華妃復位后，皇帝雖對其恩寵有加，但華妃內心卻隱約感到不安。皇帝對華妃身邊的宮女頌芝頗有好感，華妃敢怒不敢言。皇帝在大殿聽取大臣們歷數年羹堯的不是，華妃聞訊焦急，擔心年氏家族地位不保，無奈之下只得引薦頌芝，將其拱手獻給皇帝解圍。

頌芝得到皇帝寵幸，獲晉為“芝答應”。華妃為長遠打算，強忍心中怒火，小心看著皇帝臉色行事。華妃耳聞皇帝召見大臣議事，唯恐與哥哥年羹堯有關，便交代頌芝侍寢時試探口風，被皇帝推托。皇帝找來甄嬛共議對付年羹堯之良策。甄嬛明白皇帝用意，欲與其聯手演出好戲。

甄嬛偶遇華妃，與其在花園爭吵，眉莊和陵容也在身旁。

“華妃娘娘竟也有今日？”甄嬛諷刺道。

“也是呢，榮寵后宮的華妃娘娘竟也要靠身邊人固寵”眉莊接口道。

華妃氣急，竟伸手要打眉莊，陵容轉過身，拉住華妃的手，二人推搡著，竟不知怎么撞到了陪皇上出來的皇后，皇后痛呼一聲。

“大膽，朕平日里對你們三人寵愛有加，卻不想你們恃寵而驕，竟與華妃爭斗，更是傷到皇后”皇上怒極“你們三人去蓬萊洲反省吧，待沈氏生下孩子再做打算”

“皇上”陵容祥做凄慘喊叫“您當真不顧念我們的舊情了嗎？”

“蘇培盛，送她們去蓬萊洲”皇上不想看到陵容夸張的樣子。

皇后心里總覺得事情不對，可偏偏又無機可施，只能回宮自己琢磨。

皇帝差遣果郡王協助自己查明敦親王與年羹堯謀反篡位的證據，一舉拿下敦親王等叛黨，將敦親王福晉及其子女接到宮中幽禁。

事成之后，皇上親自接待甄嬛，而陵容則陪著眉莊回了永壽宮，眉莊封嬪后的居所。

“眉姐姐如今已經有七個多月了，皇上也該是讓沈夫人進宮了吧？”陵容看著眉莊的肚子，有些擔憂“眉姐姐懷的可是雙胎，怕是不好生產了”

“無事，有你和嬛兒在，我很放心”眉莊笑著“過幾日母親就進宮了，有母親盯著，不會出事的”

得知甄嬛被皇上看重，皇后心里危機重重，又不得不賢惠的對待甄嬛，心里難受極了。

年羹堯獲知同黨敦親王被皇帝捉拿，寫了一紙奏折呈送皇帝，情急之下把“朝乾夕惕”四字寫成了“夕陽朝乾”，皇帝看后大怒。

皇帝不斷讓身邊大臣向自己列舉年羹堯的各項罪名，意在借助他人之口，徹底鏟除年氏一族。年羹堯最后因不恪守為臣之道等罪名被皇帝革了川陜總督和一等公爵位。華妃得知此消息大為震驚，不顧宮規前往養心殿替哥哥求情；皇帝避而不見，華妃磕頭請求皇帝的原諒。眼見華妃失勢，曹貴人不得不另尋靠山。皇后面前，曹貴人告發華妃此前種種罪行。

皇后命人徹查華妃多年惡行，眾叛親離的華妃得知兄長年羹堯已被賜死，親信太監周寧海不堪大刑之苦，供認出自己多項罪名。皇帝大怒，降華妃為年答應。曹貴人因告發華妃罪行有功，被晉封為襄嬪。

端妃告知甄嬛后宮如政局，不可憑一己之力改變；另外還需特別防范襄嬪，也就是從前的曹貴人。

秀女大選的年份已到，未免宮中紛擾，皇帝提議推遲選秀；皇后建議不必大肆選秀，只在功臣家眷中選取四名適齡女子入宮即可，皇帝欣然接受。

新進宮的祺貴人之父與甄嬛父親同在都察院為官，祺貴人便要求與甄嬛同住，借以博得了皇帝的關注。祺貴人在宮中與華妃狹路相逢并受了氣，三番五次地向皇帝挑唆。

而此時，眉莊也快要生產了，因著懷了雙胎，眉莊早產了，而甄嬛發現自己宮外屢屢受到華妃宮中內監肅喜的窺探，命小允子扣押肅喜，眉莊經歷兩個時辰，生下一對龍鳳胎，皇上和太后很是高興，特地冊封眉莊為貴妃，全家抬旗，沈夫人喜不自勝，回家對著沈大人好是一番夸耀。

而陵容和甄嬛則帶肅喜去見了皇上皇后，原來肅喜竟帶著火折子和易燃的油，皇帝大怒，命慎刑司嚴刑拷打，肅喜受不住刑罰，招認了，原來是華妃不甘心，遂派肅喜在眉莊生產之日點燃永壽宮，想讓眉莊和孩子葬身火海。

