消化系統疾病包括食管、胃、腸、肝、膽、胰以及腹膜、腸系膜、網膜等臟器的疾病。消化系統疾病屬常見病。在我國，胃癌和肝癌的病死率在惡性腫瘤病死率排名中分別位于第2和第3位，近年大腸癌、胰腺癌患病率有明顯上升趨勢。消化性潰瘍是最常見的消化系疾病之一，近年來可能由于根除幽門螺桿菌（ Helicobacter pylori，Hp）治療方法的普及而致復發率降低等原因，就診人數有所減少。慢性乙型病毒性肝炎和肝炎后肝硬化在我國一直相當普遍。酒精性肝病和酒精性肝硬化在西方國家相當常見，而近年在我國亦漸見增多。隨著社會發展，我國疾病譜也在發生變化。以往在我國并未引起重視的胃食管反流病和功能性胃腸病，近年來已引起我國消化病學界的高度重視。炎癥性腸病以往屬西方國家常見病，在我國少見，而近年來在我國報道不斷增加。近年調查表明非酒精性脂肪性肝病已成為我國常見慢性肝病之一。