蜜月后的二人回到了木葉村，再次投入到工作當中。因為綱手離開的期間奈良鹿久和長老會將火影的工作處理的非常好。于是綱手提出了長老會輪班制，所有長老會成員輪流換班，配合處理火影事務。
于是每天都有兩位不同的長老會成員加上奈良鹿久幫助綱手工作，這下綱手輕松多了，文彥也跟著閑了下來。
正好有一堆畢業已經有段時間的學生成為下忍，甚至中忍，沒人帶，至今都沒有分班。就這樣，文彥被派去做村里的擔當上忍，當老師，帶學生，做任務。
最后分班結果如下：
第一班旗木文彥：漩渦玖辛奈、波風水門、藥師野乃宇
第二班旗木朔茂：繩樹、油女志微、犬冢爪
第三班邁特戴：山中亥一、秋道丁座、奈良鹿久
這個分班是文彥親自決定的，很完美。將玖辛奈和水門安排在一起，再派個醫療忍者保護。
繩樹那邊因為不能學黑雷，跟著朔茂學雷遁再合適不過了，加上隊里油女和犬冢都很厲害，可以通過野外的蟲子或犬冢的嗅覺提前感知危險。
至于最讓人放心不下的莽夫邁特戴，則給他安排了十分靠譜的豬鹿蝶做隊友，有奈良鹿久護著，隊伍應該沒事。
最近第一班只接了些簡單的抓貓抓狗、護衛商隊等任務。其他時間，三人各自修煉。
在第一班剛成立不久后還發生過一件大事，砂隱村為了將尾獸用于軍事用途，不斷地進行尾獸試驗。但由于人柱力未能完全控制尾獸，一尾守鶴多次暴走，對砂隱村造成巨大破壞，每次制止失控的一尾都會出現眾多的傷亡。為了能夠完美地操控尾獸，砂隱急需掌握壓制尾獸查克拉的方法。
砂隱苦于尾獸研究遲遲沒有進展，于是派遣忍者潛入木葉村拐走具有特殊查克拉能夠封印尾獸力量的漩渦玖辛奈，尚且年幼的水門在本次事件中就已展現非凡的天賦，跟蹤玖辛奈留下的線索追上敵人，干凈利落地將三名成年云隱忍者擊倒，成功解救玖辛奈的同時還俘獲了她的芳心，拾起了牽住兩人的命運紅線。
后來為保證第一班成員的安全，文彥開始安排并指導三人修煉。旋渦久幸奈在漩渦水戶的教導下，已經學會了漩渦一族的所有封印術。
現在在文彥的要求下，漩渦玖幸奈稍微解開了一些九尾的封印。于是九尾一次次的爆發，玖幸奈就一次次的尾獸化，每次都是由文彥吸取了一定的九尾查克拉和生命力才讓九尾安靜下來。
接下來幾個月，在九尾平靜一些后，漩渦玖幸奈開始進入內心世界，嘗試與九尾建立溝通。最開始的每次溝通，面對著那九條尾巴的巨大妖狐的憤怒與恐懼，每一次都嚇得旋渦久幸奈嚎啕大哭。
隨著后來旋渦久幸奈堅持不懈的與九尾聊天溝通，九尾的態度也開始慢慢轉變。從開始的憤怒到平靜，從平靜到無所謂，從無所謂再到成為朋友。
“想用我的力量，盡管拿去用好了，只是別老在本大爺面前哭鼻子就好。”九尾無奈的這般說道。
此時的漩渦玖幸奈具備有漩渦一族所特有的強大查克拉與頑強生命力以及封印術，還可以憑借九尾的力量敏銳的感知周圍的惡意，并使用尾獸玉和九尾查克拉。
至此旋渦久幸奈的修行完成，現在她已經成為了第一班學生中最強的一位，接下去只需要繼續熟練自身的能力與累積戰斗經驗就好。
波風水門在見過好幾次漩渦玖辛奈使用出尾獸玉后，沉思許久后從尾獸玉中獲得了靈感。并對文彥說想要開發一種名為螺旋丸的無印忍術，將查克拉聚集在手中壓縮旋轉，形成類似尾獸玉的威力。
文彥聽后支持了波風水門的這個想法，并指點了幾句就讓他自己慢慢開發去了。不止如此，波風水門還具有學習時空間忍術的天分。于是文彥從綱手家中要來了二代火影，千手扉間所創造的飛雷神之術卷軸，交給波風水門學習。
飛雷神之術卷軸里詳細記載了二代火影千手扉間對該術的心得、用法及學習方式。于是接下來的日子里除了任務以外，波風水門都在專注的學習忍術。
因為文彥對醫療忍術是一竅不通，自然無法指導藥師野乃宇修行，索性把她交給了綱手。就這樣，藥師野乃宇成為了自靜音后，綱手的第二個弟子。
藥師野乃宇也確實很有醫療忍者的天賦，很快就在綱手的教導下學會了掌仙術和查克拉手術刀，在沒有任務的時候，通常都在木葉醫院實習醫療忍術。
很快三年時間過去了，這三年里文彥刻意沒有去接難度較高的任務、或是需要長時間外出的任務，以便讓這三人有充分的時間修煉。
畢竟由于隊伍里有尾獸人柱力的存在，無論是在任務中尾獸力量不受控的爆發，還是被敵村忍者盯上，對這三人來說都是很危險的。
如今三人都已修煉完成，旋渦久幸奈可以在半尾獸化六根尾巴的狀態下繼續保持清醒的意識并完美控制力量，就如同曾經的金角一樣。
而波風水門不僅學會了飛雷神之術，還成功開發出了A級無印忍術，螺旋丸。此時波風水門的戰斗風格已經成型，利用飛雷神之術快速瞬移過程中，出現在敵方意想不到的位置，用螺旋丸攻擊。
至于年齡還比那二人小三歲的藥師野乃宇，三年里在木葉醫院工作期間，救人無數，深得村中忍者村民們的信賴。在治病救人的過程中，被認可的藥師野乃宇獲得了無比的滿足感，這也讓她確定了自己的人生目標，將以救死扶傷為己任。
“看來是時候了，雛鳥總要飛向天空啊。”
文彥說罷，走進了任務發布處，領取了一個A級任務，作為第一班的畢業考核。
第一班的A級畢業任務，正式開始！