隨著探索隊與未知文明在各個領域合作的深入，雙方意識到有必要構建一個全新的星際聯盟新秩序，以更好地規范彼此的合作關系，共同應對宇宙中的各種挑戰，促進星際文明的繁榮發展。

首先，雙方共同制定了一套全面的聯盟章程。章程明確了聯盟的宗旨和目標，即維護宇宙和平、促進文明交流與合作、共同探索宇宙奧秘以及應對各種宇宙威脅。在組織架構方面，設立了聯盟理事會，由探索隊代表（來自星際共同體各主要文明）和未知文明的代表共同組成。理事會負責制定聯盟的重大決策、協調各方資源以及處理聯盟內部的糾紛和問題。為了確保決策的公平性和科學性，理事會采用民主投票的方式進行決策，每個代表都擁有平等的投票權。

在資源分配方面，建立了公平合理的機制。根據各文明在聯盟中的貢獻、需求以及發展階段，對宇宙資源進行合理分配。對于共同開展的科研項目、建設項目等，按照各方投入的資源比例分享成果和利益。同時，設立資源監督委員會，負責監督資源的分配和使用情況，確保資源不被濫用，真正用于聯盟的發展和共同利益。

在安全保障方面，雙方組建了聯合防御部隊。這支部隊由探索隊和未知文明的精英戰士組成，配備了雙方最先進的武器裝備和防御系統。聯合防御部隊的任務是保護聯盟成員免受外部威脅，包括來自其他未知文明的侵略、宇宙海盜的襲擊以及各種宇宙災害。為了提高部隊的戰斗力和協同作戰能力，定期進行聯合軍事演習和訓練，加強彼此之間的默契和配合。

此外，還制定了文化交流與融合的促進機制。鼓勵雙方文明之間的人員往來、藝術創作交流、學術研討等活動。設立文化交流基金，支持各種文化交流項目的開展。通過文化交流，增進雙方文明之間的相互了解和信任，共同培育一種包容、多元的星際聯盟文化。通過構建這一系列完善的星際聯盟新秩序，探索隊與未知文明為未來的合作與發展奠定了堅實的基礎，開啟了星際文明攜手共進的新篇章。