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3.2 結果

建立在優化ISSR擴增體系的基礎上,選取100條ISSR引物進行初篩和復篩,最終篩選出12條多態性較好的引物,用于擴增反應。引物由上海生物工程公司合成,引物的堿基序列見表3-2。

表3-2 用于ISSR擴增的引物及引物擴增的條帶數

1. ISSR-PCR(內部簡單重復序列間擴增)反應體系成分組成:DNA模板2μL; MgCl2 1.2μL; dNTPs 2μL;引物0.6μL; Ta q聚合酶0.2μL; PCR 10×緩沖液2μL;加入ddH2O 12μL; PCR反應的總體積為20μL。

2. PCR熱循環儀L9600。

3.熱循環儀的溫度:起始變性步驟的溫度為94℃,維持時間為5min;循環變性步驟的溫度為94℃,維持時間為60s;循環退火步驟的溫度為54℃,維持時間為45s;退火與延伸步驟之間的變溫速率為1℃/s;循環延伸步驟的溫度為72℃,維持時間為2min;循環周期總數為45個循環;最后延伸步驟的溫度為72℃,維持時間為7min。

4. ISSR-PCR片段的分析:瓊脂糖凝膠電泳;電泳緩沖液為0.5×TBE(三羥甲基氨基甲烷+硼酸+乙二胺四乙酸);所用膠濃度為1.5%;電泳條件為電流50mA、電壓130V、泳動時間3h;染料為溴化乙啶(EB),終濃度0.5μg/mL; DNA標記物為100bp DNA plus ladder(MBI公司)[1]

對100條ISSR引物進行多態性篩選,從中選出擴增效果好、條帶清晰、多態性及重復性好的12條引物,對19個竹種的DNA樣品進行PCR擴增,擴增結果如圖3-1所示。根據表3-2,12條引物共擴增出188個位點,平均每個引物擴增出15.7個,擴增片段多集中在300~5000bp。這說明19個竹種擴增位點較為豐富,多態性顯著,具有豐富的遺傳多樣性,種間差異比較明顯,表明ISSR標記能夠有效地揭示材料間的多態性。

圖3-1 ISSR-02引物對19個竹種ISSR擴增的電泳結果

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