四大刑衙是白圭為了改革司法、清除異己的聯合機關。

一為三法司，指原刑部、都察院、大理寺，負責處理一般性、通常性的案件。大部分時間，一般只有三法司處理案件。

二為錦衣衛。錦衣衛在改革后，正式成為大明特工，對于大型案件、特殊案件有權介入偵查甚至全盤接手。而在行動方面，錦衣衛的裝備則全面向兵部靠攏，甚至有不少機甲裝備。

三為國子監刑學堂，對于疑難案件以及危險度高的案件，刑學堂可提供輔助作用。必要時，刑學堂可以辦案。

四為明鏡閣，這是白圭成立的情報機構，收錄除了皇史宬外的一切情報資料。