1576年時(shí)織田水軍在進(jìn)攻石山本愿寺的時(shí)候，遭遇毛利、村上水軍不敵大敗，史稱“第一次木津川之戰(zhàn)”。兩年后的1578年6月26日，織田信長命九鬼嘉隆、瀧川一益秘密建造的新武器——“鐵甲船”的第一批6艘全部完工。信長下令九鬼嘉隆、瀧川一益將船隊(duì)駛?cè)氪筵酁常瑴?zhǔn)備在堺港檢閱。于是，瀧川一益乘坐一艘大安宅船，九鬼嘉隆率領(lǐng)六艘鐵甲船，共7只船從熊野海岸出發(fā)，直奔大坂。途中，遇到雜賀水軍阻擊，九鬼嘉隆下令一齊炮擊，雜賀水軍瞬間全滅。船隊(duì)于7月17日在堺港靠岸。

1578年9月30日，信長親自到達(dá)堺港率領(lǐng)眾家臣檢閱船隊(duì)。鐵甲船長22米，寬12米，船體全身用堅(jiān)固的木材組成，再覆蓋上鐵板作為裝甲，不僅焙烙火矢無效，就連大炮都很難造成致命的傷害。武器方面，每艘鐵甲船上都裝備有3門弗朗機(jī)炮，都是信長花重金經(jīng)由葡萄牙傳教士購入的。同時(shí)還有大量的鐵炮。一同參加檢閱的葡萄牙傳教士稱贊道：“這是日本最大、最華麗的船！”，信長大喜，賞賜給九鬼嘉隆二十枚黃金，以及九名美女。

這時(shí)身處石山本愿寺城中的本愿寺顯如上人可睡不好覺了，天天早上開窗戶都能望見這7艘大船雄踞大坂灣內(nèi)，急忙派人向毛利求救。1578年11月6日上午8時(shí)，村上武吉率領(lǐng)的600艘戰(zhàn)船在木津川附近現(xiàn)身，九鬼嘉隆率鐵甲船迎擊。毛利水軍采取各個(gè)包圍的戰(zhàn)術(shù)，但焙烙火矢的攻擊完全無效。織田水軍則采取長驅(qū)直入、直搗黃龍的戰(zhàn)術(shù)，利用大炮和鐵炮齊射集中攻擊敵軍指揮船。毛利水軍雖多，但攻擊難以奏效，根本擋不住鐵甲船的攻勢。再加上鐵甲船船大炮猛，毛利水軍無法阻止其行動，完全陷入了被蹂躪的狀態(tài)。正午時(shí)分，村上武吉的旗艦被擊沉，村上武吉棄船逃走，下令撤退，毛利水軍四散奔逃，潰不成軍。九鬼嘉隆下令追擊，將毛利水軍徹底趕出了大坂灣近海區(qū)域。信長得知消息后，將攝津國部分領(lǐng)地加封給了九鬼嘉隆，其所領(lǐng)已達(dá)3萬5000石，正式成為了“海賊大名”，并讓鐵甲船長期停靠在堺港以防毛利。要說當(dāng)時(shí)鐵甲船有什么弱點(diǎn)的話，那就是不能遠(yuǎn)航了，負(fù)責(zé)近海防御戳戳有余。

海戰(zhàn)剛一獲勝，信長就迅速集結(jié)了5萬兵力駐扎在山城國和攝津國的邊境，準(zhǔn)備討伐反叛的荒木村重。1578年11月10日，滝川一益、明智光秀、蜂屋頼隆、氏家直昌、安藤守就合攻中川清秀的茨木城。中川清秀出戰(zhàn)，被打得落花流水只得回城堅(jiān)守。11月16日，高槻城城主高山右近求見信長。信長對右近頗為欣賞，因?yàn)槠涫切欧钐熘鹘痰南融叄?jīng)常聽傳教士們贊揚(yáng)他。“右近，你隨荒木村重造反，還有臉來見我？！”信長拉下了臉。“大人，我與中川清秀并非愿隨其造反，實(shí)在是因?yàn)橛腥速|(zhì)在荒木村重的手上，不得已而為之。如今天兵已到，我等愿追隨信長大人，共討逆賊。”“這么說，你能說服中川清秀來降？只要大人能饒其性命，我敢保證。”“好。”不久，高山右近說服茨木城的中川清秀歸降，織田大軍隨即席卷攝津國內(nèi)。最后，只剩荒木村重的有岡城、其子荒木村次鎮(zhèn)守的尼崎城和荒木元清鎮(zhèn)守的花隈城。11月14日老將稻葉一鐵、羽柴秀吉、細(xì)川藤孝與荒木軍在有岡城外激戰(zhàn)，荒木軍不敵退回城中。有岡城十分巨大，東西400米，南北600米，不亞于當(dāng)年的稻葉山城。信長派瀧川一益、丹羽長秀作為別動隊(duì)于12月4日出發(fā)繞到城北進(jìn)攻，自己率大軍從南面進(jìn)攻。12月8日晚上6點(diǎn)，攻城戰(zhàn)正式開始，織田軍以鐵炮和弓箭發(fā)動攻勢，但有岡城的土壘石垣異常堅(jiān)固，難以攻破。直到12月9日上午10點(diǎn)，織田軍死傷2000余人，萬見重元戰(zhàn)死。信長為避免更大的損失，下令收兵。12月15日，信長見有岡城急不可下，命織田信忠堅(jiān)守陣地，包圍有岡城，自己則返回了安土城。

