東京電影制片廠的巨型哥美拉模型在暴雨中泛著金屬冷光，雨水順著怪獸獠牙滴落，在地面匯聚成暗紅色的水洼。毛利蘭撐著傘，懷里抱著柯南，正焦急地尋找走散的園子。突然，一聲凄厲的慘叫劃破雨幕，聲音來自片場(chǎng)深處的倉(cāng)庫(kù)。“柯南，你留在這里！”小蘭將柯南塞進(jìn)附近的道具箱，自己沖向倉(cāng)庫(kù)。推開門的瞬間，她倒吸一口涼氣——制片人龜井躺在血泊中，胸口插著一把染血的哥美拉爪子，旁邊散落著破碎的假面超人面具。柯南悄悄爬出箱子，注意到倉(cāng)庫(kù)角落有個(gè)黑影閃過。他追過去，卻在拐角處撞上一個(gè)穿著黑色風(fēng)衣的少年。少年轉(zhuǎn)身，露出一張棱角分明的臉，右耳戴著銀色耳釘，耳釘上刻著極小的M16標(biāo)志。“小朋友，這里很危險(xiǎn)。”少年伸手想抓住柯南，卻被柯南敏捷躲過。他的袖口露出半截紋身，是條纏繞著櫻花的毒蛇。“白井姐姐？”小蘭的聲音從身后傳來，“你怎么在這里？”白井希微笑著轉(zhuǎn)身：“我是這部電影的動(dòng)作指導(dǎo)，”他舉起手中的劇本，“聽說今天有重要拍攝，過來看看。”他的目光掃過柯南，“這位是？”“我是江戶川柯南，”柯南伸出手，“是毛利姐姐的親戚。”他注意到白井希的鞋底沾著黑色粉末，和倉(cāng)庫(kù)地面的足跡吻合。平次和和葉突然沖進(jìn)倉(cāng)庫(kù)，和葉的馬尾辮上別著枚櫻花發(fā)簪：“工藤，你在哪里？”她看到尸體，臉色慘白，“平次，這是……”“哥美拉殺人事件，”平次蹲在尸體旁，“死亡時(shí)間在十五分鐘內(nèi)，兇器是特制的金屬爪子。”他抬頭看向白井希，“你來得正好，幫忙封鎖現(xiàn)場(chǎng)。”白井希點(diǎn)頭，掏出手機(jī)聯(lián)系警方。柯南注意到他發(fā)送的短信內(nèi)容：“目標(biāo)已出現(xiàn)，請(qǐng)求支援。”他悄悄打開手表麻醉槍，以防萬(wàn)一。警方到達(dá)后，白井希主動(dòng)協(xié)助調(diào)查。他從尸體旁撿起半張紙條，上面寫著“午夜零點(diǎn)，鐘樓見”。佐藤警官皺眉：“這和三年前的松尾先生死亡案的紙條一模一樣。”“松尾先生？”柯南裝傻充愣。“他是哥美拉系列的原畫師，”白井希解釋，“三年前在鐘樓自殺，留下的紙條上也寫著同樣的話。”他的目光落在倉(cāng)庫(kù)的監(jiān)控?cái)z像頭上，“不過這里的攝像頭被破壞了。”平次突然指著倉(cāng)庫(kù)角落：“看！那里有腳印！”眾人望去，潮濕的地面上有一排清晰的鞋印，鞋尖向內(nèi)，像是某種特殊的步法。“這是忍者的步法，”白井希蹲下身，“可能兇手是個(gè)受過特殊訓(xùn)練的人。”他抬頭看向柯南，“小朋友，你怎么看？”柯南推了推眼鏡：“腳印的深淺不一，說明兇手負(fù)重而行。”他注意到白井希的領(lǐng)口有血跡，“白井哥哥，你受傷了？”白井希摸了摸脖子：“剛才在走廊被鐵絲刮到了。”他的目光落在倉(cāng)庫(kù)的通風(fēng)口，“兇手可能從那里逃走了。”