1968年 六十三歲

3月 林彪、江青合伙制造“楊、余、傅事件”，以“為二月逆流翻案”等罪名誣陷楊成武、傅崇碧、余立金。楊、余、傅三人被撤銷在軍隊的職務(wù)，黃永勝被任命為總參謀長、中共中央軍委辦事組組長。此后，軍委辦事組實際取代了軍委常委會。

5月1日 上午和晚上，先后在中山公園參加首都群眾慶祝五一國際勞動節(jié)游園活動，在天安門出席首都群眾慶祝五一國際勞動節(jié)聯(lián)歡晚會。

7月21日 康生為準備中共九大人事安排問題給江青寫信，信后附有他親自排列的八屆中央委員、候補中央委員分類定性名單，朱德、陳云等十八人被排在有錯誤的或歷史需要考查的一類人中。

9月4日 復信安徽省革命委員會，就所詢安徽省委常委、副省長王中的歷史情況答復說：“在莫斯科確有王中這個人，抗戰(zhàn)后他到延安工作。”“這個人我記得。是上海綢布業(yè)的一個店員。當時由莫斯科派回國內(nèi)白區(qū)工作的還有別的人，都交代他們找職業(yè)后獨立工作。因為在一九三六年時，白區(qū)黨組織的工作人員或則被捕，或則下落不明，或則撤回莫斯科。據(jù)當時在莫斯科的中共代表團估計，有組織的地下黨不多了，因而重新派回國的同志都不要與原黨員聯(lián)系，自找職業(yè)，獨立工作，以便保存力量。”

9月 自“一月風暴”以來，經(jīng)過二十個月，全國二十九個省、市、自治區(qū)全部成立了革命委員會。《人民日報》發(fā)表社論，說“整個運動已在全國范圍內(nèi)進入了斗、批、改階段”。

10月1日 出席在天安門舉行的首都軍民慶祝建國十九周年集會。

10月5日 《人民日報》在《柳河“五七”干校為機關(guān)革命化提供了新的經(jīng)驗》的報道編者按中，發(fā)表毛澤東關(guān)于干部下放勞動的指示。此后，全國各地相繼辦起“五七”干校，大批干部和知識分子下放到干校學習、勞動。

10月8日 致信周恩來，說大女兒將要生孩子，但她和丈夫在單位均無住房，為幫助他們解決產(chǎn)期的困難，請求由北京西郊的臨時住所搬回城里的北長街原住所。次日，周恩來批示有關(guān)部門辦。不久，陳云搬回家中。

10月13日—31日 出席中共八屆十二中全會。毛澤東主持會議。會議在極不正常的狀況下，通過由江青、康生等人憑偽證寫成的《關(guān)于叛徒、內(nèi)奸、工賊劉少奇罪行的審查報告》，決定把劉少奇永遠開除出黨，撤銷其黨內(nèi)外一切職務(wù)。會議還通過召開黨的九大的決定，以及《關(guān)于九大代表產(chǎn)生的決定》和《關(guān)于中國共產(chǎn)黨章程（草案）的決定》。會上，康生、江青、姚文元、謝富治等借口討論毛澤東提出的“文化大革命是否必要”的問題，在分組會上圍攻參加所謂“二月逆流”的陳毅、葉劍英、李富春、李先念、徐向前、聶榮臻等，還組織攻擊所謂“一貫右傾”的朱德、陳云、鄧子恢等。謝富治說：“陳云同志在七千人大會上，主席三次叫他講話，他說沒調(diào)查沒有發(fā)言權(quán)。后來不到一個月作了個黑報告反毛主席，反大躍進，反總路線。先念同志、富春同志那次也起了作用，應(yīng)該徹底批判。按陳云同志的報告搞下去不知成什么樣子。劉鄧、朱德、陳云都是搞修正主義的。”“劉少奇抬出陳云搞經(jīng)濟小組，收拾‘殘局’，就是搞修正主義。主席沒贊成陳云同志出來。陳云同志搞些什么，多賺錢賣花布、炒肉片、高價商品。陳云同志一貫反毛主席，休息也不干好事。這些東西都要清算。”會上，陳云被迫多次就自己解放前和建國后的所謂“路線錯誤”進行口頭及書面檢討。當講到一九六二年七千人大會毛主席要他發(fā)言而沒有發(fā)言的“錯誤”時說：主席要我在大會上發(fā)言，因為我不愿在這樣大的會議上散布我的右傾觀點，因此，沒有講。如果要講，也只能講那時的右傾觀點。又說：這種不表態(tài)，實際上是右傾機會主義的另一種表態(tài)。

11月25日 康生向毛澤東報送天津市革命委員會關(guān)于袁血卒問題的報告，并在信上攻擊說：“從附件中才曉得陳云同志又一次包庇了袁血卒，而且是在無產(chǎn)階級文化大革命運動中。”

12月22日 《人民日報》刊登的《甘肅會寧縣部分城鎮(zhèn)居民到農(nóng)村安家落戶》的報道編者按中，引述了毛澤東關(guān)于知識青年要到農(nóng)村去，接受貧下中農(nóng)再教育的最新指示。從此，在全國開展了知識青年上山下鄉(xiāng)的運動。

12月 中央?yún)⒓泳糯蟠淼拿麊魏皖A(yù)擬名單中，陳云被列入“中央委員、候補中央委員需經(jīng)討論提出并請示主席、林副主席批準才能擬作代表的名單”之中。