“克林頓，我感應到Cosmos人的消息。”三枝說著，“她們預感到此刻怪獸的出現導致的危機。如果可以，她們會帶著魔斯拉回來幫忙。”
“哦？這個倒是好主意，但是這個世界上哪有那么簡單的事情，就算是有人愿意幫忙，但是這也需要時間。“克林頓說道，他雖然很期待這件事情發生，但他并不認為事情可以按照自己預先想象的那樣去發展。
“不，我相信她們會做到的。“三枝說道，“我相信她們可以幫助我們和哥斯拉建立一個更好的聯系。”
杰森十分反對：“她們要怎么做？用魔斯拉和哥斯拉彼此制衡來限制生態位嗎？”
“不，她們不會這么干的。“三枝搖頭，“我相信她們會找到解決問題的方法。“
克林頓點頭表示贊同：“既然你堅持，那我們就等她們來吧，如果真的可行，我們也可以嘗試一下這個辦法。
克林頓立即去匯報這個消息，結果無論是日本政府還是美國政府，都繁忙得無法接聽克林頓的電話。
此刻，日本和美國全部聚焦以色列，他們在處理兩大怪獸大戰后的事情。現在無論是哥斯拉還是阿撒瀉勒龍，都消失得無影無蹤。當前看來，一個比哥斯拉更加棘手的家伙出現了。
美國依舊在隱瞞實情，他們一直對外宣稱G細胞已經完全失活了。但是其他的科學家都知道，這種消息只是美國官員為了掩飾自己的丑陋而使用的謊言罷了。
但是這些科學家卻沒有揭穿這個謊言，畢竟這個謊言可以騙過其他的國家，但是卻騙不住自己的內心，在某些時候，美國政府確實有著非常重要的作用。
日本政府也一樣，他們也在隱藏實情。他們對外宣布的是，G細胞的研究已經更進一步，可以保證阿撒瀉勒龍不是G細胞發育的后代。不過為了銷毀罪證，日本直接派出機械哥斯拉來防衛這只怪獸。
日本利用核能源引誘阿撒瀉勒龍登陸希臘，借助全新代目的武器，同阿撒瀉勒龍展開激戰。最終日本取得了勝利，并且將這只怪獸擊殺在了海中。
而阿撒瀉勒龍被擊殺之后，其尸體也被運往了日本，日本將尸體封存，同時派出飛艇將其送回美國。而阿撒瀉勒龍死亡后，其尸體也被轉移到了美國。
這一戰，不光又一次讓國際上反G的聲音增大，也讓機械哥斯拉的名字“凱旋者機龍”一戰成名。
2024年11月3日，繼哥斯拉出現至今已有70年，就像70年前一樣，哥斯拉又一次登陸。舊金山的金門大橋又一次被摧毀，伴隨哥斯拉的吼叫，一場新的戰役開始。這一次，哥斯拉的目標直指舊金山市政廳，舊金山市的領導人們在驚慌之中開啟了一場大規模逃亡。
美國向日本申請使用機械哥斯拉來對抗哥斯拉。日本在經歷了短暫的猶豫后答應了美國的請求。在得到機械哥斯拉后，美國立即組織起龐大的兵力，對舊金山進行全面防護。
此刻，機械哥斯拉“凱旋者機龍”發射的數發射線，無不精確地打中哥斯拉，直接把哥斯拉打倒在地。猛烈的熱線讓哥斯拉直接昏迷。
這時候，三枝也在場，她用感知力聯系了魔斯拉的小美人。就在機械哥斯拉即將用絕對零度炮終結哥斯拉時，魔斯拉撞向機械哥斯拉，絕對零度炮打偏，直接把附近的十幾棟高樓全部粉碎。
隨后魔斯拉和機械哥斯拉展開大戰，魔斯拉的磷粉成功干擾了機械哥斯拉的控制系統，機械哥斯拉開始不受控制。數發導彈朝著四面八方發射，完全敵友不分，眼睛的顏色已經由黃色轉變為紅色，發出毀滅者一般的叫聲。
戰爭的對面，Cosmos小美人正在祈禱著她們信仰的神靈。一枚魔斯拉的卵即將孵化，小美人唱起“魔斯拉之歌”，為新的生命歌頌。
這時候，一個男子突兀的出現在小美人的身邊，男子用自己的手掌按住小美人，小美人立即停止了唱歌，一臉驚訝的望著男子。他將兩個小美人帶到了華盛頓，這里聯系著舊金山的戰場。
遠程操控機械哥斯拉的小組成員要求魔斯拉立即停止此刻的行為，但是小美人根本沒有理會對方。隨后，小美人被軟禁。小美人已經抓住了這些人的把柄，他們根本不會傷害自己，否則魔斯拉永遠不會停止。
這時候，哥斯拉已經蘇醒，看見魔斯拉和機械哥斯拉，不分敵友，一發又是一發的熱線朝著兩者打去。霎時間，舊金山成了三股勢力大混戰的場所。
