽將軍世子，妃劉氏曰：“國破家亡，愿一死！”闖賊遣歸母家。秦藩富甲天下，盡為賊有。賊分兵徇諸縣，蒲城知縣朱一統抱印投井死，中部知縣華堞與一妻一妾俱自縊。賊改西安為長安府，榜掠巨室助餉。
獻賊陷袁州，令賊將邱仰寰居守。左良玉遣兵攻袁州，參將高山奮身先登，斬賊數百級，擒斬邱仰寰，遂復袁州。
獻賊至長沙，突至吉安，官軍驚潰，兵備岳虞蠻逃，城復陷，賊復入袁州。
十一月，闖賊命賊將由斌守西安，而自往延安大會群賊。分五百騎按行，鳳翔守將誘而殺之。闖賊怒，親攻鳳翔，陷之，屠其城。遂逼榆林，兵備都任及原任總兵尤世威、王世顯、侯世祿、惠顯、侯拱極等，斂各堡精銳入鎮城，歃盟誓神，推世威為主，協力拒守，賊誘說三日不聽。賊四面環攻，城上強弩疊射，賊死尸山積，賊攻益力，逾旬日不克，賊以沖車環城穴之，城崩數十丈，賊乘勢擁入城，遂陷。都任各家自縊死。尤世威縱火焚其家百口，揮刀突戰死。諸將各率所部巷戰，殺數千賊，至死無一降者。合城婦女俱自盡，無一受辱者。賊攻甯夏，總兵官撫民迎降。賊攻慶陽，堅守四日，力屈，城陷，守、巡二道段復興、董琬、鄉紳太常少鄉麻禧俱死之。賊屠慶陽，執韓王。
獻賊知官兵陷岳州，沿江設伏，而令賊千人，以巨艦載輜重順流下，副將王世泰、楊文富邀擊之。賊佯走以誘官軍，官軍溯流爭上，盡奪輜重，賊伏發，四面夾攻，官軍大潰。賊復入岳州，左良玉令馬士英趨長沙，馬進忠等趨袁州，士秀等復臨湘，進逼岳州。賊將混天龍統萬人乘輕舟迎戰，士秀三分其軍，繞賊舟后反擊之，賊大敗，趨入城，士秀麾諸軍登岸，急攻之，賊突門出，走長沙，遂復岳州。馬進忠等進薄袁州，賊西走，遂復袁州，盡誅諸偽官。總督呂大器亦統兵復吉安。
殺太監劉元斌。元斌監國討賊，賊在陜雒，元斌留歸德不敢進，縱兵大掠，殺樵汲者冒功。及論辟，未得旨，即奏辯，上怒誅之。
十二月，闖賊徇西北莊浪、涼州二衛，俱降，遂圍甘州，乘夜雪登城，巡撫林日瑞、總兵郭天吉、同知藍臺等皆死之。殺軍民四萬七千余人，余處俱投降，惟西寧衛固守不下。
十七年甲申正月庚寅朔，大風震屋揚沙，咫尺不見，占曰：“風從乾起，主暴兵至，城破。”癸丑夜，星入月中，占曰：“星入月中，國破君亡。”時闖賊僭偽位于西安，偽號“大順，”偽元“永昌。”宋獻策偽軍師，牛金星偽丞相。設偽六政府：偽吏政宋企郊，偽戶政楊建烈，偽禮政鞏育，偽兵政喻上猷，偽刑政陸之祺，偽工政李振聲，皆明臣降賊者。
上困寇氛孔棘，臨朝，向閣臣嘆曰：“賊勢如此，閫外無人承認，府庫殫竭，將如之何？”李建泰奏：“主憂如此，臣敢不竭駑力，臣家曲活，愿以家財佐軍，臣請提兵。”上大喜，慰勞再四，曰：“卿若行，朕當訪古推轂禮，親餞卿郊外，不敢輕也。”建泰退，即具揭，題用衛貞固、凌回，又題郭中杰加副總兵銜管中軍事，又請馬兵五百及旗牌等項，遂于二十六日啟行。上預傳：“至期行遣將禮，朕御正陽樓宴餞督輔，并召內閣五府部院掌印官侍坐，鴻臚贊禮，御史糾儀，大漢侍衛，應用法駕宴桌，該衙門預備。”上又命查《大明集禮》中遣將授鉞告廟禮，看議酌行，是日乙卯，上御正陽門樓親餞之，曰：“先生此行，如朕親征。”建泰受餞，叩首謝恩，既去，上目送久之。返駕，復大風沙。占曰：“不利行師。”
