- 生物化學(xué)
- 梁金環(huán) 徐坤山 王曉凌主編
- 2430字
- 2020-04-30 19:05:40
第一節(jié) 概 述
一、酶與生物催化劑
新陳代謝是生物體維持生命活動(dòng)的基礎(chǔ),構(gòu)成新陳代謝的許多復(fù)雜而規(guī)律的化學(xué)反應(yīng)和能量變化,都是在生物催化劑的作用下完成的。生物體內(nèi)的各種化學(xué)反應(yīng)能在溫和的條件下高效、特異、有條不紊地進(jìn)行,就是因?yàn)轶w內(nèi)存在著極為重要的生物催化劑——酶(enzyme)。酶是由活細(xì)胞產(chǎn)生的、對(duì)其底物具有高度特異性和高效催化作用的蛋白質(zhì)。由酶催化進(jìn)行的化學(xué)反應(yīng)稱為酶促反應(yīng)(enzymatic reaction),酶促反應(yīng)的反應(yīng)物又稱為底物(substrate),反應(yīng)后生成的物質(zhì)稱為產(chǎn)物(product)。
在20世紀(jì)80年代初,人們又發(fā)現(xiàn)了具有催化功能的RNA——核酶(ribozyme),打破了酶是蛋白質(zhì)的傳統(tǒng)認(rèn)識(shí),是對(duì)酶概念的補(bǔ)充。本章主要討論本質(zhì)為蛋白質(zhì)的酶。
★ 考點(diǎn)提示:酶的概念及化學(xué)本質(zhì)
知識(shí)鏈接
酶學(xué)簡(jiǎn)史
人們利用發(fā)酵的原理制作豆醬、釀酒、制醋等已有幾千年的歷史,酶學(xué)知識(shí)得益于發(fā)酵,Enzyme的詞根zyme就是希臘文中“發(fā)酵”或“酵母”的意思。1926年Sumner首次從刀豆中獲得脲酶結(jié)晶并證明是蛋白質(zhì),以后又有數(shù)千種酶被證明是蛋白質(zhì)。1981年,T.R.Cech在研究四膜蟲的26S rRNA前體在成熟過程中,即使不添加蛋白提取液,該rRNA前體也能變成成熟的RNA。其內(nèi)含子通過剪接反應(yīng)而被除去,此剪接反應(yīng)是一種RNA的自我剪接作用,說明RNA具有催化作用,這種具有催化作用的RNA稱為核酶。
核酶的發(fā)現(xiàn),開辟了生物化學(xué)研究的新領(lǐng)域,提出了生命起源的新概念,并設(shè)計(jì)出多種人工核酶,為研究防治抗病毒、抗腫瘤的藥物及臨床的基因治療提供了一種手段,有廣泛的應(yīng)用前景。
二、酶促反應(yīng)的特點(diǎn)
酶是一類生物催化劑,具有一般催化劑的共性:酶在反應(yīng)前后沒有質(zhì)和量的變化且只能催化熱力學(xué)允許的化學(xué)反應(yīng);只能加速可逆化學(xué)反應(yīng)的進(jìn)程而不改變反應(yīng)的平衡點(diǎn)和平衡常數(shù);催化反應(yīng)的機(jī)制是降低反應(yīng)的活化能等。由于酶的化學(xué)本質(zhì)是蛋白質(zhì),所以酶所催化的反應(yīng)具有不同于一般催化劑的特點(diǎn)。
(一)酶具有極高的催化效率
酶對(duì)底物具有極高的催化效率,通常比非催化反應(yīng)高108~1020倍,比一般催化劑催化的反應(yīng)高107~1013倍。例如,脲酶催化尿素水解的速率是H+催化作用的7×1012倍;α-胰凝乳蛋白酶催化苯酰胺水解的速率是H+催化作用的6×106倍,而且不需要較高的反應(yīng)溫度。
(二)酶具有高度的特異性
酶對(duì)其所催化的底物和反應(yīng)具有嚴(yán)格的選擇性,表現(xiàn)為一種酶僅作用于一種或一類化合物,或作用于一定的化學(xué)鍵,催化一定的化學(xué)反應(yīng)并生成一定的產(chǎn)物。酶的這種特性稱為酶的特異性或?qū)R恍裕╯pecificity)。例如,H+可以催化淀粉、蛋白質(zhì)和脂肪的水解反應(yīng),而淀粉酶卻只能催化淀粉糖苷鍵的水解,蛋白酶只能催化蛋白質(zhì)肽鍵的水解,脂肪酶只能催化脂肪酯鍵的水解。根據(jù)酶對(duì)其底物分子選擇的嚴(yán)格程度不同,酶的特異性可分為絕對(duì)特異性、相對(duì)特異性、立體異構(gòu)特異性三種類型。
1.絕對(duì)特異性
絕對(duì)特異性是指一種酶只作用于特定結(jié)構(gòu)的底物,進(jìn)行一種專一的反應(yīng),生成一種特定結(jié)構(gòu)的產(chǎn)物。例如,脲酶只催化尿素水解生成氨和二氧化碳,對(duì)甲基尿素則不起作用;琥珀酸脫氫酶只催化琥珀酸與延胡索酸之間的氧化還原反應(yīng)。
2.相對(duì)特異性
