任何疾病的治療都有一個動態的最佳時機。先天性心臟病的最佳手術時機取決于多種因素，包括寶寶所患心臟病的類型、年齡、體重、生長發育情況、是否有反復呼吸道感染以及所選擇醫院的診療技術水平等。當然，不是所有的先天性心臟病寶寶都可以慢慢選擇時間，有些類型需要出生后盡快手術，如大動脈轉位、室間隔完整型肺動脈閉鎖、完全性肺靜脈異位引流、永存動脈干和主動脈弓中斷等；有的寶寶因為心臟缺損巨大而出現心衰和肺動脈壓力增高，也應盡早手術。