皇帝最終下旨賜死華妃，華妃卻不愿就死。甄嬛來到冷宮，替華妃送行。她親口告訴華妃，皇帝和太后當年為了防備年氏一族勢力過強，便在華妃專用的歡宜香中添加了大量麝香，致使其終身不孕，并導致甄嬛昔日流產的事實。華妃聽聞真相后，絕望中撞墻而死。皇帝為示自己對華妃的厚愛，許她以貴妃名位入葬。

襄嬪得風寒無人照看，太醫院奉太后密旨在其藥物中下了失神之藥，致其噩夢連連，不斷夢見華妃來冤魂索命，最終驚懼而死，端妃獲圣旨撫養溫宜公主。

皇后唆使祺貴人讓其父瓜爾佳鄂敏在前朝挑撥皇帝與甄父甄遠道之間的關系。皇帝本性多疑，在皇后的唆使下，察覺到甄嬛愛讀政要史書，內心不悅，有意疏遠。

因著甄嬛生有一子，皇上很是防范甄嬛，甄嬛終于對皇上死了心，只愿在宮中撫養孩子，不愿再承寵，皇上卻認為甄嬛是在威脅他，竟將甄嬛禁足在碎玉軒，不許任何人去看，還抱走了甄嬛所生的弘宴，交由陵容暫時撫養。

禁足于碎玉軒的甄嬛傷心欲絕，而此時的碎玉軒猶如冷宮一般。眾人備受欺凌，甄嬛因病重暈倒。流朱為替甄嬛求醫，強闖碎玉軒大門，卻遭到侍衛阻攔；流朱救主心切，絕望之下撲向侍衛手中的刀刃，血流不止，侍衛不得已向皇帝報告實情。皇帝聞訊震怒，斥責侍衛失職，命溫實初速救甄嬛和流朱。

幸好溫實初醫術好，救回流朱，只是流朱經此一傷后，身體逐漸虛弱了起來，再也沒了往日的活潑模樣，甄嬛由此更是恨皇上。甄嬛醒來后意外發現自己懷孕，為保腹中胎兒平安，請求皇后照顧自己身孕，承擔一切后果。皇后不愿答應，太后告誡她不可一錯再錯，更不許她拿烏拉那拉氏家族的榮華富貴開玩笑。

大臣瓜爾佳鄂敏繼續在皇帝面前讒言、詆毀甄嬛父親甄遠道，皇帝心生戒備，最終下旨將甄遠道革職收監，其家眷圈禁府中，甄氏敗落。太后為甄嬛腹中的龍子考慮，擔心她得知家族之事身體不妥，命孫姑姑傳信安撫甄嬛。可甄嬛對皇上心死，竟無生意，陵容只得日日帶弘宴來看甄嬛，希望甄嬛可以振作起來，可是因為父親生病，甄嬛受到刺激，早產生下一個女兒，甄嬛自知若是在宮中，皇上還是會一直猜忌自己，遂情愿出宮。

甄嬛痛苦中早產下一女，取名朧月，皇帝獲知興奮不已。甄嬛內心對皇帝絕望，自請離宮到甘露寺修行以保朧月平安。甄嬛拜托敬妃收養女兒朧月，替自己撫養女兒長大成人。甄嬛毅然離宮，眉莊、陵容、溫實初為其送行。而皇上將弘宴交由陵容撫養，下旨不許任何人提及甄嬛。

甄嬛遷居甘露寺，法號莫愁，入寺后備受欺凌；皇后趁機安插祺嬪(原來的祺貴人)等人好生伺候皇帝，在宮中大肆擴張勢力。眉莊為甄嬛的離去傷心不已。溫實初因其御醫的特殊身份，獲準往來宮中及甘露寺兩地之間，暗中保護甄嬛。

皇后在宮里一家獨大，眉莊和陵容為保弘宴和弘湛安全，不得不避其鋒芒，卻不想皇后還是不肯放過。

“娘娘不好了，公主和小皇子染上了天花”箋一哭著“這下可怎么辦啊”

“什么？弘湛和靜和怎么樣，沒有染到吧？”陵容急匆匆去看孩子，也不忘關心眉莊的兩個孩子。

“慧貴妃那里一切都好”箋一道。

“箋一，你讓所有沒得過天花的人在正殿待著，文熙，李福來，你們去審，嘉卉，你跟我去照顧弘宴和如泱”陵容當機立斷道。

看著兩個孩子的樣子，陵容心都要碎了，雖然本就準備給兩個孩子種痘，但這種被人算計的滋味并不好。“嘉卉，可以動手了”

陵容只一心在宮里照顧孩子，而皇后卻得了天花，皇后年紀也不小了，一下子得了天花，來勢洶洶，皇上沒有辦法，太醫院眾人也只能盡力醫治，皇后宮里的人都憂心忡忡，只有剪秋一直陪著皇后，半月過去了，陵容的兩個孩子已經好了，而皇后不治身亡了。

太后一下子就病倒了，自己家族已經沒有可以勝任皇后的人了，如今到底還是她錯了，只是，她們烏拉那拉氏的榮耀終究是結束了。

果郡王獲知甄嬛出宮修行，趕來甘露寺探訪，為甄嬛帶來女兒朧月的畫像，安慰甄嬛思女之情，甄嬛感激。

中宮無主，皇上只得封眉莊為皇貴妃，統領六宮事宜，因著眉莊還有孩子要照顧，遂讓端妃敬妃協助。