伊藤真司行走在1966年日本的街道上，心里異常的興奮，因為自己從今天開始竟然成了一名科學特搜隊隊員。隨后，慢慢的走進了科特隊本部的大門，只見里面人雖然只有幾個，但一個個都忙得焦頭爛額，顯然是有大事情發生，都沒有人搭理伊藤真司，直到最后早田才發現了伊藤真司，把大家招集起來一一做了個自我介紹后伊藤真司才算是順利入隊。原來就在昨天凌晨，科特隊本部接到了自衛隊的緊急報告，十幾個小時前雷達就在東京上空捕捉到了一個發出奇怪電波的物體，剛發出警報不明飛行物體就消失了，村松隊長向巴黎總局查詢，但得到的答復卻是當時世界上沒有哪一個國家在發射宇宙飛船或人造衛星。隨后，前往自衛隊基地調查的早田，發出報告顯示怪電波最后消失的地點是北緯35度43分，東經139度38分--這正是東京的地理中心，具體位于玉殿山的國家科學中心，感到事態的嚴重性，隊長立即命令嵐隊員火速前往出事地點進行調查，當嵐隊員到達科學中心后，震驚的發現中心內所有人員全部像蠟燭一樣被凝固住了，這時一個怪異的生物突然出現在嵐面前，還沒等他反應過來便被怪獸掌中發出的紅色光線給定住了，接著，早田率領了一隊自衛隊士兵前來增援，可是在怪獸強大且怪異的攻擊力下幾呼全軍覆沒，僅有他自己憑借著過人的反應能力逃過一節。為了對付這個來歷不明的敵人，自衛隊召開了緊急軍事會議，可是開了幾個小時的會議下來，一幫高級軍官除了相互爭吵外一點實質性的結果也沒有達成，不得已下，只有暫時采納了村松隊長提出的方案，決定嘗試性的和對方進行接觸，了解真正的目的，另一方面，新式導彈擊鷹也做好了發射準備，以便在萬一旳情況下以武力解決。