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第二章 生物科技實驗

實驗一 CTAB法提取植物DNA

實驗?zāi)康?/span>

(1)掌握CTAB法提取植物DNA的原理和方法。

(2)采用CTAB法從植物葉片中提取DNA。

實驗原理

CTAB(hexadecyltrimethylammonium bromid,十六烷基三甲基溴化銨)法是提取植物DNA的經(jīng)典方法。CTAB是一種陽離子去污劑,可以溶解細(xì)胞膜,將膜內(nèi)核蛋白釋放;同時,CTAB具有從低離子強度溶液中沉淀核酸與酸性多聚糖的特性。在高離子強度的溶液中(>0.7mol/L NaCl),CTAB與蛋白質(zhì)和多聚糖形成復(fù)合物,只是不能沉淀核酸。通過有機溶劑抽提,去除蛋白、多糖、酚類等雜質(zhì)后加入乙醇沉淀即可使核酸分離出來。

在DNA提取、制備的過程中,核酸極不穩(wěn)定,許多因素可破壞其完整結(jié)構(gòu):①化學(xué)因素,核酸的結(jié)構(gòu)在pH值4.0~11.0間較穩(wěn)定,pH值在此范圍外就會使核酸變性降解,故制備過程應(yīng)避免過酸、過堿。②物理因素,DNA分子鏈很長,是雙螺旋結(jié)構(gòu),既有一定的柔性又有一定的剛性,故強機械作用如劇烈攪拌會令DNA分子斷裂,不利于收集,應(yīng)加以避免。③酶的作用,細(xì)胞中普遍存在的核酸酶在細(xì)胞壁或膜遭到破壞時被釋放出來,它會降解DNA分子。故須用酶的變性劑、抑制劑使之失活。操作過程最好在低溫(0℃左右)下進行。常用的酶抑制劑有檸檬酸鹽、氟化物、砷酸鹽、乙二胺四乙酸鈉鹽(ETDA-Na2)等。SDS和苯酚作為蛋白變性劑,同時可使核酸酶被破壞而失活。

注:CTAB溶液在低于15℃時會形成沉淀析出,因此,在將其加入冰冷的植物材料之前必須預(yù)熱,且離心時溫度不要低于15℃。

試劑與儀器

1.試劑與溶液

(1)2×CTAB提取緩沖液

2×CTAB提取緩沖液中各試劑的作用如下。

①Tris-HCl(pH8.0)提供一個緩沖環(huán)境,防止核酸被破壞。

②EDTA可以螯合Mg2+或Mn2+,抑制DNase活性。

③NaCl提供一個高鹽環(huán)境,使DNA核蛋白充分溶解。

④CTAB溶解細(xì)胞膜,并結(jié)合核酸,使核酸便于分離。

β-巰基乙醇是抗氧化劑,有效地防止酚氧化成醌,避免褐變,使酚容易去除。

(2)TE緩沖液 10mmol/L Tris-HCl(pH 7.4),1mmol/L EDTA,高壓滅菌,室溫保存。

(3)氯仿-異戊醇(24:1)。

(4)液氮。

(5)70%乙醇和無水乙醇、雙蒸水。

2.儀器設(shè)備

研缽、恒溫水浴鍋、冷凍離心機、移液器、移液管、1.5mL離心管、冰箱、培養(yǎng)箱。

實驗步驟

(1)取兩片幼嫩新鮮葉片,70%乙醇清洗,雙蒸水沖洗干凈后,置于預(yù)冷的研缽中,倒入適量液氮,迅速研磨成粉末狀,隨后加入3mL預(yù)熱的含有β-巰基乙醇的2×CTAB提取緩沖液,繼續(xù)研磨成略有流動性的糊狀或粥狀,轉(zhuǎn)入1.5mL的離心管中,于65℃水浴鍋中保溫約60min(期間定時上下翻轉(zhuǎn)5~10次)。

(2)待混合物冷卻至室溫后加入等600μL的氯仿-異戊醇溶液混勻,輕輕顛倒離心管幾次,使管內(nèi)混合物成乳濁液,常溫下10000r/min離心10min,取上清液轉(zhuǎn)入另一干凈的離心管中。

(3)重復(fù)步驟(2)一次。

(4)取步驟(3)上清液加入2.5倍體積無水乙醇,仔細(xì)混勻,-20℃冰箱30min以上,沉淀DNA 4℃ 12000r/min離心10min。

(5)棄去上層有機溶劑,加500μL 70%乙醇洗滌沉淀,4℃ 8000r/min離心5min,棄去上清液,洗滌沉淀3次。

(6)倒置或者37℃培養(yǎng)箱烘干。

(7)加50μL TE緩沖液溶解DNA,于-20℃冷藏備用。

思考題

在DNA提取過程中為什么動作要輕柔?

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