段天罡前往京城找周成謨報仇，不料京城四門緊閉，禁止任何人出入，直到三天之后，城門方才開啟。入城后卻得知了一個驚天動地的消息：大將軍丁獻在各大家族支持下，率領兵馬殺入皇宮，將奢渝皇陸氏一族滅絕。
皇城混亂，周氏家族戒備森嚴，甚至有數千禁軍守護。段天罡不敢輕舉妄動，只在周府之外徘徊。卻在無意之中得知，京城歐家因幫助澄羽帝對抗叛軍，慘遭滅門，就連歐景川也死于亂軍之中，歐語蝶自盡身亡。丁獻初登奢渝皇位，頒下圣旨，大赦天下，又迎娶周氏嫡女，冊封為后。
段天罡大慟，身穿孝服前往皇宮，丁獻卻避而不見，只遣近衛送來一封信：“事已至此，多說無益，你若愿意為官，暫且去驛館中耐心等待。若不愿為官，盡早離開京師，免生是非。周家已是后族，不得傷害周氏族人。”
在周家大宅外等候了五天，段天罡終于尋了個機會，斬殺了準備出門的周成謨。卻遭到周家供奉的拼死追殺，又驚動了巡街衛兵，段天罡雖然逃脫險境，卻身受重傷，為紅葉村賴子喬所救。
原來，陸子橫身死后，賴子喬執意要為他復仇。這幾日他也在周府周邊尋找機會，不想卻發現了身受重傷的段天罡，便偷偷地將其帶回了住處。
段天罡受傷頗重，賴子喬請來了濟世道門的玄通道長，在玄通的協助下，段天罡離開京城，在濟世道門中養傷。
養傷半個多月，濟世道門卻迎來了丁獻的圣旨。丁獻認為，永濟大陸各國征戰不休，奢渝國遭群狼虎視，危在旦夕。唯有朝野上下齊心合力，方有希望打敗強敵，望濟世道門上體天心，并入清虛宗，為天下蒼生謀萬世福祉。
原來，丁獻能登基為帝，背后竟有清虛宗支持。清虛宗門人弟子眾多，修為不俗，但是世俗經濟之道卻不擅長。他們早就看中了濟世道門行醫制藥之法，若能借此壟斷奢渝國醫坊、藥坊，清虛宗綿延萬載都不是問題。這道圣旨，就是丁獻與清虛宗的交易。
在濟世道門掌門法巳道長的央求下，段天罡護送濟世道門十幾名核心弟子，殺出官兵重圍，投奔昭武國寒月山。
法己道長則召集門人于祖師殿前，焚香祭祀，直言己過，宣布解散奢渝國濟世道門，任憑弟子去留。濟世道門將于昭武帝國寒月山重開山門，望各弟子門人善自珍重。言畢，法己道長服毒自盡。眾弟子大慟，當場竟有數百人圍坐于法己身前，一一服毒自盡。
段天罡等人拿著法巳道長的書信和信物，來到昭武國寒月山。濟世道門在寒月嶺疊翠峰重開山門，段天罡則拜入了寒月山。
在寒月山修習數年，段天罡修為漸深，結識了女扮男裝的楊思馥。兩人歷經無數患難，終于發現楊思馥實為女兒身，兩人之間的感情早已無比深厚。
楊思馥恢復女兒裝，向段天罡袒露了自己的身份：二十多年前，稱霸永濟大陸的永安帝國老皇駕崩，七子爭位。導致永安帝國被奢渝、燕然、昭武和北魏四大強國吞并。七皇子楊弘淵深知大勢已去，裹挾麾下六城數百萬子民，跨海北渡，在蠻荒大陸扎下根來，建立了拒安國。
拒安國建立后，向永濟大陸派遣了數千名訓練有數的種子，遍布整個永濟大陸各國，一方面挑起各國之間的戰火，另一方面發展勢力。當年栗源城所遇的楊九子，便是拒安國種子之一。
楊思馥身為楊弘淵長女，身負重返永濟大陸的重任，常年喬裝打扮，在永濟大陸中活動。因與段天罡有了感情，方才袒露了自己的真實身份，她希望段天罡能夠幫助拒安國重返永濟大陸，徹底消除永濟大陸的戰火。
段天罡知曉事情，悲痛欲絕，他最痛恨的幕后黑手，竟是自己心愛的女人！傷心之下，段天罡離開了寒月山，離開了昭武國，游走于永濟大陸各處險地，探尋古跡，旨在尋找天門禍患的真相。
在蠻荒古域的裕溪蠻族，段天罡終于找到了真相。數萬年前，永濟大陸天地靈氣極為濃郁，無數修士飛升天庭，并組建了一個十分龐大的勢力，名喚天門。天庭各界對天門極為忌憚，糾集了各族仙人，共同向天門開戰，最終，天門中的仙人被滅絕。
然而，天庭各界仍不罷休，他們派遣了大量仙人進入永濟大陸，斬斷天地靈脈，誅除將各大宗派，毀滅了各種修行功法。當他們想要毀滅永濟大陸所有生物時，卻遭遇了部分派系的抵制。多方妥協下，天庭各界在永濟大陸布置了強大的法陣，一旦發現有仙人飛升天門，必會遭遇法陣攻擊。
為限制永濟大陸修行界的發展，天庭各族還掌控了天門，并將所有結丹期以上修士全都吸收進天門中，制定了結丹期以上修士不得插手凡俗事務的規矩。
除此之外，天門還在凡俗中發展各類隱形勢力，許多傳承久遠的家族，都受天門掌控。其目的，就是要永濟大陸戰火不斷，不讓修行界有良好的成長土壤。
至于裕溪蠻族，他們是從災難中幸存下來的修行者。為了應對天門，他們組建了暗影殿，永濟大陸之所以重新萌發了修行體系，就出自于他們暗中的操控的結果。《青云錄》等功法，就是從暗影殿傳出，成為了當年永安帝國的皇家功法。至于《煉體鍛魂訣》，卻是天庭中一位仙人暗地里傳到永濟大陸的一門功法。
段天罡在裕溪蠻族中修行十年，并通過暗影殿的幫助，破壞了遍布永濟大陸各地的陣基，使天門的陣法失去作用。在即將飛升的時候，楊思馥尋到了裕溪蠻族，告訴段天罡，永濟大陸已被拒安國統一，從此大陸上不會有大的戰爭。她放棄了公主的身份，想要陪在段天罡身邊。
段天罡終于想通了，在裕溪蠻族迎娶了楊思馥。陪伴三年后，踏上了飛升之途，他要去解決天庭界的威脅。（全書完）