大學士和字寄欽差協辦大學士總督將軍公福、領侍衛內大臣參贊公海、閩浙總督李、兩廣總督孫：乾隆五十二年十二月十五日奉上諭：本日福康安奏到搜剿賊莊、痛殲匪眾各折，系十一月十二日拜發，俱在昨日遞到十六、十九兩次奏折以前情形。同日又據李侍堯等奏詢據臺灣回至內地船戶信息一折內稱：據船戶錢泰來稱：福康安于前月十七、十八兩日攻得斗六門，進攻大里杙賊巢。內多有愿降者，知大兵已到，即行殺出。官兵乘勢殺進，已將大里杙打破。又船戶林任與稱，將軍等于二十五日進大里杙，賊眾俱已逃走，只有一個年老病人，同三個小孩尸身。據老病人說，大眾俱逃入山內，官兵連日搜山。此等情節，是鹿仔港義民林鷂、王溪二人告知等語。昨據福康安奏，擬由斗六門進攻大里杙賊巢。舒亮一路亦打仗得勝。是賊勢已就潰散，官兵可以直搗賊巢。今據李侍堯奏到詢之船戶各情形，自當確實。看來臺灣剿捕事宜，大局已定。惟李侍堯折內稱大里杙老病人所言，大眾逃入山內之語，賊匪經官兵屢次殲戮，窮蹙奔逃，若由海道竄逸，官兵乘船追捕，轉不免稍需時日。如果逃入內山，該處俱系生番居住，若番眾等畏其偪處，竟將賊首擒獻，固屬甚善。即或容其潛匿，不肯獻出，亦可趁官兵全勝之勢，直入內山，分兵搜捕，即將助逆生番，一并剿戮，亦非難事。福康安等務須迅速搜捕，將賊首設法生擒，勿令久匿稽誅為要。至大里杙所獲之犯，自必經福康安訊有供詞，想此時奏折業已在途，即日可到。
再據福康安奏，現在村莊民人，請示歸莊者紛紛不絕，恐賊匪冒充混入其中，即責成義民有身家者互相保結。并密訪與賊目素識之人，諭令設法擒獻賊首，許照莊錫舍之例，賞給官職等語。所辦俱好。賊匪現在勢已渙散，其黨羽自必紛紛解體。今諭令將賊首擒獻，許以官職，使其彼此相圖，更可離散賊黨。其請示歸莊民人，或有賊匪冒充混入，尤不可不嚴行查辦。
又據查奏恒瑞帶兵赴援、途中觀望各情節，以恒瑞過于持重，轉涉遲延，總由不諳機宜，辦理不能得手，所論甚公。又查詢蔡攀龍前此援應柴大紀時，并無復自城內殺出，打通道路之事。現據蔡攀龍自請革職。蔡攀龍應援入城后，雖未能帶兵出城剿殺賊匪，但伊屢次與賊打仗，奮勇出力，業已加恩擢用提督，其過尚可寬免。至所有遺失兵丁，是否實系陣亡，抑系逃散從賊之處，必當嚴切查究。若隨征兵丁，不顧主將，臨陣逃散，此而不加以懲創，將來何以用兵？此內從賊之兵，其罪更甚于從賊之民。福康安于查辦時，尤當嚴為區別，從重辦理，不可稍存姑息之見。
此時福康安自已進搗賊巢，四路搜捕，尤須設法籌辦，務將賊首林爽文等，按名生致于何日擒獲，即行迅速馳奏。
至此次剿捕賊匪，李侍堯駐札廈門，派撥官兵，運送米石，及照料各省官兵配渡，俱能悉心籌辦，經理妥速。孫士毅以鄰省總督駐札潮州，并能不分畛域，先事預籌，挑備官兵，撥運火藥，源源接濟，而于廣西、貴州官兵過境，亦俱妥為照料，行走迅速。李侍堯、孫士毅實心任事，殊為可嘉。前已將李侍堯賞戴雙眼花翎，與孫士毅皆交部議敘矣。即日大功告竣，自當更膺懋賞，以旌勞績。李侍堯應仍給還原襲伯爵。但現系伊弟李奉堯承襲，將來當賞給李奉堯提督銜，仍系一品頂戴。孫士毅亦應照從前蔡廷錫等之例，賞給世職，以示錫爵酬庸之意。除俟臺灣軍務全竣，再行頒發明旨外，著先諭知李侍堯、孫士毅。伊二人當倍加感奮，實心出力，以期承受恩眷。將此由六百里加緊各諭令知之。佇盼成功捷報速至。欽此。遵旨寄信前來。
六五、乾隆五十二年十二月十六日上諭（二道）
