2003年臺北“國史館”出版的《雷震案史料匯編：黃杰警總日記選輯》，其內容比《雷震案史料匯編——國防部檔案選輯》、《雷震案史料匯編——雷震獄中手稿》更清楚地呈現了1960年“雷震案”中情治機構密謀策劃、蔣介石的態度和指示，以及“國防會議副秘書長”蔣經國扮演的角色：

1960年6月12日：“陳副總統”（陳誠）召見指示：《自由中國》半月刊之處理，不必要“總統”負責，“副總統”愿身負其責，余曾...