“人生就像一場旅行，每個人都是慢慢路途中的旅客，你不知道沿途會遇見誰，會發生些什么，或許連目的地在哪里也不清楚，但與它們彼此邂逅，又在冥冥之中彼此交錯、結成羈絆……這些，我從未后悔！”

曾經平定了世界紛爭、君臨數碼世界的“中央皇帝”黃龍獸，卻在建立“神之領域”與“防火墻”之后消失了蹤影，本應由其所統治著、守護數碼世界東西南北的四圣獸，開始爭奪霸權而發動了戰爭……

一個人類少年偶然間觸碰了一塊金黃色的鱗片，從而進入了這個光怪陸離的世界，還擁有了能夠和數碼獸一樣進行“進化（Evolution）”的力量，他將會在數碼世界擁有怎樣的經歷……