大學士和字寄欽差協辦大學士總督將軍公福、閩浙總督李、兩廣總督孫、乾隆五十二年十二月十六日奉上諭：據孫士毅奏：探詢福康安于十一月十七、八日攻得斗六門，即統兵直抵大里杙賊巢，賊匪紛紛出降。于二十三、四等日已將大里杙攻破等語。昨據李侍堯奏到官兵攻破大里杙情形，與孫士毅所奏大略相同，此信自系確實。想福康安等奏報之折，業已在途，即日可到。現在大兵剿洗賊巢，搜捕逆黨，想賊首賊目自無難即日就獲，成功蕆事，佇奏捷音，朕心甚為欣慰。孫士毅自辦理調兵運餉諸務以來，俱能不分畛域，實心經理，甚屬可嘉。除已降旨俟大功告竣后，當賞給世職外，孫士毅著先賞戴雙眼花翎，以示優眷。
至昨據福康安奏柴大紀、蔡攀龍守城打仗各情形多不確實一折，已降清字諭旨明白開示矣。朕因此事反復思之，竟至徹夜不能成寐。向來綠營將弁冒功謊報積習，原所不免，但以天下之大，地方事務在在需人任使，遇有軍務，勢不能祗仗滿洲官兵，竟置綠營于不用。此次臺灣逆匪滋事以來，該處領兵將弁雖俱未能振作有為，然就現在情形，該處將領而論，柴大紀、蔡攀龍二人尚能奮勇出力。柴大紀駐守縣城，已經半載，經賊匪百計攻圍，時時窺伺，柴大紀能督率兵民，力為捍衛，卒能保護無虞。雖伊節次奏報斬獲首級、奪取器械等事，或間有虛詞謊報，此亦綠營積習情事所有。但伊固守圍城，不辭勞瘁，亦當略其短而取其長。況柴大紀設果如福康安所云，為人詭譎取巧，則當縣城被圍緊急之時，朕曾經降旨諭令柴大紀，如該處力不能支，不妨帶兵出城，另圖進取。柴大紀接奏前旨，若果心存諉卸，何難委城而出，以為脫身之計。即縣城為賊所據，百姓為賊所得，亦得借口遵旨而行，朕亦難治以棄城不守之罪。乃柴大紀于奉到前旨后，堅持定見，竭力固守，不忍將城內數萬生靈委之于賊。是柴大紀尚知以國事為重，出自真心。朕閱其奏折，為之墮淚。豈福康安到彼目擊情形，尚不心生憫惻，轉事苛求，不能以朕之心為心乎？即如柴大紀前奏賊匪攻城時，用大板木車，中藏鎗炮，分路攻犯，被官兵用炮擊碎枋車一節，若果是虛詞，現在福康安奏到進抵縣城時，追殺賊匪，奪獲攻城大車二輛，又于興化店地方賊匪經官兵追趕，大炮鳥鎗遍地遺棄，俱為我兵所得等語。可見柴大紀前奏賊匪用大車架炮攻城之處，實有其事，并非虛捏之一證。又柴大紀所奏縣城糧食匱乏，地瓜、花生俱盡，日以油籸充食之語，雖縣城被圍時義民等尚有捐助糧米，零星接濟，兵民未必遽至盡食油籸，但當情形緊急之際，各路援兵并未實時前進，柴大紀目睹縣城糧食垂盡，至以日食油籸為詞，希冀援兵速到，而普吉保、恒瑞兩路尚復觀望不進，若再實言少有糧米，則兩路之救援更緩。此時縣城之存亡尚未可知，又安怪柴大紀之過甚其詞耶？今幸福康安等統兵速進，縣城圍解，甫獲更生，此等措語未實之處，朕尚加之寬宥，寧福康安不為之原諒耶？
至蔡攀龍現據福康安到彼查詢，于援應柴大紀時進城后仍被賊匪截斷后路，損失多兵，未能破解賊圍，亦并無自城內殺出打通道路之事。但蔡攀龍屢次打仗殺賊，曾經常青等保奏，頗為奮勇。伊帶兵赴援時，沿途遇賊接仗，督兵力戰，究能前抵縣城，協同守御。是蔡攀龍在領兵將弁中，尚為奮勉。朕已加恩擢授提督，福康安此時亦可毋庸過加責備。即云臺灣逆匪等糾眾倡亂，由于地方文武平日貪索擾累，以致激成事端，朕非不知，但該處百姓休養生聚有年，即使地方官貪黷斂怨，亦可據實上控，豈得公然竟敢叛逆。況官吏騷擾地方，剝削百姓，自系文職為多。至武職所轄，不過營伍兵丁，并不經管地方事務。縱使從中婪索，然較之地方文職所得，不過十之一、二。豈得以此歸咎柴大紀、蔡攀龍二人？此次破賊解圍官兵，會合攻剿，固屬福康安、海蘭察督率巴圖魯侍衛等奮勇力戰之功，該處綠營將弁俱屬怯懦無用，但就該處帶兵之員而論，其中勇怯不齊，亦應絜短較長，有所區別。豈可一概抹煞？