然而，平靜的日子并沒有持續太久。一天夜里，柯南突然從噩夢中驚醒，他滿頭大汗，夢中那邪惡勢力卷土重來、時空再次混亂的場景還歷歷在目。柯南定了定神，安慰自己只是個噩夢。可當他起身準備喝口水時，卻發現房間里的物品開始莫名地漂浮起來，窗外的天空閃爍著奇異的光芒。柯南心中一驚，難道噩夢要成真了？他迅速穿上衣服，準備去找伙伴們。剛出門，就碰到了同樣被異常現象驚醒的小蘭。小蘭一臉驚恐地說：“柯南，這是怎么回事？”柯南皺著眉頭，嚴肅地說：“看來又有新的危機出現了。”他們趕緊召集其他伙伴，眾人聚齊后，發現周圍的時空開始扭曲，一個巨大的黑洞出現在城市上空。從黑洞中傳出陣陣邪惡的笑聲，一個比之前更強大的邪惡存在緩緩現身，它冷冷地說：“你們以為打敗了我的分身就能高枕無憂？現在，真正的末日才剛開始！”柯南握緊拳頭，眼神堅定，他知道，一場前所未有的惡戰即將來臨。

愛麗絲開口道“之前我們面對是他的分身，現在本人現身，該怎么辦。”

跡部景吾說“之前我們能打過他分身，現本人一樣能打過。再說我們還有惡魔塞巴斯蒂安和夏爾·凡多姆海恩他們。”

忍足侑士說“跡部說的對。”

就在眾人表態之時，邪惡存在大手一揮，無數黑影如潮水般向他們涌來。塞巴斯蒂安瞬間擋在眾人身前，手中利刃閃爍著寒光，與黑影展開激烈交鋒。夏爾也不甘示弱，指揮著他的手下協助戰斗。柯南迅速分析局勢，他發現邪惡存在的弱點似乎與時空能量有關。

與此同時，愛麗絲利用自己的能力感知周圍的時空波動，試圖找到應對之策。跡部景吾和忍足侑士則帶領著其他伙伴，從不同方向對邪惡存在發起攻擊。然而，邪惡存在實力強大，他們的攻擊都被輕易化解。

就在大家有些力不從心時，柯南突然想到了一個辦法。他讓小蘭和其他伙伴集中精神，釋放出自己的信念之力，而他則利用阿笠博士發明的道具，將這些信念之力匯聚起來，形成一股強大的能量波。柯南大喝一聲，將能量波射向邪惡存在。邪惡存在被這股強大的能量擊中，身體開始搖晃。眾人見狀，乘勝追擊，最終成功將邪惡存在擊敗。時空恢復了平靜，大家也松了一口氣。

可還沒等眾人完全放松，那被擊敗的邪惡存在竟化作一團黑霧，迅速重組。它仰天狂笑：“你們太天真了，這點攻擊可殺不死我！”說著，它雙手一揮，周圍出現了無數虛幻的分身，將眾人團團圍住。柯南心中一緊，這次的情況比想象中還要棘手。就在這時，一直沉默的夏爾突然開口：“或許，我們可以嘗試從內部瓦解它。”眾人疑惑地看向他，夏爾解釋道：“這邪惡存在依靠時空能量，我們不妨利用它對時空的依賴，制造出虛假的時空波動，擾亂它的感知。”柯南眼睛一亮，覺得可行。于是，大家分工合作，柯南和阿笠博士操作道具制造波動，其他人則繼續攻擊吸引注意力。在眾人的努力下，邪惡存在果然被干擾，行動變得遲緩。柯南瞅準時機，再次匯聚信念之力，發出致命一擊。這一次，邪惡存在再也無法重組，化作一縷青煙消失了。時空徹底恢復正常，大家歡呼雀躍，又一次守護了世界的和平。