此時此刻，哥斯拉已經完全失控，他的意識全無，他的腦袋里滿是復仇的念頭。日本的人，美國的人，日本的機械哥斯拉，全都是他的敵人，與此同時，他也在瘋狂地攻擊著魔斯拉。看得出，哥斯拉感覺到自己的領地受到侵犯。
然而，人們沒有注意到哥斯拉正在緩慢地向保存阿撒瀉勒龍尸體的實驗室。借助著魔斯拉和機械哥斯拉的大戰，哥斯拉躲開了人類的視線。當人類終于意識到哥斯拉消失時，哥斯拉已經炸毀了實驗室。阿撒瀉勒龍從實驗室飛奔出來，伴隨一聲吼叫，哥斯拉、魔斯拉、阿撒瀉勒龍全部把火力集中于機械哥斯拉。
機械哥斯拉被轟炸的七零八落。但是這還沒有結束，哥斯拉和阿撒瀉勒龍繼續攻擊著機械哥斯拉，最后機械哥斯拉完全破碎。
“阿撒瀉勒龍根本沒有死，為什么？”日本領袖憤怒地質問道。日本的軍隊開始撤離舊金山，他們知道，自己根本不可能阻擋得了哥斯拉。
然而，大戰還沒有結束，哥斯拉又一次用鋒利的尖牙撕咬著阿撒瀉勒龍。此刻，阿撒瀉勒龍體力明顯不及哥斯拉，只有挨打的份。
華盛頓的官員又一次威脅小美人讓魔斯拉制止此刻的戰斗。小美人根本沒有回應，而且她們已經感受到，魔斯拉的卵已經孵化了，此刻正前往舊金山協助哥斯拉對敵。
與此同時，日本又一次派出機械哥斯拉和摩杰拉。之前的機械哥斯拉根本就不是最新一代。日本這么做，無疑大大減弱了美國的勢力，這樣今后國際上對于哥斯拉的特點，就完全取決于日本，不再會有那么多的阻礙。
就在三只怪獸陷入僵局時，魔斯拉的幼蟲和日本的增援同時到達戰場。機械哥斯拉和摩杰拉結合成為真正的“凱旋者機龍”，三下五除二地就把三只怪獸全部打倒。
見狀，三枝未希利用感應，指揮哥斯拉、魔斯拉、阿撒瀉勒龍和魔斯拉幼蟲彼此合作，共同擊潰機械哥斯拉。
即便如此，凱旋者機龍依舊可以從容應對四只怪獸的攻擊。魔斯拉的磷粉對其完全無效，熱線攻擊被機械哥斯拉的防護鎧甲輕松格擋，幼蟲的黏性絲被機龍全部燒毀。
就這樣，機龍讓在場所有怪獸陷入苦戰。在阿撒瀉勒龍躺地不起時，機龍放出真正的絕對零度炮，光一發就完完全全讓阿撒瀉勒龍的細胞失去所有活性，這回，阿撒瀉勒龍是真的死透了。
此刻，華盛頓的政府機關人員終于意識到，日本下了一盤大棋，目的就是讓美國的權威性下降。所有人啞口無言，現在他們什么也做不了，只能祈禱有一個好的結局。
機龍抓住了哥斯拉，直飛向數千米的高空，將其摔下。一陣塵土飛揚，哥斯拉受到重傷，而機龍再次擺出使用絕對零度炮的姿態。魔斯拉見狀，飛向哥斯拉，擋住了這一發致命的攻擊。
隨后，魔斯拉的磷粉散開，干擾了機龍的控制，日本的控制室無法繼續連接機龍，機龍短暫宕機。哥斯拉吸收了剩余的磷粉的能量，傷口恢復，和魔斯拉幼蟲靈活配合，抓住了短暫的宕機，放出燃燒熱線。
就在機龍的控制恢復時，絕對零度炮已經被哥斯拉毀掉，魔斯拉幼蟲的絲線已經束縛了機龍的手臂。哥斯拉抓住了機龍，盡管機龍依舊在反抗，對于已經瘋狂的哥斯拉而言，這樣的反抗完全沒有意義。哥斯拉掰開機龍的嘴，往機龍嘴里放出燃燒熱線，直接從內部打破了機龍。爆炸過后，哥斯拉看向了魔斯拉幼蟲，確定對方沒有敵意后，再一次返回太平洋。
這一次，日本的軍隊也是損失慘重，損失了超過一半的兵力，幾十年的研究成果最終化為灰燼。
美國機構人員釋放了魔斯拉的小美人。克林頓等人也趕到這里，“那只哥斯拉比他的父親更加強大，我們已經給他起了一個名字，叫“終戰”，終戰哥斯拉，終焉的戰龍。”
終戰哥斯拉在沒有紅蓮時，就已經可以使用燃燒熱線。越來越多的人相信杰森的理論，美國開始支持克林頓等人的觀點，至此，美日已經成為兩個陣營。
在美國的國境內，一艘游輪停靠著，這是一艘私人的船，沒有任何標志。游客們也只是認為這里是一個休息的地方。然而，幾個穿著特制防輻射服的日本官兵正在游輪內和美國的科研人員進行非法交易。