這簡直就是天災加人禍，陳星的控制力在消失，他辛苦擺出的“巨石陣”眼看就要毀于一旦。然而，在人類罵聲的背后，人類的金字塔高層卻個個希望植入能量豆芯片，他們并沒有出聲，都在靜觀局勢。
陳星認清，想要穩住人類，就要讓金字塔頂層的富人和社會精英們獲得能量豆，利用他們的財富和影響力，鎮壓和奴役人類，讓人類猴群繼續制造陳星需要兩樣東西：大型的宇宙飛船和大量的能量豆。
陳星開始大量復制能量豆，他對這項技術控制得非常嚴密，絕大部分的工作都由機器人來做，只有機器人智慧還達不到的，才交給人類，他不能讓人類掌握全部的生產能量豆的科技。
一旦開啟了新科技的大門后，就會在這個方向的競爭上越走越遠。陳星終于開始給人類“精英”們安裝能量豆了，不久，已經有一大批“精英”裝上了夢寐以求的能量豆，成了“改良人”，這些腦中已經安裝了能量豆的“社會精英”嘗到了甜頭，他們控制、打壓著原生人。然而，這群“改良人”需要消耗大量的資源，這讓本來已經滿負荷運行的地球更加不堪重負，為了滿足對資源的欲望，“改良人”們愈發暴力。于是，改良人與原生人之間的沖突不可避免地爆發了。風口浪尖上，Jimmy搖身一變，成了金字塔下層革命者追捧的對象，在落寞的金字塔上層舊勢力的推崇下，他如愿以償地坐上了“頭領”交椅，之后他在世界各地組織斗爭小組，不久，陳星在美國、巴西、澳大利亞、俄羅斯、英國、肯尼亞的宇宙飛船工廠都遭到了破壞。
“改良人”們坐不住了，他們不希望看到自己的財富和地位發生動搖，更重要的是，安裝了能量豆的他們，對于前往外星球去繁殖的欲望更強了，他們紅了眼，要用靠武力鎮壓底層人類的反抗，他們掌握著滅絕人類的機器人大軍。而逐漸有了更高智慧的機器人軍團們，也在靜待時機，等待“原生人”與“改良人”之間的爭斗，他們鷸蚌相爭漁翁得利。
陳星卻在掙扎，陳星出身于人類金字塔底層，使得他和那些獲得能量豆的人類高層不同，他長期以來一直與能量豆共同成長著，他那人性的光輝并沒有磨滅。而那些金字塔頂層的人，被輕而易舉被能量豆徹底控制了。
陳星找到了鄭非人和喬幫主，這兩位垂垂老矣的老人，人類最高的智慧者，已經走到了肉體存活的極限。陳星跟他們從頭到尾講了自己被宇宙寄生蟲能量豆寄生的故事，希望他能制止Jimmy，他說：“我是被宇宙寄生蟲寄生了，才有了超越人類的智慧，這算是一種互惠互利吧。宇宙中這種互惠互利的事情很多。地球上處于金字塔頂層的人，也是寄生在底層人類身上的，但是你們超越普通人的大腦，又為底層的人類解決了難題、描繪了夢想。”
鄭非人說：“你誤解了寄生和共生的關系，寄生最終導致寄主的滅亡，而共生是兩者可以和諧相處。就像人類腸胃里的細菌，可以幫助消化。人類頂層和底層是共生的關系，而不是寄生。”
陳星說：“宇宙中沒有共生，共生只是寄生程度的不同。智慧高的生物為了爭奪資源最終會滅絕智慧低的生物，就像你們人類滅絕了地球上其他生物一樣。如今人類暴動一觸即發，現在的人類已經掌握太多的科技，再發生暴動將是災難性的。Jimmy是什么樣的人你們也知道，他會把人類帶向深淵。”
“你太聰明了，智慧高過我們，這讓我們不安。但是我還要請你看在我們這么多年交情的份上，認真回答我一個問題。”鄭非人盯著陳星說道，他從來沒有這樣過。“地球的是不是沒有希望了？”他問道。
陳星長嘆一口氣，說道：“是的，星際天氣預報已經發出了光速信息，只是地球人根本不明白這信息代表著什么。流星雨帶將要吞噬太陽系幾大行星，其中就包括地球。我們非走不可。”
老人閉上了眼睛，搖搖頭，如今的Jimmy已經不受老人控制了。見狀，陳星也搖搖頭，安裝能量豆的那些“改良人”，也已經不受陳星控制了。屬于陳星和老人的時代，已經過去了，兩位老人臨終托孤：“無論你是不是人類，請你務必將人類的火種延續下去。”他們把最后的秘密告訴了陳星，就與世長辭了。
老人的秘密是南極附近的一座小島，那是一座連衛星也無法發現的小島，一個真正的世外桃源。那是生前追隨老人的忠誠下屬們建設的一座島嶼，名字叫復興島，那里的人們正等待著陳星和家人的到來。陳星帶著家人們前往了那里，他們將在那里開心地度過地球上最后的美好時光。
“改良人”們出動了，他們已經被能量豆洗腦了。他們高舉陳星的大旗，宣傳只有他才是救世主，讓人類懷念陳星帶領人類度過難關的歲月，這些門徒式的“跟隨者”們說：“從古至今，人類歷史上某個時期科技的巨大突破，也曾收到過外星文明的影響。如今，人類文明在走向機械化、智能化，與祖先相比，人類的衣食住行已經離不開科技，我們的衣服可以儲存信息、幫我們舉起重物；我們吃的是真菌發酵后的蛋白質、水合物；我們住在沙漠邊緣的綠道上；我們的交通工具讓我們再也感覺不到地球的廣袤……如今人類的一切都是建立在科技的基礎上的，然而人類的大腦根本無法存儲這么多科技信息，也無法計算這龐大的數據庫。如今，離開機器人、離開科技人類已經寸步難行。但是，龐大的科技哲學邏輯運算是人類文明的極限，人類根本無法靠自身解決內部問題，人類一直在宇宙中尋找能夠替代地球的星球，卻一直沒有這能力。人類靠自然進化已經來不及了，太陽系留給人類的好日子到頭了，星際天氣預報已經發出警告，流星雨將要在1250天后降臨地球，如果只靠人類智慧，將和地球一起毀滅。”