故事發(fā)生在《奧特曼傳奇》之后，打敗海帕杰頓、體內還蘊含著高斯和戴拿力量的賽羅來到怪獸墓場。侵略者百特星人召集地獄四獸士:EX雷德王、貝蒙斯坦、伽汝布斯、眼Q跟賽羅進行戰(zhàn)斗。利用新力量的賽羅輕易打敗地獄四獸士，但是吸收了四地獄獸士力量的百特星人利用皮古蒙的死威脅賽羅，最后賽羅利用新的力量分身變成強力日冕賽羅和月神奇跡賽羅打敗百特星人并成功救出皮古蒙，并與究極賽羅警備隊一起離開怪獸墓場。

繼百特星人后，惡劣宇宙人美菲拉斯星人、冷凍星人格羅扎姆、策謀宇宙人帝斯雷姆、惡霸宇宙人帝國星人、地獄星人希波利特星人組合成暗黑五人組。假扮成奧特之母的希波利特星人被賽羅識破計劃失敗被強力日冕賽羅打敗，接著帝國星人、泰蘭特、格羅扎姆、帝斯雷姆一起進攻賽羅。但被趕來的詹伯特、詹奈、紅蓮火焰、鏡子騎士相救。賽羅在怪獸墓場打敗綁架皮古蒙的美菲拉斯星人后，和自己在另一個宇宙打倒的貝利亞奧特曼的靈魂寄宿在奧特曼的宿敵黑暗宇宙大皇帝安培拉星人制造的暗黑鎧甲誕生的黑暗大皇帝凱撒黑暗戰(zhàn)斗，打倒他后貝利亞的靈魂離開了黑暗鎧甲并且侵入奪取了賽羅的肉體，使黑暗賽羅誕生。黑暗賽羅以壓倒性的實力輕松全滅究極賽羅警備隊，隨后帶領部下企圖統治全部宇宙。但是原本已經被吞沒了的賽羅的意識被同伴們喚醒并變身成光輝賽羅，在賽羅體內貝利亞的靈魂被光輝賽羅驅逐出，黑暗賽羅也因此消失了。隨后光輝賽羅倒流時間復活究極賽羅警備隊，但是因為時間倒流的緣故，使貝利亞也得以復活。其目的就是為了給賽羅奧特曼一個新型創(chuàng)造的空間。