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第三節(jié) 核酸的理化性質(zhì)

一、核酸的一般性質(zhì)

核酸是極性化合物,微溶于水,不溶于乙醇、乙醚、三氯甲烷等有機(jī)溶劑。核酸分子中含有堿性的堿基和酸性的磷酸基,因此核酸是兩性電解質(zhì),但具有較強(qiáng)的酸性。磷酸殘基可解離成多陰離子狀態(tài),多陰離子狀態(tài)的核酸可與金屬離子或堿性蛋白結(jié)合成鹽,核酸鹽的溶解度比游離酸的溶解度大得多。DNA和RNA均為線性大分子,有極高的黏度,RNA分子遠(yuǎn)小于DNA,因而RNA的黏度也比DNA小得多。

二、核酸的紫外吸收性質(zhì)

由于嘌呤及嘧啶雜環(huán)上有共軛雙鍵,使核酸在250~280nm紫外波段具有強(qiáng)烈的吸收,最大吸收峰在260nm處。利用這一特性,可以對(duì)核酸進(jìn)行定量測(cè)定。

三、DNA的變性、復(fù)性與雜交

(一)DNA變性

DNA變性(DNA denaturation)是指在某些理化因素的作用下,DNA分子互補(bǔ)堿基對(duì)之間的氫鍵斷裂,雙鏈解離為單鏈的過程。這一過程不伴有共價(jià)鍵的斷裂,核酸的一級(jí)結(jié)構(gòu)沒有破壞。引起DNA變性的因素很多,如加熱、有機(jī)溶劑、酸、堿、尿素等。

核酸在變性時(shí),由于堿基更多的暴露,260nm的光密度值顯著升高,此現(xiàn)象稱為增色效應(yīng)。

雙鏈DNA熱變性是在很窄的溫度范圍內(nèi)發(fā)生的,呈爆發(fā)式。通常將DNA分子解鏈達(dá)50%時(shí)的溫度稱為“熔點(diǎn)”或解鏈溫度,用Tm表示。DNA的Tm通常在82~95℃。常用260nm的紫外吸收值的變化監(jiān)測(cè)不同溫度下DNA的變性情況,所得的曲線稱為解鏈曲線(圖3-11)。

圖3-11 DNA解鏈曲線

DNA的Tm值主要受DNA的長(zhǎng)度和GC含量的影響:分子越大,Tm值越高;GC含量越高,Tm值越高。

(二)DNA復(fù)性

核酸的變性在一定條件下是可逆的。去除變性因素,解開的互補(bǔ)單鏈恢復(fù)到天然雙螺旋結(jié)構(gòu)的現(xiàn)象稱為復(fù)性(renaturation)。熱變性DNA一般經(jīng)緩慢冷卻后即可復(fù)性,此過程被稱為退火(annexing)。若熱變性后的DNA,溫度突然急劇下降到4℃以下,則不發(fā)生復(fù)性。可利用這一性質(zhì)保存變性后的DNA。伴隨著DNA復(fù)性,其紫外吸收值降低,黏度增加,同時(shí)恢復(fù)生物活性。

(三)核酸雜交

若將不同來源的DNA單鏈或RNA單鏈放在同一溶液中進(jìn)行復(fù)性,只要不同單鏈間存在著一定程度的堿基配對(duì)關(guān)系,就可以形成雜化的雙鏈。這種雜化雙鏈可以在不同來源的DNA單鏈間形成,也可以在RNA單鏈間形成,甚至可以在DNA單鏈和RNA單鏈之間形成,這種現(xiàn)象稱為核酸雜交(hybridization)(圖3-12)。

圖3-12 核酸分子雜交原理示意圖

核酸雜交作為一項(xiàng)常規(guī)實(shí)驗(yàn)技術(shù),廣泛應(yīng)用于生物化學(xué)、分子生物學(xué)和醫(yī)學(xué)相關(guān)領(lǐng)域,用于遺傳病的基因診斷、傳染病病原體的檢測(cè)和惡性腫瘤的基因分析等。

考點(diǎn)提示:DNA變性、復(fù)性及雜交;核酸的紫外吸收性質(zhì)

知識(shí)鏈接

核酸雜交的應(yīng)用——印跡技術(shù)

最常用的是以硝酸纖維素膜作為載體進(jìn)行雜交。英國(guó)分子生物學(xué)家E.M.Southern創(chuàng)立的Southern印跡法(Southern blotting)就是將凝膠電泳分離的DNA片段轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜上后,再進(jìn)行雜交。其操作基本過程是:DNA樣品酶切降解,瓊脂糖凝膠電泳分離DNA片段,于NaOH中變性,轉(zhuǎn)膜,再與標(biāo)記的探針雜交,放射自顯影,即可鑒定待分析的DNA片段。

將RNA經(jīng)電泳變性后轉(zhuǎn)移至纖維素膜上再進(jìn)行雜交的方法,稱Northern印跡法(Northern blotting)。根據(jù)抗體與抗原可以結(jié)合的原理,用類似方法也可以分析蛋白質(zhì),這種方法稱Western印跡法(Western blotting)。

雜交技術(shù)可對(duì)含量極少的目的基因或蛋白進(jìn)行分析,是研究核酸、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的一個(gè)極其有用的工具。

思考題

一、名詞解釋

1. DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)

2. DNA變性

3.核酸雜交

二、填空題

1.DNA水解后可得________、________、________。

2.核苷酸鏈中核苷酸的連接方式是________。

3.核酸的主要組成元素有______、________、________、________、________等;DNA的基本組成單位是__________、__________、__________和__________;RNA的基本組成單位是__________、__________、__________和__________。

4.真核生物成熟mRNA的5′-末端有__________,3′-末端有__________。

5.真核生物有__________、__________、__________和__________4種rRNA參與構(gòu)成核糖體。

三、簡(jiǎn)答題

1.DNA分子二級(jí)結(jié)構(gòu)有哪些特點(diǎn)?

2.簡(jiǎn)要說明tRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)的特點(diǎn)及其功能。

(袁海建)

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