二月，闖賊統眾四十萬，從禹門渡黃河，陷絳州、曲沃、臨晉、河津。破蒲州，舊輔韓廣死之。破平陽，知府張嶙然迎降，巡道李士焜逃，總兵高杰退至澤州，沿途大掠，賊遂薄太原。時初六日也。巡撫蔡懋德遣標下驍將牛勇、朱孔訓出戰，孔訓傷炮死，牛勇陣亡，一軍皆沒，城中奪氣。懋德知事不可支，寫遺表令賈士章走京師上聞。中軍盛應時先殺某妻子，誓將死敵。初八日，風沙蔽天，賊夜乘風登城，懋德應時赴斗死。布政趙某、副使毛某及府縣鄉紳等官，共四十六員，皆死之，晉王遇害。
上傳工部尚書范景文、禮部侍郎丘瑜，俱以原官兼銜，入閣辦事。
上御書親敕督輔：“朕仰承天命，繼祖宏圖，自戊辰至今甲申，十有七年矣，兵荒連歲，民罹干戈，流毒直省。今卿代朕親征，鼓勵忠勇，選拔雄杰。其驕怯逗玩之將，貪酷倡逃之吏，當以上方劍從事，行間一切調遣賞罰，俱不中制，卿宜臨事而懼，好謀而成，真剿真撫，掃蕩妖氛，旋師奏凱，勒名鐘鼎。須代朕至意，遍行示諭。”
建泰甫出都，師次涿州，營兵逃歸者三千人。過東光，兵不戢，士民閉城拒守。建泰怒，留攻三日，破之。至廣囗，紳衿城守不納，亦留攻三日，破之，殺紳王佐等及知縣張宏基。
闖賊至忻州，官民迎降。進攻代州，總兵周遇吉固守，連戰十余日，殺賊萬余，賊悉眾來攻，遇吉退守寧武關，賊復逼寧武，遇吉連發大炮，殺賊近萬人。會火藥盡，有請款者，遇吉曰：“三日內殺賊且萬，若輩何怯耶？能勝之，一軍盡為忠義；若不支，縛我以獻。”于是開門奮擊，殺賊數千人。賊懼，欲退，或為賊謀，請分為十隊，更番迭戰，且去帽為識，有帽者輒殺之。賊乃引兵復進，去帽以自別，官軍不能支，城陷，遇吉縱火焚其家，而自揮短刀力斗，身中流矢，牙兵俱盡，遂見執，罵賊甚厲，賊怒，縛于市磔之，屠寧武。
太常寺少卿吳麟徵請棄關外寧遠、前屯二衛地，徙總兵吳三桂入關，屯兵近郊以衛京師，廷臣皆以失地非策，莫敢主其議。
上諭：“吳昌時著即會官斬決。其財產并罪輔周延儒貯產籍沒充餉。”上又諭：“周延儒見賄忘法，本當全沒家產，今量追十二萬，著周肖儒、周奕封完納；吳昌時量追五萬，俱免籍沒。”
上命太監閻國輔等，賚餉往薊、寧等處給軍。時始聞山西全陷。
上分遣太監監制各鎮：“盧維寧往通、津、臨、德，方正化往真、保，杜勛往宣府，王夢弼往大名、廣平，閻思印往順德、彰德，牛文炳往衛輝、懷慶，楊茂林往大同，李宗化、張澤民往薊鎮中、西二協。
上特升兵部都給事張縉彥為兵部尚書，又令兼翰林學士。
闖賊至大同，軍民皆降，總兵朱三樂自刎，巡撫衛景瑗、兵備朱家仕、糧儲徐有聲皆死之。庠生李若葵合家九人，俱自縊。先題曰：“一門完節。”代王遇害，賊殺代府宗室殆盡。
上召忻城伯趙之龍、撫寧侯朱國弼中左門面對。乃命國弼總漕淮安，之龍掌南京中軍都督府印，管守備事。
