丁亥正月朔，再達梧州，于梧守陸世廉取五十金為雇夫費，北進府江。魁楚走岑溪，化澄走潯州，永茂、晏日曙、太仆田芳，俱潛遁博白縣。護駕惟司農吳炳、翰林方以智、文選郎吳貞毓、給事中唐針、御史程源、中書吳其靁、洪士彭及金吾馬吉翔等。棟定肇后，令副將張月克取高、雷、廉三郡，遂入梧州，巡撫曹燁降。又令副將閻可義攻瓊州。

二月，帝至桂林，吳炳、方以智并相。式耜自肇至，肅殿陛，敕守御，定都于桂。以王錫襄、文安之入閣，周堪賡、郭都賢、劉遠生為六卿，金堡、丁時魁為給事中，趙繼鼎為御史，何騰蛟為督師，大學士堵胤錫、傅上瑞俱為巡撫都御史。魁楚在岑溪，屯兵千余，水陸設伏，大戰藤江，兵敗；被成棟射死。溫江、平樂相繼歸款。時，楚省武崗州及長、衡、永、寶四郡，尚為我守。王坤又勸帝趨楚。式耜言，半年之內，三四播遷，兵心民心，孤疑局蹐，楚不可遽往，粵不宜輕棄；不聽。因請身留桂，乃命式耜居守桂林，各路悉聽節制。以智忽棄妻子入山去。吳炳、王化澄典閣務，并馬吉翔等隨行。

四月，上武崗州，以巡道嚴起恒為大學士。江北、河南土寨曹志建、王朝俊、郝永忠等來歸，封志建永國公，余俱錫五等爵。晉何騰蛟世襲侯，守衡州。堵錫胤為總督，守長沙，聲勢稍振。當平樂之不守也，北兵直薄桂林，城中震恐。適新興伯焦璉自全州歸，控弦提兵接戰，稍卻之。式耜又疏請安國公劉承胤兵，承胤發數千人來援，用西洋炮奮擊，北兵退去，桂林獲全。璉久將桂，得桂人心，式耜以國士遇之，故得璉死力，以保桂功封式耜臨桂伯，辭不受。再疏請返蹕全陽，不報。

八月，孔有德破長沙，衡州總兵黃朝選、楊國棟被執。二十四日，武崗兵敗，帝踉蹌出奔，兩宮無不徒步。吳柄至慶遠府，覓二小艇，載帝及宮眷。

十一月，至象州，欲往南寧，又為亂兵所阻，乃次柳州，督師何騰蛟、閣臣嚴起恒及劉湘客咸至。桂南侯郝永忠、宜章伯盧鼎亦來自楚。式耜復疏言：『柳州猺獞雜處、不可久駐』。時騰蛟與永忠、璉、鼎等分防駐汛，馬吉翔力挽帝舟，乃分閣臣化澄、吏部左侍郎吳貞毓，間道護兩宮往南寧，帝乃溯舟西上。

十二月，始達桂林。瞿與嚴同相，君民上下，鞬戶避兵。

戊子二月，有允成、伯霍、允中者，搶入大內，劫帝于寢被中，置之城外，將在城職官，吊拷，飽乃揚去。錦衣吉翔，備布袍竹轎而行。

三月，至南寧，相隨者惟起恒、吉翔及司馬蕭琦等七人耳。式耜奔樟木港，刑部侍郎劉遠生、給練丁時魁、萬六吉及湘客俱至。草檄分路四發，促焦璉兵入援，式耜于四月朔復入桂，督師騰蛟自永寧至，滇鎮胡一清及焦璉自平樂至，督兵三面御之，北兵渡甘棠去。騰蛟列營榕江，式耜督勛鎮取全州，令巡撫魯可藻下梧州。帝在南寧，太子生，冊為皇太子，肆赦，詔名曰「萬喜」。

六月，李成棟反正，以全廣歸朝廷，遣洪天擢、潘曾緯、李綺三人赍奏，請駕蹕端州。初，棟于丁亥收繳粵東文武官印信五十余顆，取制臺印藏之。有愛妾揣知其意，朝夕從臾，棟曰：『憐此云間眷屬也。妾曰：『我敢獨享富貴乎？請先死尊前，以成君子之志』。遂自刎，棟抱尸哭。明日，即衣冠將制臺印，具疏迎駕。又金聲垣據南昌，藏表疏于佛經部面中，遣朱謀〈例上土下〉赍奏亦至。兩粵皆入版圖，式耜再請返桂。又令簡討蔡之俊、給事中蒙正發迎奉，竟由梧入端溪。于是化澄再相，朱天麟從太平要大拜，晏請自田州出為冢宰，吳貞毓以少宰兼副憲。先遣下廣，答諭成棟。張鳳翼以兵科兼翰林，張佐辰自貴州來掌選，龐天壽管司禮，顧之俊亦隨駕。曾經出仕，僉曰迎鑾。游手白丁，詭稱原職。六曹九列，濟濟蹌蹌。

