知識產權侵權行為的特殊性和復雜性導致審判實務中諸如知識產權侵權訴訟時效問題、侵權案件的管轄問題、共同訴訟問題、技術事實的查明等疑難問題層出不窮。在疑難復雜案件的背后，往往存在著因法律規定的不周延、法律理解上的不充分而導致的法律適用中的困局。因此，關注知識產權審判實踐中出現的各類疑難問題，客觀、理性分析問題的成因，檢討現行法規定之不足，并著力研討解決問題的對策，不僅成為司法實務部門審判方式改革與創新的助推力，也給從事知識產權保護的理論研究者提出了一項重大課題。繼知識產權三大部門法陸續修改之后，2012年我國《民事訴訟法》也作出了重大修改。知識產權侵權訴訟中如何適用新《民事訴訟法》的規定？已有的知識產權審判中許多復雜、疑難的法律適用問題和訴訟制度的構建問題是否能夠就此得以解決？知識產權實體法規定與民事訴訟程序法規定之間如何做到更好的協調？對上述問題的正確解答使得知識產權侵權訴訟疑難問題的研究顯得愈發必要。