闖賊陷真定。先是，知府丘茂華聞城警，預定令家眷出城，巡撫徐標下茂華于獄。標中某某，伺標登城指畫守御時，乘不意，掖而投之城外，殺之，從獄中擁茂華出，茂華遂檄所屬州縣，預備迎賊。數日后，賊始以百騎來受降，時二十二日也。二十三日，上召諸臣面對。先是，左都御史李邦華密疏請：“擇大臣奉太子南行，臣等輔皇上固守。”圣意頗以為然。大學士陳演微泄之。是日召對，庶子項煜面具小疏，極言當南巡者八。上曰：“國君死社稷，正也，朕死決矣！”大學士范景文同邦華擬申前請，給事興時亨大聲曰：“奉太子往江南，諸臣意欲何為，將欲為唐肅宗靈武故事乎？”二臣乃不敢言。已而，上命魏藻德升兵部尚書，督師津、德，方岳貢升戶部尚書，督漕臨、濟。意擬從范、李二臣之請矣。既而，復撤前命。或云：“時傳闖賊已南下，故止之。”
三月，大學士陳演、蔣德罷。演以多貲，不敢出京，遂及于禍。
上召張國維于獄，同庶吉士史可程、舉人朱長治中左門面對。
昌平兵噪，焚劫城中，巡撫何謙以聞，有旨：“何謙戴罪供職。”
初四日壬辰，欽天監奏：“帝星下移。”
詔封各總兵吳三桂平西伯，左良玉寧南伯，唐通定西伯，黃得功靖南伯，俱給敕印。劉澤清實升一級，劉良佐、高杰、馬科、姜襄、孔希貴、葛汝芝、許定國、王承允、劉芳名、李棲鳳、曹友義、杜允登、趙光遠、卜從善、楊御蕃、馬岱、黃蜚、高第各升一級，督撫馬士英、王永吉、黎玉田、李希沉各加升二級。
詔總兵吳三桂、劉澤清、唐通帥師入援。三桂、澤清不奉詔，惟通以二千人至。陛見，上慰勞再三，同太監杜之秩守居庸。
大庸伯張國紀進助餉銀萬兩，晉封為侯。
上召文武大臣及科道于中極殿，問御賊之策。有言“守門乏人，請考選科道。”余皆“練兵加餉”套語。駙馬恐永固面奏：“賊勢猖獗，官兵畏賊如虎，祈簡才望大臣，重守都城，圣駕南巡，徵兵親討，臣號召京畿義勇，可從十萬眾扈從起行。”上意不決，諸臣皆言其誕妄。既退，議分守九門，稽察出入。召見庶吉士于中左門，特命陳名夏升修撰，兼戶、兵二科給事中。
闖賊陷宣府，叛將白廣恩先移書約總兵姜襄降，太監杜勛出城三十里迎賊入城，執巡撫朱一馮殺之，巡按霍達逃。
命給事中韓如愈、馬嘉植催解浙直京邊正項并改折贓贖，及周延儒、朱大典、吳昌時等贓銀督解。時賊信已急，諸臣咸思南竄，故二人營謀此差。如愈曾疏論劉澤清，過東昌，澤清遣人殺之。
晉封嘉定伯周奎為侯，上遣太監徐高宣詔求助。謂：“休戚相關，無如戚臣，務宜倡自十萬至五萬，協力設處，以備緩急。”奎謝曰：“老臣安得多金？”高泣諭再，見其堅辭，拂衣起曰：“老皇親如此鄙吝，大事去矣，廣畜多貲何為？”奎自具疏，勉助一萬金。太監王永祚、曹化淳等有助三萬五萬者。王之心富第一，上面諭之，對以家計消乏，僅獻一萬，后之心為賊拷掠現銀十五萬兩，金銀什物稱是。周奎抄出現銀五十三萬兩，什器緞疋無算。