八月朔，帝至肇慶，棟百里外迎接。宮中儲銀萬兩，以備賞賚，衣飾器皿，亦值萬金。政無大小，必稟命而行，封棟為惠國公。棟將上南雄下贛州，面奏曰：『南雄以下事，諸臣任之；廋關以外事，臣獨肩之』。因留養子元胤留守端州。袁彭年者，自號清流，業降棟為學道，歸朝，擢左都御史，攪權植黨。元胤本姓賈，中州人。彭年隆重其體，以內外權屬之，自名返正功臣。于是既降復歸者，曹燁為兵部尚書，耿獻忠為工部尚書，洪天擢為吏部侍郎，毛毓祥為通政使，潘曾緯為大理卿，李綺為學道。而自粵西來者，王、嚴、朱三相公，冢宰晏清、少宰吳貞毓、六科吳其靁、洪士彭、尹三聘、許兆進、張孝起為一派。從各路來者，宗伯吳文瀛、命憲劉湘客、吏科丁時魁、戶科蒙正發、禮科李用楫、兵科金堡、文選郎施召征、光祿卿陸世廉、太仆馬光、儀曹徐世儀等為一派。其廣東省太仆卿楊邦翰、翰林陳士杰、驗封吳以運、職方唐元楫、給事中李貞、御史高賚明等又為一派。望風景騖，元胤之門若市。

十月，元胤受棟密計，斬清督佟養甲于德慶。粵東全省，非奉棟咨，大小有司官，不得擅除授；桂林、平樂，則瞿相國為政；慶遠、柳州，則焦新興為政；潯南、思太，則陳慶國為政；吏部袖手杜門而已。臺省希棟意，共擊陳邦傅。邦傅浙籍，初鎮粵西，隆武掛征蠻將軍印，永歷封思恩侯，晉爵慶國公，曾有降啟到廣，為棟所鄙。至是攻之者，兵科金堡最勁，邦傅辨疏，請堡為監軍，觀臣十萬鐵騎。閣臣天麟票旨依允，有『金堡從來，朕亦未悉』語。吏科丁時魁曰：『堡論邦傅，即今監紀。又論郝永忠，若請其首，亦與之耶』？于是，率六科繳印于入閣，入丹墀，掛冠而出。帝正召馬光，追論五年前永州被難逃入全州事，聞外哄，大驚，賜諭元胤，前旨收回。天麟放歸田里，令諸臣照舊供職。袁彭年上疏曰：『（無）臣客歲以三千鐵騎西來，今日君臣安在』？帝持其章泣愬，舉朝大駭。

己丑正月，北兵破湘潭。督師騰蛟被執，不屈，死之。

二月，破信豐，棟歿于陣。聲桓據南昌，晝夜攻圍，王得仁被殺，聲桓投水死。一時警報壘至，奔逃相繼，于是，以棟中軍杜永和封江寧侯，行兩廣部院事。命武陟伯閻可義鎮南韶，以梅關守將楊杰為南雄總兵，新泰伯郝尚久防潮陽，奉化伯黃應杰守惠州，宣平伯董方策駐羅定，安樂伯楊大甫備蒼梧。甫縱兵剽掠，命元胤斬之；以安定侯馬寶代之。可義病卒，令寶豐伯羅成耀提督南韶。

四月，賊張獻忠養子孫可望遣龔鼎獻南金二千兩、馬四匹，求封親王名號。西粵南寧，與滇中廣南錯趾，可望來檄，有不允即提兵出戰等語。邦傅恐甚，令胡執恭矯詔封監國秦王。金堡駁之，謂秦王非異姓之封，監國乃即真之漸，遂定封為荊郡王，可望不受后封。督師堵胤錫敗于楚，乃浮蒼梧，下崧臺，風鶴震驚，人無固志。起恒獨相，尚紛飾太平。贈騰蛟中湘王，成棟寧夏王，帝設壇掛帛親祭。除夕，耿尚兵抵南雄，楊杰自刎。惠州黃應杰降。羅成耀聞報，棄韶遁。

庚寅正月，帝戒舟北上；金堡爭之，不得。式耜請留疏亦至，而帝移德慶，抵梧州矣。以舟為家，起恒親書水殿二字于帝所御之船。元胤不敢西，停舟肇慶。袁彭年赴廣投誠，捧犒師銀，哭陳前年叛清非本心，耿尚麾出之。

