萬歷二十五年春正月十一日，朝鮮使臣請求幫助。二月丙寅，再商議討伐倭寇。丙子，前備倭都督同知麻貴擔任總兵官，統一南北諸軍。三月乙巳，山東右參政楊鎬擔任僉都御史，經略朝鮮軍務。

自己不，兵部侍郎邢擔任尚書，總督薊、遼、保定軍務，經略御倭。夏六月十九日，皇極、中極、建極三殿火災。癸未，罷修國史。秋七月癸巳日，誡諭群臣。丁酉，下詔赦免天下。

這個月，楊應龍反叛，攻占合江、綦江。八月丁丑日，倭寇攻破朝鮮閑山，于是逼近南原，副總兵楊元棄城逃走，倭寇逼近王京。甲申，京師地震。九月二十四日，逮捕前兵部尚書石星入獄，論死刑。

冬十月十七日，安南黎只有潭篡位自立，敲門請求罪，下詔授為安南都統使。這一年，琉球入朝進貢。

萬歷二十六年春正月，官軍攻擊蔚山倭寇，沒有成功，楊鎬、麻貴逃奔王京。

三月癸卯，賜趙秉忠等進士及第、出身不等。壬子日，群臣到文華門奏請皇長子成年，不允許。夏季四月丁卯日，遼東總兵官李如松出塞，遇伏戰死。壬申，京都洛陽發生旱災，命令修身反省。

六月丁巳，楊鎬被免職。戊午，中官李敬廣東采集珠寶。丙寅，張位罷。丙子，巡撫天津僉都御史萬世德經略朝鮮。秋七月丙戌，中官魯保出賣兩淮余鹽。

八月丁丑日，京師地震。九月二十四日，免浙江遭災地區的田租。冬季十月乙卯日，總兵官劉縫、麻貴分兵抗擊倭寇，失敗的。董一元攻擊新寨倭寇，失敗。

十一月十七日，蔚山倭寇放棄逃跑，官軍分道進攻。十二月，總兵官陳瞞在乙山打敗倭寇，朝鮮平。這一年，烏斯藏入朝進貢。

萬歷二十七年二月三日，分別派遣宦官兼任浙江、福建、廣東市舶司。這個月，貴州巡撫江東之派兵討伐楊應龍，失敗了。

三月二十四日，前兵部侍郎李化龍總督四川、湖廣、貴州軍務，討伐楊應龍。夏季四月甲戌，駕臨午門，接受倭寇俘虜。這個月，臨清百姓改變，焚燒稅使馬堂熱，殺死他的隨從三十四人。

閏正月丙戌日，因為倭寇平定，下詔天下，任東征加派田賦。己丑，長時間干旱，命令修身反省。丙申日，因為各位皇子結婚，下詔取太倉銀二千四百萬兩。

戶部匱乏，命令嚴格考核天下儲蓄。六月己亥日，楊應龍攻陷綦江，參將房嘉寵、游擊張良賢戰死。秋八月十四日，陜西狄道縣發生山崩。九月，土蠻進犯錦州。冬季十月壬午，販濟京城饑民。

丙戌，因播州用兵，對四川、湖廣田賦。戊子，貴州宣慰使安疆臣犯罪，下詔討賊贖罪。十一月十八日，免河南遭災地區的田租。癸酉，賑濟畿輔及鳳陽等地發生。

十二月十六日，武昌、漢陽百姓改變，打傷稅使陳奉。戊子，賑濟京師流民。這一年，琉球入朝進貢。

萬歷二十八年春二月十八日，京師地震。丙戌，李化龍率師分八路進軍討伐播州。夏季，六月十六日，攻克海龍囤，楊應龍自編而死，播州平。秋季七月辛亥日，干旱，命令修身反省。

八月初四日，慈慶宮成。丙子，撤除朝鮮守兵。九月甲寅日，停刑。這是秋季，炒花進犯遼東，副總兵解生等人失敗。冬十月辛沒有，貴州皮林苗叛亂，總兵官陳瞞討伐的。丙子，云南稅監楊榮開采阿瓦、孟密寶井。

