冷月因越獄而被組織追殺，花雨和烈焰冒著生命的風險將他藏到亞特蘭蒂斯，這是人類新造的人工大陸，但這個大陸不被其他大洲接納。冷月在這里被一幫陌生人襲擊時，被一群黑衣人救下。黑衣人的首領先知告知了冷月的真實身世，他并不是孤兒，而是另外一個人的克隆人，他的主人曾是亞特蘭蒂斯的執政官。但他的主人被謀殺之后，亞特蘭蒂斯被人類社會生存發展委員會變成了克隆人的飼養基地。冷月肩負著拯救亞特蘭蒂斯和克隆人的使命，而與此同時，亞特蘭蒂斯上的智能機器人、克隆人、基因編輯人以及人類都將卷入這場紛爭，各方勢力相互角逐，但地球最大的危機正在向他們襲來。