上命張國維仍復原宮，總督浙直兵餉。初，國維就逮，輦揣知庫歲空虛，朝廷首急軍餉，乃倡開事例一法：殺人行劫者，皆得輸金贖罪。謂：“國維一至江南，數百萬可立致。”上惑其說，先諭刑部：“張國維附和罪輔，蒙弊君上，本當重治。念方士亮等輕擬，著免罪候用。”至是，有總督浙直之命。時賊警已逼，遂連夜疾趨，中途已聞變矣。過蘇州時，江南尚無所聞，應撫已移鎮，鎮江紳衿共留國維，即于蘇州抵住以資彈壓。國維自揣皇上已徇難，大位未定，事不可知，決意南歸。俟宏光即位，諸事就緒，始抵蘇州蒞任。
臨清總兵劉澤清虛報大捷，賞銀五十兩。又詭言隨馬被傷，再賞藥資四十兩。命速赴保定剿賊，澤清不從，即于是日大掠臨清，統兵南下，所至焚劫一空。
闖賊陷保定。賊至城下，李建泰迎降，中軍郭中杰縋城降，兵潰，遂陷。同知邵宗元佩府印被執，不屈死之。鄉紳御史金毓峒分守西府，賊執之謁偽將，毓峒奮拳毆賊，投井死，妻王氏自縊，侄振孫系武舉人，登城射賊，應弦立斃，賊攆殺之。毓峒女陳氏，年十八，尚未嫁，與其祖母張氏、母楊氏、嫂氏，同時投井，張氏抱其孫于懷同下，侍婢亦從而下。知府方文耀見城破，即自殺。
十三日，各城門分設紅夷大炮，給守城軍每名黃錢百文。連日日色無光，是夜風色陰慘，沙塵刮天。
上命襄城伯李國禎團練京營兵，又命太監曹化淳督理城守。
十五日癸卯，日色益晦，正陽門外伏魔廟杵忽自中劈，又南京孝陵夜哭。
闖賊叩居庸關，總兵唐通、太監杜之秩迎降。
總督王永吉兵敗，陷賊，賊縱之歸。本兵張縉彥為請召對，閣臣疑之，叩縉彥以永吉來意。縉彥初不言，固問之，乃云：“李自成有二策，請上擇之：一如漢楚故事，畫地為界；一解歸誠以大將軍輔政。”閣臣大駭，遂票旨：“王永吉喪師辱國，不準召對。”
闖賊至昌平，軍民爭降，總兵李守钅榮力格殺數賊，賊攆刺之，乃拔刀自刎。鄉紳張羅彥自殺，巡撫何謙南奔。
十六日，上御殿，召考選各官，問以治餉安民，滋陽知縣黃國琦對曰：“裕餉不在搜括，在節慎；安民系于圣心，圣心安，則民心安矣。”上首肯，即面授給事中。余遞奏本半，忽秘封呈進，覽之色變，即起入內。久之，諭各官退，始知為昌平失守也。闖賊破昌平，將十二陵享殿悉行焚毀，隨分兵掠通州糧儲。
十七日，上召文武各官。上泣下，諸臣亦相向泣，束手無計。上書御案，有“文臣個個可殺”語，密示近侍，隨即抹去。是日，襄城伯李國楨領京營兵出城立營，城下數萬人，一時潰散。夜漏半，曹化淳開廣寧門迎賊入，守城勛衛皆逃。御史王章，賊呼之降，不應，遂殺于城上。給事中光時亨即長跪迎降。
賊軍師宋獻策占十八無雨，則京師不可破；有雨，則一攻即下。至是日，黃沙障天，忽而凄風苦雨。良久，冰雹雷電交至。時賊已屯西城下，火炮飛入城中，西城竟日無人敢行。近暮，定武橋南火起，始知外城已陷。奄走告上，上曰：“京營兵何在？李國楨練兵何在？”奄曰：“皇爺安得有兵？京營兵皆散，今惟有勸皇爺走耳！”先是，十五夜，上復召鞏永固問以前策，永固對曰：“賊前尚遠，人皆畏賊，六龍南幸，從者必多，今賊已逼近，人心瓦解，從行者臣不誤，誤陛下也。”上頷之。及是夜，叛奄杜勛至城下，呼王相堯縋城入講，或欲留之，勛曰：“我家萬歲爺爺，威勢盛強，不反命者，立屠京師矣。”