云朵朵踮腳擦拭咕咕鐘的玻璃罩時(shí)，突然聽見全鎮(zhèn)的鐘表同時(shí)發(fā)出哀鳴。銅鈴鐺從教堂尖頂滾落，像顆融化的太妃糖砸在面包店招牌上。她沖出門，看見送報(bào)的鴿子懸在半空，翅膀尖凝著冰晶。
“所有齒輪都卡住了！“鐘表匠爸爸的胡子結(jié)滿白霜，“除非找到時(shí)間之心……“話音未落，他的懷表鏈突然纏住云朵朵手腕，表盤射出藍(lán)光指向云端若隱若現(xiàn)的齒輪城堡。
機(jī)械鳥撞進(jìn)閣樓時(shí)帶著薄荷味的寒氣，它左翼鑲著彩虹齒輪，右爪抓著一片冰凌花瓣?！熬?！冰霜巫師占領(lǐng)了時(shí)間塔！“鳥喙開合間吐出電子音，“請立即……滋滋……銷毀我……“
云朵朵還沒摸到工具箱，機(jī)械鳥突然噴出雪霧。冰層順著桌腿爬上她的紅發(fā)梢，卻在觸到爸爸送的齒輪項(xiàng)鏈時(shí)“咔“地碎裂。機(jī)械鳥的紅眼睛閃了閃：“認(rèn)證通過，守護(hù)者血脈確認(rèn)?！?
旋轉(zhuǎn)齒輪橋在腳下咯吱作響，云朵朵發(fā)現(xiàn)冰霜巫師的白袍下露出半截繃帶——和她上個(gè)月摔傷膝蓋時(shí)纏的一模一樣。“重啟時(shí)間之心需要血親獻(xiàn)祭?！拔讕熤钢敯l(fā)光的齒輪花，“你爸爸沒告訴過你，他當(dāng)年是怎么逃走的？“
機(jī)械鳥突然撞向巫師的面具，銀碎片紛飛中露出一張和云朵朵七分像的臉。冰晶從她指尖開始蔓延：“姑姑？“
記憶像老電影在冰墻浮現(xiàn)：二十年前的雙胞胎姐妹，姐姐為阻止時(shí)間暴走變成機(jī)械鳥，妹妹為凍結(jié)病毒侵蝕的城鎮(zhèn)化身冰霜巫師。云朵朵摸到機(jī)械鳥腹部的銘文——“給侄女的周歲禮“。
“病毒早被解藥清除了！“云朵朵砸碎冰棺，露出里面沉睡的醫(yī)生媽媽。時(shí)間之心開始墜落，齒輪花瓣片片凋零。
云朵朵把齒輪項(xiàng)鏈按進(jìn)胸口：“用我的記憶做燃料吧！“她最后的記憶是六歲生日，媽媽握著她的手給機(jī)械鳥上發(fā)條。
當(dāng)全鎮(zhèn)鐘聲重新響起時(shí)，機(jī)械鳥銜著半片齒輪停在云朵朵肩頭。冰霜姑姑的白發(fā)轉(zhuǎn)黑，指著她空白素描本上自動浮現(xiàn)的新畫面：戴護(hù)士帽的媽媽正在融化冰棺。
云朵朵發(fā)現(xiàn)所有照片里自己的臉都變成了空白。當(dāng)她在舊玩具箱找到會說話的布偶熊，熊掌心的補(bǔ)丁突然浮現(xiàn)媽媽的字跡：“真正的記憶藏在齒輪背面“。布偶熊吃掉爸爸的懷表后，吐出一枚齒輪沙漏，反轉(zhuǎn)時(shí)浮現(xiàn)出冰霜姑姑抱著嬰兒時(shí)期的她。
穿過時(shí)間裂縫時(shí)，云朵朵跌進(jìn)飄滿棉花糖云的帳篷。獨(dú)眼機(jī)械師指揮發(fā)條獅子跳火圈，但獅子尾巴鑲著的齒輪竟與云朵朵項(xiàng)鏈完美契合。當(dāng)獅子吞下她的紅發(fā)，籠子里突然傳出冰霜姑姑年輕時(shí)的呼救聲。
為躲避機(jī)械禿鷲，云朵朵跳進(jìn)逆流的彩虹瀑布。水珠向上飛濺時(shí)顯影出爸爸的日記畫面：“姐姐自愿成為時(shí)間錨點(diǎn)“。當(dāng)她抓住發(fā)光的雨滴，發(fā)現(xiàn)里面凍著一朵齒輪玫瑰——和媽媽手術(shù)室標(biāo)本瓶里的一模一樣。
巨型鐘擺里關(guān)著成千上萬的機(jī)械螢火蟲，它們的復(fù)眼拼湊出爸爸被抹除的記憶：雙胞胎姐妹在時(shí)間塔做最后的抉擇。當(dāng)云朵朵放出螢火蟲，它們卻聚集成冰霜姑姑的虛影，說出令她顫抖的真相：“你才是時(shí)間病毒本體“。
時(shí)間之心盛開的花瓣開始凋零，每落下一片就有一塊城鎮(zhèn)消失。云朵朵在花蕊里發(fā)現(xiàn)微型墓碑，刻著她和媽媽并列的名字。機(jī)械鳥突然啄碎她的齒輪項(xiàng)鏈，里面飄出的星光凝成媽媽年輕時(shí)的模樣：“該說再見的是我們這些舊齒輪“。
所有金屬制品開始生銹腐爛，連機(jī)械鳥的翅膀都脫落了。云朵朵在垃圾山找到半本童話書，插畫里戴齒輪項(xiàng)鏈的女孩正在融化。當(dāng)她念出最后一頁的咒語，生銹的齒輪突然重組，變成爸爸失蹤那年制造的機(jī)器人保姆。
冰霜姑姑的白發(fā)全部脫落，露出底下機(jī)械頭顱。她將云朵朵封進(jìn)琥珀色的時(shí)間繭，繭絲卻是媽媽手術(shù)服的纖維。在繭內(nèi)，云朵朵看到自己胸口長出齒輪花，而現(xiàn)實(shí)世界中，全鎮(zhèn)居民正隨著她的心跳集體石化。
一群會說話的懷表劫持了時(shí)間塔。為首的月光懷表亮出底蓋照片——竟是年輕時(shí)的爸爸抱著機(jī)械鳥！它們偷走云朵朵的記憶沙漏后，冰霜姑姑突然叛變：“我等了二十年就為這一刻！“
云朵朵被推進(jìn)齒輪粉碎機(jī)時(shí)，冰霜姑姑的機(jī)械臂突然卡住傳送帶。兩個(gè)完全相同的女孩從時(shí)光漩渦走出，一個(gè)渾身機(jī)械，一個(gè)半透明——正是二十年前分開的雙胞胎姐妹！她們胸口的齒輪拼合成時(shí)間之心缺失的核心。
在時(shí)間崩塌的最后一刻，云朵朵將齒輪項(xiàng)鏈刺進(jìn)心臟。無數(shù)時(shí)間線開始重組：機(jī)械鳥在火災(zāi)中救出嬰兒，冰霜姑姑抱著妹妹的尸體痛哭，爸爸的懷表永遠(yuǎn)停在女兒出生時(shí)刻。當(dāng)晨光再次降臨，云朵朵發(fā)現(xiàn)自己在擦咕咕鐘，而玻璃罩倒影里站著三個(gè)微笑的女人。