位于北美洲某處邊陲的海島之上，一間名為“澤維爾天才少年學校”，別稱“X學院”的私立學院異于往日。

公園里沒有談笑的少年，教室里沒有授課的老師，就連那位熱愛照顧植物的美夢者索尼婭也沒有出現在她心愛的小花坊里。

宛如暴風來襲前的最后征兆，整個X學院陷入了聊無人煙一般的寂靜，沒人知道這里的師生都去了哪里。

自然，躲在遠處悄悄窺視X學院的神盾局對此也一無所知。

據海島數十公里外的海...