心電圖只能監測心臟節律情況，卻不能查出是否有結構性變化。大多數先天性心臟病患兒早期心臟并無明顯擴大，故心電圖可為正常。隨著病情進展，心臟增大、心功能減低，有可能出現心電圖異常。