隊友們發現何巖闖進了柯林房間，急忙趕去，將他及時拉出來。這時，何巖發現自己手上有砂礫，這砂礫看起來很尋常，但卻比地球上的早N多年。神密特工隊的人一起猜測，這巨石應該就是個傳送門，通往宇宙的另一星球，而柯林應該是回到那里或者被帶到了那里，她還有回到地球的希望。新的發現讓特工隊的同伴們迅速行動起來了。

何巖一直記著要抓回黎影的事，他打算潛入暗夜，伺機復仇。正是因為黎影那一槍，惠子為了保護自己，差點送了命。惠子也想去，但她傷還沒有全愈，何巖不想惠子再冒生命危險卷入這件事。

何巖設法找到了貝爾，他也同樣對暗夜懷有仇恨。何巖請玲子用易容術為他弄個假身份，然后打入暗夜內部。黎影正在設法奪取暗夜的權力，他帶人抓住了暗夜前領袖的兒子暗君，用各種方式逼迫他妥協。沒想到暗君并不像他想的那樣孬種，始終不肯妥協。兩人選擇了合作，重建暗夜組織，并使其發揚光大。

汪琦和隊友們，請來了神秘局的人及考古隊加入。果然，考古隊從石砂礫上發現了端倪，帶著他們，一起前往石洞查探時光巨石情況。他們趕到了何巖所說的那個石洞，找到了那處刻字的所在，緊接著，暗藏的通道被他們發現了，他們順著通道走了很久，借著手里的手電筒光線發現，他們像是來到了一所奇怪的奇異光忙的隧道，最終，他們發現了光芒后的裂口，大家猜到了這個裂口是用來時光巨石飛行的出入口。

何巖和玲子也趕到了所在地，和汪琦他們會合。大家啟動了石洞中的設備，奇異光后面裂痕忽然有了反應，發出巨大的脈沖聲，將汪琦震暈了過去。其它人卻都沒什么感覺。而何巖從中發現了辦法，汪琦可以用自己的超能力打開這條傳送裂口，何巖跳了進去，在另一端找到了柯林，并成功地救回。