和葉突然抓住平次的胳膊：“平次，你看！”她指向窗外，暴雨中隱約可見一個(gè)穿著哥美拉服裝的身影閃過。平次立刻追出去，和葉緊隨其后。柯南留在現(xiàn)場(chǎng)，悄悄檢查白井希的腳印——與倉(cāng)庫(kù)內(nèi)的忍者步法完全吻合。深夜，眾人齊聚鐘樓。白井希站在陰影中，手里握著個(gè)小型探測(cè)器：“根據(jù)松尾先生的筆記，鐘樓里藏著哥美拉的秘密。”他按下探測(cè)器開關(guān)，地面突然裂開，露出一條通往地下的通道。“小心！”柯南大喊，但已經(jīng)晚了。和葉腳下一滑，掉進(jìn)通道。平次縱身一躍，抓住她的手：“笨蛋！別松手！”白井希迅速展開繩索，將兩人拉上來。和葉驚魂未定，發(fā)簪上的櫻花花瓣散落一地。柯南注意到花瓣上沾著銀色粉末，和白井希袖口的痕跡相同。通道深處傳來機(jī)械運(yùn)轉(zhuǎn)的聲音，一個(gè)巨大的齒輪緩緩轉(zhuǎn)動(dòng)，露出藏在墻壁里的保險(xiǎn)箱。白井希輸入密碼，保險(xiǎn)箱打開，里面是一卷膠片和一張泛黃的照片。“這是《哥美拉VS假面超人》的原始膠片，”白井希舉起膠片，“而這張照片……”他的聲音突然顫抖，“是松尾先生和國(guó)際走私集團(tuán)的合影。”平次接過照片，臉色大變：“照片里的人，都死了。”他指向照片邊緣，一個(gè)戴著假面超人面具的人正冷冷注視鏡頭。柯南突然意識(shí)到什么：“白井哥哥，你是M16的特工吧？”他舉起白井希的耳釘，“這個(gè)標(biāo)志和國(guó)際刑警數(shù)據(jù)庫(kù)里的M16特工徽章一模一樣。”白井希苦笑：“被你識(shí)破了，”他掏出證件，“我來這里調(diào)查文物走私案，沒想到牽扯出這么大的陰謀。”他指向膠片，“這卷膠片里藏著走私集團(tuán)的交易名單。”案件解決后，眾人回到片場(chǎng)。白井希向佐藤警官移交證據(jù)，國(guó)際刑警已將走私集團(tuán)一網(wǎng)打盡。和葉靠在平次肩上，看著朝陽(yáng)中的哥美拉模型：“平次，你說哥美拉真的存在嗎？”平次笑著揉亂她的頭發(fā)：“笨蛋，當(dāng)然不存在。”他抬頭看向白井希，“不過總有些秘密，是科學(xué)無(wú)法解釋的。”柯南注意到白井希的風(fēng)衣下露出半截劍柄，那是把日本刀。白井希察覺到他的目光，輕輕搖頭：“有些真相，還是永遠(yuǎn)埋藏比較好。”小蘭突然指著天空：“看！彩虹！”雨后的天空架起一座七彩拱橋，哥美拉模型在陽(yáng)光下泛著柔和的光。白井希悄悄將櫻花發(fā)簪塞進(jìn)和葉的口袋，轉(zhuǎn)身走向陰影。柯南看著他的背影，注意到他走路時(shí)微微跛腳——那是三年前追捕走私犯時(shí)留下的傷。這個(gè)總藏著秘密的特工，在解開血案的同時(shí)，又留下了新的謎團(tuán)。“柯南，”小蘭笑著招手，“該回去了。”柯南點(diǎn)頭，最后看了眼白井希消失的方向。他知道，屬于他們的故事還在繼續(xù)，而白井希的身影，將永遠(yuǎn)是哥美拉陰影下最神秘的謎題。