十二月乙末日，駕臨午門，受播州俘虜。這一年，兩畿各省災傷，民饑盜起，內外群臣紛紛上奏章請求罷除礦稅監，都不允許。大西洋人利瑪竇進獻方物。

萬歷二十九年春正月二十一日，因播州平，下詔天下，免除四川、貴州、湖廣、云南加派的田租賦稅，授官民牽連之罪。這個月，皮林苗賊平定。二月甲戌日，賑救大同、宣府饑荒。

三月乙卯日，賜封張以誠等人為進士及第、出身不等。這個月，武昌百姓改變，殺掉稅監陳奉隨從六人，焚毀巡撫公署。

夏四月乙酉，召回陳奉，以守備承天中官杜茂替代的。五月，蘇州民變，殺掉織造中官孫隆隨從數人。六月，北京自去年六月不降雨，到這個月乙亥開始下雨。山東、山西、河南都大旱。

丁亥，法官奏請熱審，不報。這個夏天，賑濟畿內饑荒。秋九月十一日，黃河在開封、歸德。

丁未，趙志皋死去。癸丑，振興貴州饑荒。戊午，前禮部尚書沈鯉、朱賡同時兼任東閣大學士，參與機要事務。冬十月十五日，立皇長子朱常洛為皇太子，封兒子福王朱常洵，瑞王朱常浩，惠王朱常潤，桂王朱常瀛。

下詔赦免天下。壬辰，加上慈圣皇太后尊號。十二月辛未，下詔恢復朵顏馬市。這一年，琉球入朝進貢。三十年春正月二十一日，因各地災情命令修身反省。

二月己卯，不適，召見大學士沈一貫在啟樣宮，命罷礦稅，停止織造，釋放囚犯，恢復建言諸臣職務。第二天，病情好轉，睡覺前詔。甲申，重建乾清、坤寧二宮。

閏月丙申，恢復河套諸部進貢交易。戊午，河州黃河枯竭。三月五日，騰越民變，殺死稅監委官。夏四月十六日，賑濟順天、永平饑荒。五月乙亥，法官奏請熱審，不報。秋季七月辛巳日，邊防軍餉缺，命令嚴厲催促拖欠。

這個月，緬軍攻陷蠻莫宣撫司，宣撫思正跑回騰越，敵人追趕到，有司把正以感謝敵人，開始解。冬十月二十日，賑濟江北災害。丙辰，停刑。這一年，琉球、哈密入朝進貢。

萬歷三十一年春三月戊午，吏部上奏天下郡守網員，不報。這個月，播州余賊吳洪等人叛亂，有司討伐平定了他。夏四月丁亥初一，天上日食忽氟。五月丙辰，內閣大臣奏請熱審，不報之。

戊寅，京師地震。鳳陽降大雨冰雹，詆毀皇帝陵殿脊。這個夏天，黃河在蘇家莊，北逐漸豐、沛、魚臺、單縣。秋九月十一日，江北盜賊興起。

冬季，十月十六日，停刑。丙申日，睢州賊楊思敬作亂，有司討伐并擒獲了。十一月甲子日，獲得妖書，宣帝想換太子，詔令五大搜索。十二月丙戌日，召見皇太子在啟樣宮，賜敕令安慰。

萬歷三十二年春二月二十一日，內閣大臣請求補任司道郡守和派遣巡按御史，不報。三月甲子日，乾清宮建成。乙丑，賜封楊守勤等人為進士及第、出身不等。夏四月辛巳初一，天上日食忽氟。