遂縱去。一鼓，上召新樂侯劉文炳及鞏永固，令速帶家丁護駕。二臣曰：“臣等何敢私蓄家丁，所有家人，豈能當賊？”上亟退，召太監王承恩入，密語移時，急令出部署丁為巡南計。又別傳朱諭至內閣，命成國公朱純臣提內外諸軍，夾輔東宮，留守京師。已而，呼酒與周后、袁妃同坐痛飲，慷慨訣絕。妃先起，上拔劍砍之，斃。后急返坤寧宮，自縊，上視之曰：“好，好。”長平公主在旁哭不已，上叱之曰：“汝奈何生我家？”亦刃之，公主以手仰格，臂斷，悶絕于地上。又令太子定王出避民間，盡去本等冠帶，戒諭：“今后慎毋露帝皇家形跡。”時承恩復命，上即微服雜內奄出東華門，至朝陽門，托言王太監奉出城，守者請以天明請驗，扈從者奪門，守者反炮擊之，不得出。朝陽系朱純臣所守，急詣純臣第，閽人辭以赴宴未回。上嘆息而起，復走安定門，門閘堅不可舉。天將曉矣，乃返厚載門，散遣內丁，隨以永王、定王分送外戚周、田二家，手攜王承恩入內苑。是夜，閣臣方岳貢直宿精微科，四鼓，中涓口傳圣諭：“內閣諸先生速赴行在。”亟叩之，云：“倘圣駕已同鞏駙馬、王太監出宮矣！”太子叩嘉定門，周奎高臥不起，門役不納，乃走匿內奄某外邸。
十九日丁未，陰云四合，城外煙焰障天。宣武門守門太監王相堯領內丁千人，開門迎賊，偽將劉宗敏整軍人，軍容甚肅。張縉彥守正陽門，朱純臣守朝陽門，一時俱開，二臣迎門拜賊。賊登城，殺兵部侍郎王家彥于城樓，刑部侍郎孟兆祥死于城門下，兆祥子進士孟章明，同母何氏、妻王氏，自殺于寓。
尚衣太監何新見公主仆在未起，曰：“賊已將入，恐公主遭其辱，且至定府中避之。”乃負之出，宮人魏氏大呼曰：“賊入大內，我輩必遭所污，有志者早為自計！”遂躍入御河死，頃者從死二百余人。群賊入城，取道演象所，群象皆淚下如雨。
殉難者：太學士范景文投井死，戶部尚書倪元璐從容自縊，左都御史李邦華自縊于先文信國祠中。左副都御史施邦耀，大理寺卿凌義渠，太常寺少卿吳麟徵，太仆寺丞申佳允，給事中吳甘來、周而淳，御史陳良謨與妾時氏、陳純德、趙讠巽，吏部郎中劉廷諫，主事許直，順天推官劉有瀾，兵馬姚成，錦衣衛指揮李若、王國興，中書宋天顯，俱自縊。庶子周鳳翔于二十一日自縊。
中允馬世奇與妾朱氏、李氏同縊。修撰劉理順同妻萬氏、妾李氏、子舉人某、婢仆十八人俱自縊。檢討汪偉同妻耿氏左右，縊于堂中。武庫司郎中成德、金鉉同母章氏、妾王氏、弟王員金钅宗，俱投井死。光祿署丞于騰蛟，服冠服，呼妻亦服禮服同縊。生員曹文耀妻張氏，生四子一女，城破，張氏率子女哭于家祠，同文耀庶母姜氏、二媳李氏、鄧氏及乳母孟氏八人同縊。居氏田某合家自焚。李小槐同妻杜氏二子一女一婢，俱自縊。內官白某亦自縊。
新樂侯劉文炳，集男婦共十六人，登樓自焚；其弟劉文耀，同祖母瀛國太夫人投井死，時年九十余。
彰武侯楊崇善自縊，惠安伯張慶臻合門自焚，宣城伯衛時春率妻孥同投大井中，無一存者，都督周鏡自盡。
駙馬鞏永固，公主柩尚在堂，同子女四人，坐堂中縱火自焚。
