說下剩下劇情吧。

主角在寶可夢塔里會遇到正在吞噬鬼斯一族成長的超夢，然后展開調查。

在黃金市會發生與火箭隊的沖突，超能道館暫時關閉，格斗道館成為官方道館。

解決了這一事件，得到徽章后往新城市出發。

主角一路來到淺紅市，和捉蟲少年匯合。

捉蟲少年和主角一起進入沙湖樂園。

捉蟲少年捕獲了飛天螳螂。

主角使用在12號道路得到的厲害釣竿釣起了迷你龍，快要抓住的時候迷你龍進化成哈克龍逃走了。

主角食用了哈克龍蛻下來的皮。

在沙湖樂園終點主角得到了獎勵秘傳機沖浪術。

挑戰了淺紅道館，獲得了粉色徽章。

主角前去拜訪沙湖樂園的園長，園長的假牙又丟了，主角前往19號水路尋找，在捉蟲少年的暴鯉龍幫助下找回。

園長給予秘傳機怪力術和碎巖術作為答謝。

在淺紅市餐廳品嘗了一系列美食，吉利蛋的蛋價格昂貴，幾乎讓主角傾家蕩產。

主角在19號水路釣上一只海刺龍作為交通工具。

捉蟲少年表示自己要回去挑戰之前的道館，成為一個專業的寶可夢大師。

完全偏離了捉蟲少年的道路。

主角經過20號水路來到雙子島，遇上傳說寶可夢急凍鳥，在屬性劣勢下放棄捕獲。

在紅蓮鎮品嘗了美食。

剛想挑戰紅蓮道館，卻得到了火箭隊要綁架大木博士的消息。

主角和紅蓮道館館主夏伯一起通過21號水路，其間發現幻之寶可夢夢幻。

來到真新鎮，發現整個鎮子被發狂的寶可夢襲擊。

主角和夏伯平定了這場動亂，卻發現大木博士已經被綁架了。

在21號水路發現的夢幻給主角指明去火箭隊的道路。

通過28號道路，來到白銀山?；鸺犜谶@里修建了基地。

夏伯交給主角秘傳機閃光術。

在白銀山深處主角和夏伯發現了火焰鳥，坂木試圖用火焰鳥吸引閃電鳥和急凍鳥前來，方便他融合出一種全新的寶可夢來牟利。

一番爭斗中夏伯捕獲了虛弱的火焰鳥，從雙子島被吸引而來的急凍鳥被主角捕獲。

閃電鳥根本懶得來。

坂木想讓大木博士為其服務，大木博士拒絕了。但夏伯看到研究內容時略有心動。

夏伯說自己留下殿后，主角帶著大木博士走了。

沒多久夏伯回到了紅蓮道館，主角挑戰夏伯，發現夏伯沒有使用火焰鳥。

夏伯說火焰鳥現在在紅蓮島的上方，他并沒有去驅使火焰鳥的意思。

主角擊敗夏伯，獲得紅蓮徽章。發現夢幻也來了，但夢幻有些討厭夏伯。

主角前往常磐市挑戰道館。

寶可夢學校已經建好了，許多孩子去上學。

在常磐道館發現坂木在挑戰館主，坂木說自己已經金盆洗手了。

坂木成了一家公司的老板。寶可夢聯盟在知道坂木是火箭隊老大后依然給予默許。

坂木擊敗館主，說自己現在就是新的常磐道館館主了。館主告訴主角坂木的手續合法，現在想拿到徽章只能挑戰坂木了。

主角使用急凍鳥對抗坂木，坂木使用一只改造過的百變怪，百變怪在戰斗中能變成關東地區的任意一種寶可夢。

主角陷入劣勢。

夢幻出現對戰那只百變怪，夢幻的戰斗技巧碾壓百變怪。

主角用剩下的寶可夢對抗坂木的寶可夢，擊敗了坂木，獲得了常磐徽章。

夢幻離開了主角，心電感應告訴主角它要去一個很遠的地方。

原常磐道館館主告訴主角自己要離開關東地區。

主角攢齊了8個徽章，前往各地“品嘗”那些他還沒有吃過的寶可夢。

在10號道路，主角發現有一個無人發電廠被一只大型的鳥類寶可夢占領了。在大木博士的告知下主角知道那是傳說寶可夢閃電鳥，主角進入發電廠找到閃電鳥。

主角想捕獲閃電鳥，卻發現閃電鳥十分的懶惰，直接避開主角。

大木博士告訴主角閃電鳥有很強的領地意識，主角便開始指揮寶可夢用水淹沒發電廠的設施，閃電鳥因為供電設施被破壞憤怒。

主角用急凍鳥對戰閃電鳥，捕獲了閃電鳥，得到了閃電鳥的血液。

閃電鳥表示自己懶得和主角一起旅行，就讓它待著吧。

來到紅蓮島，發現建立了寶可夢研究所和寶可夢小屋。

坂木在寶可夢研究所用化石復活出了化石翼龍，直接問主角要不要購買。

主角沒錢，自己用之前在月見山得到的化石復活了一只寶可夢。

寶可夢小屋鎖著，不讓人進入。

主角前往紅蓮火山，向火焰鳥要了幾滴血。

夏伯詢問幾滴血有什么用，主角開玩笑的告訴他火焰鳥的血喝了能長生不老。

接下來主角前往冠軍之路，經過千辛萬苦，來到了石英高原。

擊敗了四天王，最后面對冠軍。

冠軍居然是捉蟲少年!

捉蟲少年使用飛天螳螂，暴鯉龍，風速狗，末入蛾，鐮刀盔，三地鼠。

主角被擊敗。

二周目后是主角食用了關東所有寶可夢+一只美麗花的成分，成為新的一只寶可夢。

在華藍洞窟擊敗成長期的超夢，夢幻出現帶走超夢。

寶可夢進化系統開始擴散子系統，所有人類都開始食用寶可夢的成分進化。

此時，不可思議的迷宮出現了。

世界上的人類越來越少，最后未成為寶可夢的人類被主角放置在了一個亞空間中和原世界隔絕。

全書完。