這個月，疏通洳河工程竣工。五月二十日，雷火焚毀長陵明樓。六月丙戌日，以陵災害，命補網官恤刑獄。丁酉，昌平大水，壞長、泰、康、昭四陵石梁。

秋季七月庚戌，京城大降，毀壞城垣。辛酉日，救濟遭受水災居民。八月辛丑，群臣伏在文華門，上疏奏請修舉實政，降旨督促。丙午，完成黃河分水工程。

九月戊申，賑濟畿南六府饑荒。閏月辛丑，武昌宗人蘊較等人叛亂，殺巡撫都御史趙可懷。冬季十月甲寅，開始敘述平定播州之功。這一年，琉球、烏斯藏入朝進貢。

萬歷三十三年春正月，重新修復京師外城。庚辰，銀定、歹成侵犯鎮番，總兵官達云將失敗的。夏四月十八日，蘊較等人被殺。五月丙申，鳳陽大風雨，毀壞陵殿神座。庚子，雷擊圜丘望燈高桿。

六月乙巳，因雷擊，命令修身反省。秋八月二十八日，停刑。（僖公三十年）九月十日，昭和殿發生火災。丙申日，京城地震。冬十一月十一日，免除淮陽遭災地區的田租。

十二月壬寅，下詔罷除天下開礦。以稅務歸有關部門，每年交納所進入的一半于內府，半戶、工二部。丙午，免河南遭災地區的田租。

乙卯日，以皇長孫出生，下詔赦免天下。開宗室科舉入仕制度。停止開采廣東珠池、云南寶井。

萬歷三十四年春二月十一日，加上了皇太后的徽號。

辛亥，大學士沈鯉、朱賡奏請補充六部主要官員，不報。三月二十四日，云南人殺掉稅監楊榮，焚燒他的尸體。丁酉，真定、順德、廣平、大名災害，賑濟不等。夏四月癸亥，完成朱旺口黃河疏通工程。五月二十日，河套部進犯延綏，官軍打退了。

六月癸卯日，緬甸攻陷木邦。這個月，畿內蝗災大起。秋七月二十日，沈一貫、沈鯉辭官。（僖公三十年）九月十日，下詔陜西嚴厲敕令邊防。冬季，十月十六日，停刑。十一月己巳，朵顏來犯，總兵官姜顯漠領兵擊退了。

十二月壬子，南京妖賊劉天緒謀反，事情敗露被處死。這一年，安南、琉球入朝進貢。蒙古喀爾喀各部歸附到了滿清那里了。

萬歷三十五年正月辛末日，給事中翁憲樣說，巡撫、按察使官解職應該等候命令，不應該讓他自己去，不報。二月戊戌日，安南賊人武德成進犯云南，總兵官沐睿擊退了。

三月十四日，賜封黃士俊等進士及第、出身不等。夏四月戊戌，銀定、歹成侵犯涼州，副總兵柴國柱將走的。壬子日，順義王撦力克死。五月二十日，前禮部尚書于慎行及禮部侍郎李廷機、南京吏部侍郎葉向高一同擔任禮部尚書兼東閣大學士，參與機要事務。

六月，湖廣以及徽、寧、太平、嚴州水災。閏月辛巳，恢復河套諸部進貢交易。秋七月二十七日，京城久雨。刑部請求發熱審疏，不報。八月丙寅日，賑濟畿內饑荒。九月甲午，停刑。

冬十月癸酉日，山東大旱饑荒，賑濟不等。十一月壬子日，于慎行死去。十二月，金沙江蠻阿克叛亂，攻陷武定，圍攻云南，別陷入嵩明、祿豐。安南賊兵進犯欽州。這一年，琉球入朝進貢。

萬歷三十六年春正月，河南、江北饑荒。二月戊辰日，京師地震。六月十五日，南畿水災。秋七月丁酉，京師地震。

郴州礦賊大起。八月癸亥日，研究云南失事有罪之臣，巡撫都御史陳用賓、總兵官淞監獄，論死刑。庚辰，賑濟南畿及嘉興、湖州饑荒。（僖公三十年）九月十日，四川巡撫都御史喬寶星奏在東川擒獲阿克，賊寇平定。

十一月二十七日，朱賡死去。十二月戊午，再次賑濟南畿，免除稅糧。這一年，琉球入朝進貢。