1578年末，波多野家名將有“丹波赤鬼”之稱的赤井直正病逝，信長下令明智光秀、細(xì)川藤孝再攻八上城。1579年2月6日，三木城的別所吉親率3000士兵夜襲羽柴秀吉在平井山的陣地失敗，隨同夜襲的別所長治的弟弟別所治定死亡，年僅19歲。別所吉親大敗而回。1579年5月，羽柴秀吉攻取丹生山明要寺和淡河城，三木城再次被完全包圍。此時(shí)，在丹波國的八上城，明智光秀已圍城2個(gè)多月了，波多野秀治、秀尚兄弟都已無心再戰(zhàn)，本欲開城投降，但又恐信長殘暴，投降也是一死，找來大將荒木氏綱商量。“我與明智光秀交戰(zhàn)多次，其人深明禮教法度，斷然不會出爾反爾，我來守城。主公可放心。”“也只有如此了。”1579年6月2日，波多野秀治、秀尚兄弟隨光秀來到安土城拜見信長。“主公，我以所領(lǐng)安堵的條件終于讓丹波國的波多野秀治、秀尚兄弟降服，占領(lǐng)了八上城。”明智光秀得意滿滿的說道。沒想到信長大怒，拿起身旁森蘭丸的鐵扇，朝著光秀的禿頭就扔了過去，“混賬東西！我何時(shí)說要答應(yīng)他們所領(lǐng)安堵了。波多野兄弟曾經(jīng)背叛了我，并多次出兵阻擾我進(jìn)攻本愿寺，罪惡滔天，來人給我活剮了！”“主公！您只要求在下攻略丹波國，沒說非要滅其一族啊。如此，恐阻天下來降者之心啊！”光秀忍住疼痛，抱著信長的大腿說道。“放手！”信長一腳把光秀踢開，“什么人能招，什么人不能招，你不知道啊！？給我滾回八上城去。”光秀碰了一鼻子灰，只能馬上告退。而波多野兄弟同日于安土城的凈嚴(yán)院慈恩寺被處以磔刑。

1579年6月13日，天才軍師竹中半兵衛(wèi)，因肺病于包圍三木城的平井山大營中去世，享年36歲。臨終前曾對羽柴秀吉說道：“羽柴大人，感謝您的三顧之恩，看來我見不到您所期望的再無戰(zhàn)事、充滿和平的天下了。我死之后，黑田官兵衛(wèi)可繼我位，一定要把他從有岡城救出來。毛利軍與我軍在三木城糾纏，無力去救有岡城，日久必破。三木城，若毛利軍與別所軍里應(yīng)外合想要運(yùn)糧，可對毛利堅(jiān)守，對別所出擊，其計(jì)自破。宇喜多直家是我與毛利之戰(zhàn)的關(guān)鍵，我夜觀天象，其命也將不久，您要親自前去交涉，分析厲害，讓他反毛利而向織田，如此，中國可定。唉，世人皆羨慕我聰明過人、謀略出眾，但卻不知正是如此，我才一輩子只能冠以軍師之名，無法親自統(tǒng)帥一兵一卒。如果我資質(zhì)愚鈍，信長大人和您定會讓我統(tǒng)率5、6千人的部隊(duì)建功立業(yè)成為大名。如今，能死于陣中，也算武士本色，我愿足矣。”羽柴秀吉握住半兵衛(wèi)的手，哭得泣不成聲。信長得到消息后，也下令厚葬半兵衛(wèi)。

明智光秀回到八上城心灰意冷，將消息告訴了荒木氏綱。荒木頓時(shí)泣不成聲：“主公啊，是我害了主公。明智大人，虧我相信于你，你……”。“荒木殿下，此事非我之過，實(shí)是信長大人過分憎恨波多野一家，誓要將其滅族啊。你看，這是我為你家主公說情受到的打傷。”“如此，是我錯(cuò)怪大人了。”“如今之計(jì)，只能讓你將波多野的后人馬上送走，以免再遭信長毒手。”“秀治次子尚在，我去下令去安排。”此子最后平安逃脫，成年后取名為波多野定吉。明智光秀想把荒木氏綱招入麾下，但氏綱自覺羞愧，稱病婉拒，派自己的兒子荒木氏清出仕。八上城陷落后，丹波國內(nèi)只剩下由赤井直正的侄子赤井忠家把守的黑井城了。直到1579年8月9日，黑井城陷落赤井忠家逃往沅江國，丹波國納入了信長的版圖。