逆闖入宮，問帝所在，大索宮中不得。偽尚璽卿黎志升進曰：“此必匿民間，非重賞嚴誅不可得。今日大事，不可忽也。”乃下令：“獻帝者賞萬金，封伯爵，匿者夷其族！”至二十二日庚戌，得先帝遺魄于后苑山亭中，與王承恩對面縊焉。先帝以發覆面，自礻合藍袍，白綢褲，一足跣，一足有綾襪，紅方舄，袖中書一行云：“因失江山，無面目見祖宗于天上，不敢終于正寢。”又一行云：“百官俱赴東宮行在。”二十三日辛亥，殮先帝、先后于東華門，梓宮二，先帝用丹漆，先后用黝漆；加先帝翼善冠，滾玉滲金靴，先后袍帶亦如之，同移庵內。主事劉養貞以頭觸地，大慟，諸臣哭拜者三十人，拜而不哭者六十人，余皆睥睨過之。叛閹某獻太子，逆闖留居西宮，封為宋王，太子不之屈。
宮人費氏，年十六，投眢井，賊鉤出之，賞賊將羅某。費氏紿曰：“我帝家人也，義難茍合，惟將軍擇吉成禮，死生惟命。”賊喜，卜日置酒極歡，費氏懷利刃，候賊醉，斷其喉，立死，費氏即自刎。
從賊者：大學士李建泰，兵部尚書張縉彥，戶部侍郎黨崇雅，禮部侍郎楊汝成，工部侍郎葉初春，少詹事楊觀光、項煜，諭德何瑞徵、楊士聰，修撰楊廷鑒、陳名夏，編修梁兆陽、高爾儼、李士淳、薛所蘊、趙玉森，庶吉士呂崇烈、成克恐、張之奇、楊明朗、張端、黃燦、張元琳、劉余謨、魯梁、魏天賞、劉廷琮、何九云、劉肇國、張元錫、李化麟、姚文然、高珩、胡統虞、傅學禹、羅獻文、白允謙、何允光、龔鼎孳、趙頻、李呈祥、傅鼎銓、劉世芳、周鐘、魏學濂、朱積、吳爾塤、楊棲鶚、王自超、史可程、梁清標，右通政趙京仕，通政參議宋學顯，尚寶卿吳家周，太仆寺丞李元鼎，給事中劉昌、戴明說、孫承、傅振鐸、申芝芳、時敏、米徽、翁元益、郭充、高翔漢、金汝礪、介松年、龔鼎孳、楊枝起，御史柳寅東、朱朗榮、馬貞固、傅景星、蔡鵬宵、裴希度、涂必泓、韓文銓、陳羽白、熊世懿，吏部沈自彰、左懋泰、熊文舉、王顯、侯佐、楊元錫、吳孳昌、郭萬象，戶部王鳳林、金震出、衛周祚、程之、劉顯績，禮部黃熙允、湯有慶、吳之琦、張琦、劉大鞏、朱芾煌，工部潘同春、繆元、鄒魁明、方允昌、黃徽允、李登云、呂趙龍、秦、馮秉清，司務孫節，大理寺正錢位坤，行人胡顯、李丕著、張元輔、東允謙、李之奇、許作梅，王予曜、沈元龍，國子博士李森先，學正王皋，光祿監事林銘球，順天照磨龔彝、侯以頭，考推官施鳳儀，知縣彭三益、黃國琦、孫以敬、王孫蕙，進士武愫、徐家麟、吳剛思。
逆馮入都，首先勸進者，陳演、朱純臣也。向賊叩頭求用，指斥先帝為無道者，魏藻德也。從獄中出而為賊策下江南者，張若麒也。其頌賊為救民水火，神武不殺者，梁兆陽也。代賊焚毀太廟神主者，楊觀光也。大負先帝委任，終以拷掠死者，李國禎也。先帝求金不應，東宮出亡不納，終赍盜糧，盡為賊有，負君辱國，貽恨千古者，周奎也。至叛奄曹化淳、王相堯輩，不足誅矣。