即將來平定之后，焉能止留滿洲巴圖魯百余人駐守，將綠營將弁概行撤回之理？看來柴大紀、蔡攀龍二人未免因俱系提督大員，且屢經恩旨褒嘉，或稍涉自滿，在福康安前禮節或有不謹，致為福康安所憎，遂爾直揭其短乎？福康安身系大臣，不應如此居心。休休有容之謂何？況柴大紀、蔡攀龍俱現任提督，水陸將弁兵丁皆所統轄，福康安即有不滿伊二人之處，然其功究不可泯，亦應外示優容。若遽加之聲色，置之不齒，則所屬將弁兵丁，見統轄大員全無顏面，未免心存輕視，或竟至呼應不靈，從而解體，于事大有關系。今福康安奏到之折，于柴大紀、蔡攀龍二人，過事搜求，竟至不留余地，所奏殊為冒昧，究屬少不更事。即使伊二人實有綠營習氣，不可信任，福康安何妨俟大功告成到京時，密為面奏，亦不為遲，何必于此時，遽以此形之奏牘耶？朕于柴大紀、蔡攀龍二人，并非先有成見，不過念其守城打仗勤苦出力，曲加軫念。福康安非他人可比，尤當仰體朕心，略短取長，方為公忠體國之道。況柴大紀已加恩封以伯爵，蔡攀龍業經超擢提督，福康安所奏各情節，此時并無確據，又豈可轉沒其功，遽加以無名之罪耶？總之，柴大紀、蔡攀龍二人，功過自有定論。現已降旨將常青授為福州將軍，令其辦理善后事宜。至普吉保自較恒瑞為優，福康安此奏尚與朕意相合。恒瑞竟屬無用，應令其來京候旨。所有臺灣鎮總兵已著普吉保調補。常青曾任福州將軍，且甫離閩浙總督之任，今復任將軍，自可駕輕就熟。應于事竣后，令其酌留駐防官兵數百，以資彈壓，帶同普吉保在彼妥為籌辦，于善后一切自能經理裕如。福康安明春前赴天津時，即可令柴大紀、蔡攀龍一同前來瞻覲，宴賷畢令其各回提督本任，亦無不可。福康安此時總宜坦懷相待，不可稍露詞色，以致臺灣官吏得以窺測，心生輕視為是。將此由六百里加緊再行傳諭福康安，并諭李侍堯、孫士毅知之。仍著將攻搗賊巢、擒獲賊首之處，迅速馳奏。盼望成功喜報速至。欽此。遵旨寄信前來。
乾隆五十二年十二月十六日，內閣奉上諭：臺灣逆匪滋擾嘉義縣城時，普吉保、恒瑞先后帶兵前往援應，俱未能奮勇殺散賊匪，直抵縣城，均難辭咎。但普吉保由鹿仔港進兵收復笨港，移駐元長莊，并經屢次打仗殺賊，尚能自知奮勉。所有臺灣總鎮兵員缺，即著普吉保調補，以觀后效。其所遺汀州鎮總兵員缺，著福康安于軍營出力副將人員內揀選一員，奏明候朕簡放。恒瑞在鹽水港一味株守，毫無寸進，實屬無能，難勝將軍之任，著即來京候旨。至福州將軍員缺，前曾有旨欲將鄂輝調補。因現在保寧已補授伊犁將軍，李世杰仍調補四川總督。該省地方緊要，且毗連西藏，統轄番夷，俱有應辦事件。李世杰系屬漢人，且已年老，現在又因伊妻及長子病故，心緒不寧，恐辦理公務，精神不能周到。鄂輝在川有年，于該處事宜較為熟諳。將來臺灣事竣后，應令仍回成都將軍原任，以資駕輕就熟。至常青剿捕臺灣逆匪，雖〔未〕能督率將弁，克期奏績，但自駐守郡城以來，賊匪屢經攻擾，伊已年老，尚能臨陣殺賊，將郡城保護無虞，并節次派撥弁兵援應嘉義，調度有方，雖不宜復任總督，但伊從前曾任福州將軍，熟悉該處情形，且以閩浙總督，調補該處將軍，呼應較靈，于辦理一切善后事宜，更可得力，所有福州將軍員缺，即著常青補授。將來大功告成后，即留于臺灣，帶同普吉保辦理善后事宜。其湖廣總督員缺，即著舒常補授。所有工部尚書員缺，著福長安補授。欽此。
六六、乾隆五十二年十二月十七日上諭（二道）
乾隆五十二年十二月十七日，內閣奉上諭：現在臺灣剿捕逆匪，大功即日告竣，一切善后事宜，需用較多，自當寬為儲備，以資接濟。著戶部于附近鄰省內，再酌撥銀二百萬兩，令該督撫派員迅速解赴閩省，交該督等存貯備用。欽此。