二月，下大常卿吏科都給事中丁時魁、兵科左給事中蒙正發、工科左給事中金堡、詹事府詹事禮部右侍郎劉湘客于錦衣獄。先是，戶部尚書吳貞毓、禮部右侍郎郭之奇、兵部左侍郎程源、右侍郎萬翱、給事中李用楫、張孝起、朱士焜、李日煒、御史朱統銅、王命來、陳光胤、彭佺等合疏，論左都御史袁彭年及時魁、堡等結黨招權罪。令錦衣張鳴鳳、王應科勘問拷訊。廷杖時，堡惟呼皇天后土、二祖列宗，臣未常負國而已。時魁謂朝廷興此大獄，亦當稍留元氣。無論時魁是三百年留下的臣子耶，是三百年留下一個有發的百姓，如此處分亦足矣。瞿相國七疏爭之，不得。貽書司禮夏國祥云：『上乃有此過舉，殊非老臣為祖宗擁戴之初意』。于是程源、朱謀〈例上土下〉讙然；謂式耜欲謀廢立矣。華亭侯王維恭泣奏中宮，殺諫臣是亡國事，奈何效之，乃得末減戍遣。堡自敘云：『人臣不幸當板蕩之時，報國有心，致君無術』。一朝處侍從四人，而屠沽兒為問官，破為詔獄，旋砍生柴為刑具；而為罪臣者，方且稱天呼祖而承之，不亦輕朝廷辱當世士哉！

十一月，耿尚兵屠羊城，殺李元胤，全廣皆沒。孔有德薄全州，直入嚴關，衛國公胡一青、開國趙印選，以分餉入桂。榕江空壁，武陵侯楊國棟、寧武馬養麟，從仄徑馳堵；未及戰，奔潰，一青、印選潛遁，瞿相國冠帶危坐署中，總督張同敞自靈川回。謂曰：『事迫矣，公將若何』？瞿公曰：『封疆之臣，知有封疆。封疆既失，身將安住』？敞曰：『公言是也，君恩師義，敞當共之』。呼酒笑飲，家人請出城再圖恢復；公不應，揮之去。明日被執，偕同敞死之，有致命詩。金給諫堡業披緇，上書耿尚請改葬式耜、同敞。吳江義士楊義，為具衣冠棺殮，同瘞于桂林北門之園；時庚寅冬季也。帝遂至滕縣，上南寧，入士州，相隨者四人：嚴、王二相國、馬吉翔、龐天壽而已。余皆散去。

壬辰，忠貞營李赤心、高必正、黨守素等來歸，俱賜五等爵。赤心等，皆闖賊部曲。湖南北既去，遂由郴、桂入梧州返正。孫可望自滇遣郝九儀至南寧，傳令殺內閣嚴起恒等十五人。帝往安龍，惟李定國不失臣禮，于是封定國為晉王，令經略粵西。劉文秀蜀王，經略兩川。可望仍以秦王恢復川南、湖北。可望怒，欲攻定國，殺內閣吳貞毓等十八人。定國統兵圍桂林；破之，孔賊合家焚死。可望與定國不協，互相攻殺。

甲午，定國大敗可望兵，遂奉帝入滇，可望力不能支。

丁酉，吳三桂統大兵自漢中進搗，全蜀悉定。劉文秀死，子震就撫。可望亦降于三桂，送至燕，封為義王；尋被酖。而帝在滇南，五六年間，固圍守疆，守疆頗安輯。以扶綱楊在為大學士，張佐辰為吏部尚書，程源為禮部尚書，孫順為兵部尚書，馬吉翔為大金吾。

壬寅八月，三桂略定黔中，直抵滇池。帝奔緬甸，定國自景線移兵猛獵，于七月病故。臨終，托孤嗣興于扈衛將軍平陽侯靳統武；令嗣興拜為父，統武專權，上下離異。鎮北將軍馬思良、前將軍胡順、都督王道亨等，帶兵二千，家口三千，于猛遠投誠。統武病死，嗣興亦歸附送燕。

十月，三桂統定西將軍愛星阿等，自三宣、猛卯一路抵木邦。鞏昌王白文選在緬國河泊地方，聞警至錫波江，江上搭浮橋控御。吳兵追至錫波，文選奔茶山。三桂望緬甸進發，諭緬國告以出邊之故。令其送出帝，否則禍且不測。

十二月朔，兵至緬城東舊晚坡，緬相錫真，于初二日赍番文，以緬兵百名將帝并太戶、中宮、太子、公主及宮女十五口送出。太監七名，同華亭侯王維恭妻妾子女，被緬酋殺死。文武官家口百余，并用船載送過江。帝至滇，被吳逆所弒。蓋自丙戌十月登極，迄今壬寅十二月革除，帝紀年延祚十有六年于茲矣。文選帶官百余員，兵三千名，婦女余丁七千四百口，馬三千匹，象十三只，于猛養歸順。同隨帝入緬者，松滋王病故，吉王、瑞昌王并黔國公沐天波，被新酋莽猛白所殺；明統遂絕。

鄭芝龍父子祖孫三世據海島