平西伯吳三桂，如清乞師。二十七日，三桂以清兵至山海關。先是，三桂聞京師失守，先帝殉難，統眾入關投降。而三桂父吳襄，故遼東總兵也，逆闖李自成執襄誅求金寶，索詐甚酷，三桂知之，即時返師出關，適清攝政王統兵將入大同，中途相遇，三桂即剃發詣營，叩首訴冤，愿假大兵復仇，歃血立誓。攝政王為撤兵西行。逆成聞三桂之來而復去也，急統馬步兵四十萬追之，劉宗敏、李過等皆從，并挾太子、二王東行，追及三桂于關外。三桂見賊甚盛，不敢迎戰，入啟攝政王。攝政王令三桂先與交鋒，而自登高望之，待三桂將敗，即揮英王、豫王分左右翼以進。時逆成亦挾太子登高岡督戰，賊眾三面圍三桂，勢危甚，忽有白標兵二隊，繞出其后，如發風涌潮，所到之處，無不披靡。逆成頓足嘆曰：“此必北兵也，三桂真挾北兵來耶？”急策馬走，賊眾大潰。次日，令降兵部郎張若麒，奉太子如三桂營請罷兵。三桂留太子，而益治兵，破逆成于關內。逆成驅賊連營進發，三桂悉銳出戰，清兵助之，賊眾大奔，自蹂踐，死者十余萬人，殺其渠帥五人。逆成走永平，三桂又追敗之，逆成奔還京師。時四月二十四日也。三桂同清兵壓城而軍，逆成遂殺吳襄，并殺其家口三十八人。二十九日，逆成出阜城門西走，縱火燒諸宮殿，又燒九門雉樓，火光燭天。三桂遙望城中火起，知賊已走，追至保定，奮擊敗之，再敗之于定州北。逆成憤極，復勒勁卒返擊三桂，三桂以清鐵騎沖堅突入，斬其渠帥數人、首萬余級，逆成中流矢墮馬，掖而騎，疾馳還營，即拔營歸陜西。三桂復以清兵掠陜西，逆成盡出銳卒迎戰，大敗，劉宗敏、田見秀等皆死，逆成乃棄西安，由商雒入鄖、襄，渡江趨武昌。逆成屢敗之后，每行軍，大隊在前，己率數十騎在后。一夕，大風飛沙，對面不相睹，逆成同二十八騎趨通山，登九宮山，鄉兵遇之，亂刃交加，遂剁逆成于馬下。
逆成既斃，賊眾無主，乃謀向何總督投降。時何騰蛟總督五省軍務，駐長沙，賊黨大隊投誠，皆虞其詐不敢應，相持兩日。長沙知府某，挺身而往，甫至，為賊所殺，賊哄曰：“我等降何總督耳，知府卑官來何為？”不得已，乃自往，賊眾望見，知為總督也，列隊羅拜，歡聲動地。何諭之曰：“若等來降，自當題請受爵，為國家建立大功。但若無糧餉奈何？”賊眾曰：“餉我等所儲甚裕，毋貽軍門憂。”何又虞賊眾甚夥，狼心未測，于是下令：“愿歸農者聽！”又分蒞其眾，賊黨散者大半。說者謂：“何爾時撫有其眾，激以忠義，鼓行而前，當必能下江南，畫淮而守。而逡巡顧忌，坐失機會，良可惜也。
時擬謚號者，大學士高宏圖也。后即有借此以攻宏圖者，復改為“毅宗。”按：謚法“恩”與“毅，”于先帝俱無取也。孟子曰：“世守也，非身之所能為也，效死勿去。”《傳》所謂“國滅君死，正也。”今先帝俟兩宮畢命后，始自為計，義也。初擬從權，徐圖后舉。既慨然知天命之不可爭，不難身殉以謝天下，智也。業已身殉矣，猶曰“因失江山，不敢終于正寢”，禮也。從容殉難，合乎大道，仁也。夫當變起蕭墻，禍介俄頃，而仁、義、禮、智俱全，而無失焉，可不謂正乎？按《謚法》殺身成仁曰“烈，”臨難不屈曰“正。”愚意修史者常具疏，特請更上先帝謚號曰“烈宗正皇帝，”先后謚號曰“孝烈正皇后。”