在早年的學術研究上，對張卓元產生最大影響的是孫冶方。張卓元認為，經濟學是經世致用之學，所以他經常鼓勵年輕人探索一些未知的規律，敢于標新立異，積極地參與爭鳴。張卓元說這些都受到孫冶方的啟發。1957年年底，孫冶方一到經濟所，就主張學術上的標新立異，也就是“求異存同”。孫冶方說，我們外交上講要求同存異，我們學術上應該求異存同，這樣的話學術討論才能開展，學術才能進步，百家爭鳴才能真正開展起來。

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