胎兒心臟發育是一個非常復雜精密的過程，任何干擾因素都有可能導致心臟發育畸形的產生，歸納起來主要是兩大因素：

孕婦在妊娠早期接觸到物理、化學等致畸物，如X射線、同位素等放射性物質。

懷孕最初3個月，特別是懷孕3～8周，碰到病毒感染，胎兒易發生基因改變而導致心臟血管畸形。風疹病毒、流感病毒、流行性腮腺炎病毒、柯薩奇病毒、皰疹病毒等是較常見的致畸病毒。

懷孕期間不慎服用可能導致胎兒致畸的藥物，如某些抗菌素或抗病毒藥物、成分不明的中藥等。

家庭裝修污染或生活環境周邊化工污染等。

是使胎兒致畸而發生先天性心臟病的高危因素。

先天性心臟病不完全因為遺傳導致，但家長（直系親屬）是先天性心臟病者，其后代也發病的概率要大于正常人群。

如患有糖尿病、內分泌系統疾病等，尤其是在孕期未能有效控制病情者更易導致胎兒畸變。

孕婦嗜好煙、酒或受“二手煙”影響或夫妻酒后同房受孕，均可能會使胎兒染色體發生異常，從而導致心臟血管異常。