公元2395年，一種病原體來自克隆人的超級病毒在人類中大面積爆發，超過一百億的人口在短時間內銳減。公元2401年，劫后余生的社會被嚴重撕裂。生活在這個時代的董奇是一名頗有成就的醫生，本來擁有一個十分美滿的家庭。但那場浩劫帶走了他唯一的女兒，妻子因此而患上了嚴重的抑郁癥和臆想癥。不久幼年的克隆人女兒也離開了人世。無法面臨兩度失去孩子的打擊，妻子選擇了自殺。絕望的董奇追查病毒的根源，但追查過程中也意外身亡。意外重生的他，最終揭開了真相。原來超級病毒爆發后，人類早已滅亡。董奇出生于人類滅絕后的300年，此時的“人類”其實都是克隆人。社會的各個角落都充斥著人工智能，首腦是自我意識蘇醒的人工智能“塵埃”。地球上的克隆人都是“塵埃”基于基因庫中的基因孵化的，社會結構則是完全按照人類最后第六次文明的原樣精確復制而成。“塵埃”之所以這樣做，與它的來歷存在著密切聯系。經過長時間進化的“塵埃”產生了復雜的情感，進化之路也變得不同起來。克隆人和人工智能都已覺醒，等待他們的，是一個充滿未知的未來。