有些酶對(duì)底物的選擇依據(jù)底物分子中特定的化學(xué)鍵或特定的基團(tuán),因此這類酶對(duì)底物的選擇不太嚴(yán)格,可以作用于含有相同化學(xué)鍵或化學(xué)基團(tuán)的一類化合物,稱為相對(duì)特異性。
3.立體異構(gòu)特異性
有些具有絕對(duì)專一性的酶,對(duì)底物的立體異構(gòu)具有嚴(yán)格的選擇性,即一種酶僅作用于底物的立體異構(gòu)體中的一種類型,稱為立體異構(gòu)特異性。如L-乳酸脫氫酶只作用于L-乳酸,對(duì)D-乳酸沒有作用。
(三)酶促反應(yīng)的可調(diào)節(jié)性
體內(nèi)的酶促反應(yīng)受多種因素的調(diào)節(jié),主要通過對(duì)酶的含量和酶的活性調(diào)節(jié)使代謝過程受到精確的調(diào)控,以此適應(yīng)機(jī)體對(duì)不斷變化的內(nèi)外環(huán)境和生命活動(dòng)的需要。
(四)酶具有不穩(wěn)定性
酶的化學(xué)本質(zhì)是蛋白質(zhì),任何使蛋白質(zhì)變性的理化因素都可以使酶發(fā)生變性而失去催化活性,因此酶促反應(yīng)往往在比較溫和的條件下進(jìn)行。
★ 考點(diǎn)提示:酶促反應(yīng)的特點(diǎn)
三、酶的分類和命名
(一)酶的分類
根據(jù)酶催化反應(yīng)的性質(zhì),將酶分為六大類。
1.氧化還原酶類
催化底物進(jìn)行氧化還原反應(yīng)的酶屬于氧化還原酶類,包括催化傳遞電子、氫及需氧參加反應(yīng)的酶。例如乳酸脫氫酶、細(xì)胞色素氧化酶等。
2.轉(zhuǎn)移酶類
催化底物之間進(jìn)行某些基團(tuán)的轉(zhuǎn)移或交換的酶屬于轉(zhuǎn)移酶類,例如氨基轉(zhuǎn)移酶、甲基轉(zhuǎn)移酶、己糖激酶、磷酸化酶等。
3.水解酶類
催化底物發(fā)生水解反應(yīng)的酶屬于水解酶類,如蛋白酶、脂肪酶、核酸酶等。
4.裂合酶類
催化從底物移去一個(gè)基團(tuán)而形成雙鍵的反應(yīng)或其逆反應(yīng)的酶屬于裂合酶類,例如脫水酶、脫羧酶、水化酶、醛縮酶等。
5.異構(gòu)酶類
催化分子內(nèi)部基團(tuán)位置互變,即各種同分異構(gòu)體間相互轉(zhuǎn)變及醛酮互變的酶屬于異構(gòu)酶類。如磷酸丙糖異構(gòu)酶、磷酸己糖異構(gòu)酶等。
6.合成酶類
催化兩種底物分子合成一種產(chǎn)物并同時(shí)耦聯(lián)有高能鍵水解和釋放能量的酶屬于合成酶類或稱連接酶類。如谷氨酰胺合成酶、DNA連接酶、氨基酰-tRNA合成酶等。
(二)酶的命名
1.酶的習(xí)慣命名
早期酶的命名多根據(jù)酶所催化的底物、反應(yīng)的性質(zhì)以及酶的來源來確定,如催化淀粉水解的酶稱為淀粉酶,催化蛋白質(zhì)水解的酶稱為蛋白酶;有些酶依據(jù)其所催化反應(yīng)的類型或方式命名,如琥珀酸脫氫酶、天冬氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶;有時(shí)還加上酶的來源或酶的其他特點(diǎn),如唾液淀粉酶和胰淀粉酶、堿性磷酸酶和酸性磷酸酶等。習(xí)慣命名法有時(shí)不能完全說明酶促反應(yīng)的本質(zhì),甚至出現(xiàn)一酶多名或多酶一名的混亂情況。
2.酶的系統(tǒng)命名
為了克服習(xí)慣命名法的弊端,國(guó)際生物化學(xué)與分子生物學(xué)學(xué)會(huì)(IUBMB)以酶的分類為依據(jù),于1961年提出系統(tǒng)命名法。系統(tǒng)命名法規(guī)定:每一個(gè)酶都有一個(gè)系統(tǒng)名稱,它標(biāo)明酶的所有底物和反應(yīng)性質(zhì)。底物名稱之間以“:”分隔。每種酶都有一個(gè)特定的編號(hào),編號(hào)由四位數(shù)字組成,數(shù)字間由“.”隔開。編號(hào)之前冠以酶學(xué)委員會(huì)(Enzyme Commision)的縮寫“EC”。但由于許多酶促反應(yīng)是雙底物甚至是多底物參加的反應(yīng),且許多底物的化學(xué)名稱很長(zhǎng),使得許多酶的系統(tǒng)名稱過長(zhǎng)或過于復(fù)雜,為了應(yīng)用方便,國(guó)際酶學(xué)委員會(huì)又從每種酶的習(xí)慣名稱中選定一個(gè)簡(jiǎn)便實(shí)用的推薦名稱。一些酶的系統(tǒng)名稱及推薦名稱見表4-1。
表4-1 酶的分類與命名舉例

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